RG
Roger Glass
Author with expertise in Gastrointestinal Viral Infections and Vaccines Development
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
20
(75% Open Access)
Cited by:
15,403
h-index:
114
/
i10-index:
412
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Social capital and self-rated health: a contextual analysis.

Ichiro Kawachi et al.Aug 1, 1999
OBJECTIVES: Social capital consists of features of social organization--such as trust between citizens, norms of reciprocity, and group membership--that facilitate collective action. This article reports a contextual analysis of social capital and individual self-rated health, with adjustment for individual household income, health behaviors, and other covariates. METHODS: Self-rated health ("Is your overall health excellent, very good, good, fair, or poor?") was assessed among 167,259 individuals residing in 39 US states, sampled by the Behavioral Risk Factor Surveillance System. Social capital indicators, aggregated to the state level, were obtained from the General Social Surveys. RESULTS: Individual-level factors (e.g., low income, low education, smoking) were strongly associated with self-rated poor health. However, even after adjustment for these proximal variables, a contextual effect of low social capital on risk of self-rated poor health was found. For example, the odds ratio for fair or poor health associated with living in areas with the lowest levels of social trust was 1.41 (95% confidence interval = 1.33, 1.50) compared with living in high-trust states. CONCLUSIONS: These results extend previous findings on the health advantages stemming from social capital.
0

Polymerase chain reaction amplification and typing of rotavirus nucleic acid from stool specimens

Vera Gouvêa et al.Feb 1, 1990
The rotavirus gene segment coding for the major outer capsid glycoprotein vp7 was amplified directly from stool specimens by the polymerase chain reaction (PCR). Double-stranded RNA extracted from stool samples was used as the template for reverse transcription, which was followed immediately and in the same reaction mix with amplification, using the Taq polymerase. Various conditions were examined to optimize the yield of the amplified gene. The concentrations of MgCl2, dimethyl sulfoxide, and template RNA were critical. The choice of primer pairs allowed amplification of the entire segment or specific portions. By using type-specific primers derived from distinct regions on the gene, we devised a PCR typing method in which each human serotype virus produced a characteristic segment size, readily identifiable in agarose gels. The PCR typing method was applied to 10 rotavirus reference strains, including all 6 known human serotypes (serotypes 1, 2, 3, 4, 8, and 9), and to 34 stool specimens previously serotyped by an enzyme immunoassay with monoclonal antibodies. An absolute correlation was found between the molecular and serologic methods. In addition, 14 stool specimens nonserotypable by an enzyme immunoassay with monoclonal antibodies could be typed by the PCR method. Besides the application for rotavirus detection and typing directly from stools, the PCR method provides a rapid and efficient means of obtaining large quantities of cDNA suitable for sequencing, cloning, and other genetic studies, precluding the need for cell culture and virus purification.
0
Citation1,542
0
Save
0

Identification of group A rotavirus gene 4 types by polymerase chain reaction

Jon Gentsch et al.Jun 1, 1992
Five genetically distinct human rotavirus (HRV) gene 4 groups have been described on the basis of comparative nucleotide sequencing and the predicted amino acid sequences, and at least four of them represent distinct VP4 antigenic types. To identify each gene 4 type and investigate its distribution in HRV isolates from patients with diarrhea, we developed a polymerase chain reaction (PCR) typing method using sequence information available for four genetically distinct gene 4 types. Rotavirus double-stranded RNAs (dsRNAs) isolated from stool samples were first reverse transcribed and amplified by PCR by using two oligonucleotide primers that correspond to regions that are highly conserved among all known HRV gene 4 types. The 876-bp dsDNA products were then reamplified by PCR in the presence of a cocktail containing one conserved plus-sense primer and four type-specific minus-sense primers (selected from the hypervariable region of gene 4), resulting in products of 345, 483, 267, and 391 bp corresponding to gene 4 types 1, 2, 3, and 4, respectively. This method reliably identified the gene 4 types of 16 well-characterized HRV isolates. Our results were independently confirmed for all 16 strains by reverse transcription and PCR amplification of HRV dsRNA in the presence of alternate type-specific primer pairs. For direct gene 4 typing of HRV in stool samples, we developed a method to extract rotavirus dsRNA from stool specimens by using glass powder. Our results suggest that gene 4 typing will be useful in providing more a complete characterization of HRV strains of epidemiologic or vaccine-related interest.
0
Citation1,372
0
Save
0

Norovirus classification and proposed strain nomenclature

Du-Ping Zheng et al.Dec 16, 2005
Without a virus culture system, genetic analysis becomes the principal method to classify norovirus (NoV) strains. Currently, classification of NoV strains beneath the species level has been based on sequences from different regions of the viral genome. As a result, the phylogenetic insights of some virus were not appropriately interpreted, and no consensus has been reached to establish a uniform classification scheme. To provide a consistent and reliable scientific basis for classifying NoVs, we analyzed the amino acid sequences for the major capsid protein of 164 NoV strains by first using an alignment based on the predicted 3D structures. A Bayesian tree was generated, and the maximum likelihood pairwise distances of the aligned sequences were used to evaluate the results from the uncorrected pairwise distance method. Analyses of the pairwise distances demonstrated three clearly resolved peaks, suggesting that NoV strains beneath the species level can be classified at three levels: strain (S), cluster (C), and genogroup (G). The uncorrected pairwise distance ranges for S, C, and G were 0-14.1%, 14.3-43.8%, and 44.9-61.4%, respectively. A scheme with 29 genetic clusters [8 in genogroup 1 (G1), 17 in G2, 2 in G3, and 1 each in G4 and G5] was defined on the basis of the tree topology with the standards provided and was supported by the distance analysis. Of these, five clusters in G2 and one in G1 are newly described. This analysis can serve as the basis for a standardized nomenclature to genetically describe NoV strains.
0
Citation1,078
0
Save
0

Managing Acute Gastroenteritis Among Children: Oral Rehydration, Maintenance, and Nutritional Therapy

Caleb King et al.Jan 1, 2003
Acute gastroenteritis remains a common illness among infants and children throughout the world. Among children in the United States, acute diarrhea accounts for >1.5 million outpatient visits, 200,000 hospitalizations, and approximately 300 deaths/year. In developing countries, diarrhea is a common cause of mortality among children aged <5 years, with an estimated 2 million deaths annually. Oral rehydration therapy (ORT) includes rehydration and maintenance fluids with oral rehydration solutions (ORS), combined with continued age-appropriate nutrition. Although ORT has been instrumental in improving health outcomes among children in developing countries, its use has lagged behind in the United States. This report provides a review of the historical background and physiologic basis for using ORT and provides recommendations for assessing and managing children with acute diarrhea, including those who have become dehydrated. Recent developments in the science of gastroenteritis management have substantially altered case management. Physicians now recognize that zinc supplementation can reduce the incidence and severity of diarrheal disease, and an ORS of reduced osmolarity (i.e., proportionally reduced concentrations of sodium and glucose) has been developed for global use. The combination of oral rehydration and early nutritional support has proven effective throughout the world in treating acute diarrhea. In 1992, CDC prepared the first national guidelines for managing childhood diarrhea (CDC. The management of acute diarrhea in children: oral rehydration, maintenance, and nutritional therapy. MMWR 1992;41[No. RR-16]), and this report updates those recommendations. This report reviews the historical background and scientific basis of ORT and provides a framework for assessing and treating infants and children who have acute diarrhea. The discussion focuses on common clinical scenarios and traditional practices, especially regarding continued feeding. Limitations of ORT, ongoing research in the areas of micronutrient supplements, and functional foods are reviewed as well. These updated recommendations were developed by specialists in managing gastroenteritis, in consultation with CDC and external consultants. Relevant literature was identified through an extensive MEDLINE search by using related terms. Articles were then reviewed for their relevance to pediatric practice, with emphasis on U.S. populations. Unpublished references were sought from the external consultants and other researchers. In the United States, adoption of these updated recommendations could substantially reduce medical costs and childhood hospitalizations and deaths caused by diarrhea.
Load More