PK
Paul Kim
Author with expertise in MicroRNA Regulation in Cancer and Development
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
5
(80% Open Access)
Cited by:
335
h-index:
37
/
i10-index:
101
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Genetic regulation of microRNAs in the older adult brain and their contribution to neuropsychiatric conditions

Selina Vattathil et al.Sep 12, 2024
MicroRNAs are essential post-transcriptional regulators of gene expression and involved in many biological processes; however, our understanding of their genetic regulation and role in brain illnesses is limited. Here, we mapped brain microRNA expression quantitative trait loci (miR-QTLs) using genome-wide small RNA sequencing profiles from dorsolateral prefrontal cortex (dlPFC) samples of 604 older adult donors of European ancestry. miR-QTLs were identified for 224 miRNAs (48% of 470 tested miRNAs) at false discovery rate < 1%. We found that miR-QTLs were enriched in brain promoters and enhancers, and that intragenic miRNAs often did not share QTLs with their host gene. Additionally, we integrated the brain miR-QTLs with results from 16 GWAS of psychiatric and neurodegenerative diseases using multiple independent integration approaches and identified four miRNAs that contribute to the pathogenesis of bipolar disorder, major depression, post-traumatic stress disorder, schizophrenia, and Parkinson's disease. This study provides novel insights into the contribution of miRNAs to the complex biological networks that link genetic variation to disease.
0

Mapping the microRNA landscape in the older adult brain and its genetic contribution to neuropsychiatric conditions

Selina Vattathil et al.Dec 6, 2024
Abstract MicroRNAs (miRNAs) play a crucial role in regulating gene expression and influence many biological processes. Despite their importance, understanding of how genetic variation affects miRNA expression in the brain and how this relates to brain disorders remains limited. Here we investigated these questions by identifying microRNA expression quantitative trait loci (miR-QTLs), or genetic variants associated with brain miRNA levels, using genome-wide small RNA sequencing profiles from dorsolateral prefrontal cortex samples of 604 older adult donors of European ancestry. Here we show that nearly half (224 of 470) of the analyzed miRNAs have associated miR-QTLs, many of which fall in regulatory regions such as brain promoters and enhancers. We also demonstrate that intragenic miRNAs often have genetic regulation independent from their host genes. Furthermore, by integrating our findings with 16 genome-wide association studies of psychiatric and neurodegenerative disorders, we identified miRNAs that likely contribute to bipolar disorder, depression, schizophrenia and Parkinson’s disease. These findings advance understanding of the genetic regulation of miRNAs and their role in brain health and disease.