Cutaneous squamous-cell carcinomas and keratoacanthomas are common findings in patients treated with BRAF inhibitors.

Purpose To determine the dose-limiting toxicity and maximum-tolerated dose of the proteasome inhibitor bortezomib administered intravenously weekly for 4 every 5 weeks; to determine the bortezomib pharmacokinetics and pharmacodynamics using plasma levels and an assay for 20S proteasome inhibition (PI) in whole blood; to correlate toxicity with bortezomib dose and degree of 20S PI; and to conduct a preliminary determination of the antitumor activity of bortezomib in patients with androgen independent prostate cancer (AIPCa). Patients and Methods Fifty-three patients (48 with AIPCa) received 128 cycles of bortezomib in doses ranging from 0.13 to 2.0 mg/m 2 /dose, utilizing a careful escalation scheme with a continuous reassessment method. Pharmacokinetic and pharmacodynamic studies were performed in 24 patients (at 1.45 to 2.0 mg/m 2 ). Results A dose-related 20S PI was seen, with dose-limiting toxicity at 2.0 mg/m 2 (diarrhea, hypotension) occurring at an average 1-hour post-dose of ≥ 75% 20S PI. Other side effects were fatigue, hypertension, constipation, nausea, and vomiting. No relationship was seen between body-surface area and bortezomib clearance over the narrow dose range tested. There was evidence of biologic activity (decline in serum prostate-specific antigen and interleukin-6 levels) at ≥ 50% 20S PI. Two patients with AIPCa had prostate-specific antigen response and two patients had partial response in lymph nodes. Conclusion The maximum-tolerated dose and recommended phase II dose of bortezomib in this schedule is 1.6 mg/m 2 . Biologic activity (inhibition of nuclear factor-kappa B-related markers) and antitumor activity is seen in AIPCa at tolerated doses of bortezomib. This agent should be further explored with chemotherapy agents in advanced prostate cancer.

The BRAF(V600E) mutation is common in several human cancers, especially melanoma. RG7204 (PLX4032) is a small-molecule inhibitor of BRAF(V600E) kinase activity that is in phase II and phase III clinical testing. Here, we report a preclinical characterization of the antitumor activity of RG7204 using established in vitro and in vivo models of malignant melanoma. RG7204 potently inhibited proliferation and mitogen-activated protein/extracellular signal-regulated kinase (ERK) kinase and ERK phosphorylation in a panel of tumor cell lines, including melanoma cell lines expressing BRAF(V600E) or other mutant BRAF proteins altered at codon 600. In contrast, RG7204 lacked activity in cell lines that express wild-type BRAF or non-V600 mutations. In several tumor xenograft models of BRAF(V600E)-expressing melanoma, we found that RG7204 treatment caused partial or complete tumor regressions and improved animal survival, in a dose-dependent manner. There was no toxicity observed in any dose group in any of the in vivo models tested. Our findings offer evidence of the potent antitumor activity of RG7204 against melanomas harboring the mutant BRAF(V600E) gene.

Hypoxia is an important factor in the adaptation of tumor cells to their environment, contributes to their malignant progression, and affects tumor prognosis and drug sensitivity. Although there is a wealth of transcriptomic data stored in public databases, there is a lack of web-based tools for analyzing these data to explore the link between hypoxia and the mechanisms of tumorigenesis and progression. To this end, we have developed an interactive web-based tool called THER, which is designed to help users easily identify potential targets, mechanisms of action and effective drugs for treating hypoxic tumors. THER integrates 63 transcriptomic tumor hypoxia datasets from the Gene Expression Omnibus (GEO) database, covering 3 species, 18 tumor types and 42 cell line types. This web tool provides five modules that allow users to perform differential expression analysis, expression profiling analysis, correlation analysis, enrichment analysis and drug sensitivity analysis on different datasets based on different oxygen statuses. We expect that users will be able to use the tool to identify valuable biomarkers, further reveal the molecular mechanisms of tumor hypoxia, and identify effective drugs, thus providing a scientific basis for tumor diagnosis and treatment. THER is open to all users and can be accessed without login at https://smuonco.shinyapps.io/THER/.

Bacteria in the chlamydiales order are obligate intracellular parasites of eukaryotic cells. Within this order, the genus Chlamydia contains the causative agents of a number of clinically important infections of humans. Biovars of C. trachomatis are the causative agents of trachoma, the leading cause of preventable blindness worldwide, as well as sexually transmitted infections with the potential to cause pelvic inflammatory disease and infertility. Irrespective of the resulting disease, all chlamydial species share the same obligate intracellular life cycle and developmental cell forms. They are reliant on an infectious cycle consisting of at least three phenotypically distinct cell forms termed the reticulate body (RB), the intermediate body (IB) and the elementary body (EB). The EB is infectious but does not replicate. The RB replicates in the host cell but is non-infectious, while the IB is an intermediate form that transitions to the EB form. In this study, we ectopically expressed the transcriptional repressor Euo, the two nucleoid-associated proteins HctA and HctB, and the two component sensor kinase CtcB in the RB. Transcriptional analysis using RNA-seq, differential expression clustering and fluorescence in situ hybridization analysis show that the chlamydial developmental cycle is driven by three distinct regulons corresponding to the RB, IB or EB cell forms. Moreover, we show that the genes for the T3SS were cell type restricted, suggesting defined functional roles for the T3SS in specific cell forms.

Abstract Bacteria in the genus Chlamydia are a significant health burden world wide. They infect a wide range of vertebrate animals including humans and domesticated animals. In humans, C. psittaci can cause zoonotic pneumonia while C. pneumoniae causes a variety of respiratory infections. Infections with C. trachomatis cause ocular or genital infections. All chlamydial species are obligate intracellular parasites of eukaryotic cells and are dependent on a complex infection cycle that depends on transitions between specific cell forms. This cycle consists of cell forms specialized for host cell invasion, the Elementary Body (EB), and a form specialized for intracellular replication, the Reticulate Body (RB). In addition to the EB and RB there is a transitionary cell form that mediates the transformation between the RB and the EB, the Intermediate Body (IB). In this study we ectopically expressed the regulatory protein Euo and showed that high levels of expression resulted in reversible arrest of the development cycle. The arrested chlamydial cells were trapped phenotypically at an early IB stage of the cycle. These cells had exited the cell cycle but had not shifted gene expression from RB-like to IB/EB-like. This arrested state was dependent on continued expression of Euo. When ectopic expression was reversed, Euo levels dropped in the arrested cells which led to the repression of native Euo expression and the resumption of the developmental cycle. Our data are consistent with a model where Euo expression levels impact IB maturation to the infectious EB but not the production of the IB form. Importance Bacterial species in the Chlamydiales order infect a variety of vertebrate animals and are a global health concern. They cause various diseases in humans, including genitital and respiratory infections. The bacteria are obligate intracellular parasites that rely on a complex infectious cycle involving multiple cell forms. All species share the same life cycle, transitioning through different states to form the infectious elementary body (EB) to spread infections to new hosts. The Euo gene, encoding a DNA binding protein, is involved in regulating this cycle. This study showed that ectopic expression of Euo halted the cycle at an early stage. This arrest depended on continued Euo expression. When Euo expression was reversed, the developmental cycle resumed. Additionally, this study suggests that high levels of Euo expression affects the formation of the infectious EB, but not the production of the cell form committed to EB formation.