The assessment of quality of life (QoL) should be one of the main objectives in paediatric clinical trials. Even though researchers, regulators and advocates support the use of patient-reported outcomes (PROs), this has not been fully implemented. The aim of this study is to assess the measurement of QoL and the usage of PROs, palatability assessments and medication diaries in early-phase clinical trials for childhood and adolescent cancer.

Abstract BACKGROUND Half of patients with Neurofibromatosis type 1 (NF1) develop plexiform neurofibromas (PNs). PNs may grow during childhood causing significant complications, including pain, functional impairment, and disfigurement. Treatment options are limited, given their tendency to regrow following surgery and their propensity to transform into malignant tumors following radiation. Selumetinib is an oral selective inhibitor of RAS-mitogen activated protein kinase (MAPK) 1 and 2, which has shown efficacy for tumor shrinkage/ stabilisation and symptom improvement. METHODS Single-institution retrospective review of patients with NF1 treated with selumetinib for symptomatic PNs between 2020 and 2023. Clinical data were abstracted from medical records. Treatment consisted of selumetinib 25 mg/m2 BID. Patient follow-up included monthly complete physical examination, evaluation of treatment adherence, blood analysis, echocardiogram, ophthalmologic assessment every 3 months, and MRI every 6 months. Response evaluation criteria in solid tumors (RECIST) was used for assessment. RESULTS Ten patients were treated with selumetinib during the period indicated. Mean age 13.9 years (range 7-21). Predominant target locations were head and neck (60%), and abdomen-pelvis (30%). The most important comorbidities were disfigurement (50%) and pain (50%). The mean follow-up time was 519 days (range 45–1460). None of the patients presented grade 3-4 toxicities; all of them had associated grade 1-2 skin toxicity. None presented cardiac or ophthalmologic alterations. All the patients with pain had sustained clinical improvement in the first 35–60 days of treatment. At one year of treatment 6/8 patients showed stable disease and 2/8 partial response on MRI. In one patient, treatment was discontinued after 270 days (lack of clear benefit).Another patient has not reached one year of therapy yet. CONCLUSIONS In this study we expose that selumetinib for symptomatic, inoperable plexiform neurofibromas in NF1 was associated with clinical and radiological response. Our study also confirms the safety and good tolerance of this drug.

Abstract The EPICO (Spanish general registry of COVID‐19 in children)‐SEHOP (Spanish Society of Pediatric Hematology and Oncology) platform gathers data from children with SARS‐CoV‐2 in Spain, allowing comparison between children with cancer or allogeneic hematopoietic stem cell transplantation (alloHSCT) and those without. The infection is milder in the cancer/alloHSCT group than in children without comorbidities (7.1% vs. 14.7%), except in children with recent alloHSCT (less than 300 days), of which 35.7% experienced severe COVID‐19. These data have been shared with the SEHOP members to support treatment and isolation policies akin to those for children without cancer, except for those with recent alloHSCT or additional comorbidities. This highlights the collaborative registries potential in managing pandemic emergencies.

The nucleosome remodeling factor BPTF is required for the deployment of the MYC-driven transcriptional program. Deletion of one

Abstract The identification of novel therapeutic targets for specific cancer molecular subtypes is crucial for the development of precision oncology. In the last years, CRISPR/Cas9 screens have accelerated the discovery and validation of new targets associated with different tumor types, mutations or fusions. However, there are still many cancer vulnerabilities associated with specific molecular features that remain to be explored. Here we used data from CRISPR/Cas9 screens in 954 cancer cell lines to identify gene dependencies associated with 16 common cancer genomic amplifications. We found that high-copy number genomic amplifications generate multiple collateral dependencies within the amplified region in 94% of cases. Further, to prioritize candidate targets for each chromosomal region amplified, we integrated gene dependency parameters with both druggability data and subcellular location. Finally, analysis of the relationship between gene expression and gene dependency leads to the identification of genes, the expression of which may constitute predictive biomarkers of dependency.

Abstract Background Epigenetic programming during development is essential for determining cell lineages, and alterations in this programming contribute to the initiation of embryonal tumour development. In neuroblastoma, neural crest progenitors block their course of natural differentiation into sympathoadrenergic cells, leading to the development of aggressive and metastatic paediatric cancer. Research of the epigenetic regulators responsible for oncogenic epigenomic networks is crucial for developing new epigenetic-based therapies against these tumours. Mammalian switch/sucrose non-fermenting (mSWI/SNF) ATP-dependent chromatin remodelling complexes act genome-wide translating epigenetic signals into open chromatin states. The present study aimed to understand the contribution of mSWI/SNF to the oncogenic epigenomes of neuroblastoma and its potential as a therapeutic target. Methods Functional characterisation of the mSWI/SNF complexes was performed in neuroblastoma cells using proteomic approaches, loss-of-function experiments, transcriptome and chromatin accessibility analyses, and in vitro and in vivo assays. Results Neuroblastoma cells contain three main mSWI/SNF subtypes, but only BRG1-associated factor (BAF) complex disruption through silencing of its key structural subunits, ARID1A and ARID1B, impairs cell proliferation by promoting cell cycle blockade. Genome-wide chromatin remodelling and transcriptomic analyses revealed that BAF disruption results in the epigenetic repression of an extensive invasiveness-related expression program involving integrins, cadherins, and key mesenchymal regulators, thereby reducing adhesion to the extracellular matrix and the subsequent invasion in vitro and drastically inhibiting the initiation and growth of neuroblastoma metastasis in vivo . Conclusions We report a novel ATPase-independent role for the BAF complex in maintaining an epigenomic program that allows neuroblastoma invasiveness and metastasis, urging for the development of new BAF pharmacological structural disruptors for therapeutic exploitation in metastatic neuroblastoma.

The implementation of personalised medicine in childhood cancers has been limited by a lack of clinically validated multi-target sequencing approaches specific for paediatric solid tumours. In order to support innovative clinical trials in high-risk patients with unmet need, we have developed a clinically relevant targeted sequencing panel spanning 311 kb and comprising 78 genes involved in childhood cancers. A total of 132 samples were used for the validation of the panel, including Horizon Discovery cell blends (n=4), cell lines (n=15), formalin-fixed paraffin embedded (FFPE, n=83) and fresh frozen tissue (FF, n=30) patient samples. Cell blends containing known single nucleotide variants (SNVs, n=528) and small insertion-deletions (indels n=108) were used to define panel sensitivities of ≥98% for SNVs and ≥83% for indels [95% CI] and panel specificity of ≥98% [95% CI] for SNVs. FFPE samples performed comparably to FF samples (n=15 paired). Of 95 well-characterised genetic abnormalities in 33 clinical specimens and 13 cell lines (including SNVs, indels, amplifications, rearrangements and chromosome losses), 94 (98.9%) were detected by our approach. We have validated a robust and practical methodology to guide clinical management of children with solid tumours based on their molecular profiles. Our work demonstrates the value of targeted gene sequencing in the development of precision medicine strategies in paediatric oncology.

Background: Rhabdomyosarcoma (RMS), such as other childhood tumors, has witnessed treatment advancements in recent years. However, high-risk patients continue to face poor survival rates, often attributed to the presence of the PAX3/7-FOXO1 fusion proteins, which has been associated with metastasis and treatment resistance. Despite efforts to directly target these chimeric proteins, clinical success remains elusive. In this study, the main aim was to address this challenge by investigating regulators of FOXO1. Specifically, we focused on TRIB3, a potential regulator of the fusion protein in RMS. Methods: TRIB3 expression was examined through the analysis of patient datasets, including gene expression profiling and gene set enrichment analyses. In cell lines, the DepMap dataset for RMS was utilized alongside Western blot analysis to assess TRIB3 expression. The functional significance of TRIB3 in RMS was assessed through constitutive and inducible shRNA-mediated knockdowns. Subsequent in vitro and in vivo analyses, including orthotopic tumor models in immune-compromised mice, were conducted to delineate the role and underlying molecular mechanisms exerted by TRIB3 in RMS Results: Our findings revealed a prominent TRIB3 expression in RMS tumors, highlighting its correlation with several clinical features. By conducting TRIB3 genetic inhibition experiments, we observed an impairment on cell proliferation. Notably, the knockdown of TRIB3 led to a decrease in PAX3-FOXO1 and its target genes at protein level, accompanied by a reduction in the activity of the Akt signaling pathway. Furthermore, TRIB3 influenced posttranslational modifications, such as phosphorylation together with proteasomal degradation of PAX3-FOXO1 protein. Additionally, inducible silencing of TRIB3 significantly delayed tumor growth and improved overall survival in vivo. Conclusions: Based on our comprehensive analysis, we propose that TRIB3 holds therapeutic potential for treating the most aggressive subtype of RMS. The findings herein reported contribute to our understanding of the underlying molecular mechanisms driving RMS progression and provide novel insights into the potential use of TRIB3 as a therapeutic intervention for high-risk RMS patients.