The Loeys–Dietz syndrome is a recently described autosomal dominant aortic-aneurysm syndrome with widespread systemic involvement. The disease is characterized by the triad of arterial tortuosity and aneurysms, hypertelorism, and bifid uvula or cleft palate and is caused by heterozygous mutations in the genes encoding transforming growth factor β receptors 1 and 2 (TGFBR1 and TGFBR2, respectively).

Summary

Background

 Evidence for the comparative teratogenic risk of antiepileptic drugs is insufficient, particularly in relation to the dosage used. Therefore, we aimed to compare the occurrence of major congenital malformations following prenatal exposure to the eight most commonly used antiepileptic drugs in monotherapy. 

Methods

 We did a longitudinal, prospective cohort study based on the EURAP international registry. We included data from pregnancies in women who were exposed to antiepileptic drug monotherapy at conception, prospectively identified from 42 countries contributing to EURAP. Follow-up data were obtained after each trimester, at birth, and 1 year after birth. The primary objective was to compare the risk of major congenital malformations assessed at 1 year after birth in offspring exposed prenatally to one of eight commonly used antiepileptic drugs (carbamazepine, lamotrigine, levetiracetam, oxcarbazepine, phenobarbital, phenytoin, topiramate, and valproate) and, whenever a dose dependency was identified, to compare the risks at different dose ranges. Logistic regression was used to make direct comparisons between treatments after adjustment for potential confounders and prognostic factors. 

Findings

 Between June 20, 1999, and May 20, 2016, 7555 prospective pregnancies met the eligibility criteria. Of those eligible, 7355 pregnancies were exposed to one of the eight antiepileptic drugs for which the prevalence of major congenital malformations was 142 (10·3%) of 1381 pregnancies for valproate, 19 (6·5%) of 294 for phenobarbital, eight (6·4%) of 125 for phenytoin, 107 (5·5%) of 1957 for carbamazepine, six (3·9%) of 152 for topiramate, ten (3·0%) of 333 for oxcarbazepine, 74 (2·9%) of 2514 for lamotrigine, and 17 (2·8%) of 599 for levetiracetam. The prevalence of major congenital malformations increased with the dose at time of conception for carbamazepine (p=0·0140), lamotrigine (p=0·0145), phenobarbital (p=0·0390), and valproate (p<0·0001). After adjustment, multivariable analysis showed that the prevalence of major congenital malformations was significantly higher for all doses of carbamazepine and valproate as well as for phenobarbital at doses of more than 80 mg/day than for lamotrigine at doses of 325 mg/day or less. Valproate at doses of 650 mg/day or less was also associated with increased risk of major congenital malformations compared with levetiracetam at doses of 250–4000 mg/day (odds ratio [OR] 2·43, 95% CI 1·30–4·55; p=0·0069). Carbamazepine at doses of more than 700 mg/day was associated with increased risk of major congenital malformations compared with levetiracetam at doses of 250–4000 mg/day (OR 2·41, 95% CI 1·33–4·38; p=0·0055) and oxcarbazepine at doses of 75–4500 mg/day (2·37, 1·17–4·80; p=0·0169). 

Interpretation

 Different antiepileptic drugs and dosages have different teratogenic risks. Risks of major congenital malformation associated with lamotrigine, levetiracetam, and oxcarbazepine were within the range reported in the literature for offspring unexposed to antiepileptic drugs. These findings facilitate rational selection of these drugs, taking into account comparative risks associated with treatment alternatives. Data for topiramate and phenytoin should be interpreted cautiously because of the small number of exposures in this study. 

Funding

 Bial, Eisai, GlaxoSmithKline, Janssen-Cilag, Novartis, Pfizer, Sanofi-Aventis, UCB, the Netherlands Epilepsy Foundation, and Stockholm County Council.

Noonan, LEOPARD, and cardiofaciocutaneous syndromes (NS, LS, and CFCS) are developmental disorders with overlapping features including distinctive facial dysmorphia, reduced growth, cardiac defects, skeletal and ectodermal anomalies, and variable cognitive deficits. Dysregulated RAS-mitogen-activated protein kinase (MAPK) signal traffic has been established to represent the molecular pathogenic cause underlying these conditions. To investigate the phenotypic spectrum and molecular diversity of germline mutations affecting BRAF, which encodes a serine/threonine kinase functioning as a RAS effector frequently mutated in CFCS, subjects with a diagnosis of NS (N=270), LS (N=6), and CFCS (N=33), and no mutation in PTPN11, SOS1, KRAS, RAF1, MEK1, or MEK2, were screened for the entire coding sequence of the gene. Besides the expected high prevalence of mutations observed among CFCS patients (52%), a de novo heterozygous missense change was identified in one subject with LS (17%) and five individuals with NS (1.9%). Mutations mapped to multiple protein domains and largely did not overlap with cancer-associated defects. NS-causing mutations had not been documented in CFCS, suggesting that the phenotypes arising from germline BRAF defects might be allele specific. Selected mutant BRAF proteins promoted variable gain of function of the kinase, but appeared less activating compared to the recurrent cancer-associated p.Val600Glu mutant. Our findings provide evidence for a wide phenotypic diversity associated with mutations affecting BRAF, and occurrence of a clinical continuum associated with these molecular lesions.

ABSTRACT Background Repeat expansion (RE) disorders affect ~1 in 3000 individuals and are clinically heterogeneous diseases caused by expansions of short tandem DNA repeats. Genetic testing is often locus-specific, resulting in under diagnosis of atypical clinical presentations, especially in paediatric patients without a prior positive family history. Whole genome sequencing (WGS) is emerging as a first-line test for rare genetic disorders, but until recently REs were thought to be undetectable by this approach. Methods WGS pipelines for RE disorder detection were deployed by the 100,000 Genomes Project and Illumina Clinical Services Laboratory. Performance was retrospectively assessed across the 13 most common neurological RE loci using 793 samples with prior orthogonal testing (182 with expanded alleles and 611 with alleles within normal size) and prospectively interrogated in 13,331 patients with suspected genetic neurological disorders. Findings WGS RE detection showed minimum 97·3% sensitivity and 99·6% specificity across all 13 disease-associated loci. Applying the pipeline to patients from the 100,000 Genomes Project identified pathogenic repeat expansions which were confirmed in 69 patients, including seven paediatric patients with no reported family history of RE disorders, with a 0.09% false positive rate. Interpretation We show here for the first time that WGS enables the detection of causative repeat expansions with high sensitivity and specificity, and that it can be used to resolve previously undiagnosed neurological disorders. This includes children with no prior suspicion of a RE disorder. These findings are leading to diagnostic implementation of this analytical pipeline in the NHS Genomic Medicine Centres in England. Funding Medical Research Council, Department of Health and Social Care, National Health Service England, National Institute for Health Research, Illumina Inc

Immune dysregulation in Inborn Errors of Immunity (IEI) shows a broad phenotype, including autoimmune disorders, benign lymphoproliferation, and malignancies, driven by an increasing number of implicated genes. Recent findings suggest that childhood cancer survivors (CCSs) may exhibit immunological abnormalities potentially linked to an underlying IEI, along with a well-known increased risk of subsequent malignancies due to prior cancer treatments. We describe a patient with two composite heterozygous pathogenic variants in the interleukin-2-inducible T-cell kinase (