DC
David Coates
Author with expertise in Population Genetic Structure and Dynamics
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
6
(83% Open Access)
Cited by:
4,127
h-index:
53
/
i10-index:
201
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Seed supply for broadscale restoration: maximizing evolutionary potential

Linda Broadhurst et al.Sep 4, 2008
Abstract Restoring degraded land to combat environmental degradation requires the collection of vast quantities of germplasm (seed). Sourcing this material raises questions related to provenance selection, seed quality and harvest sustainability. Restoration guidelines strongly recommend using local sources to maximize local adaptation and prevent outbreeding depression, but in highly modified landscapes this restricts collection to small remnants where limited, poor quality seed is available, and where harvesting impacts may be high. We review three principles guiding the sourcing of restoration germplasm: (i) the appropriateness of using ‘local’ seed, (ii) sample sizes and population characteristics required to capture sufficient genetic diversity to establish self‐sustaining populations and (iii) the impact of over‐harvesting source populations. We review these topics by examining current collection guidelines and the evidence supporting these, then we consider if the guidelines can be improved and the consequences of not doing so. We find that the emphasis on local seed sourcing will, in many cases, lead to poor restoration outcomes, particularly at broad geographic scales. We suggest that seed sourcing should concentrate less on local collection and more on capturing high quality and genetically diverse seed to maximize the adaptive potential of restoration efforts to current and future environmental change.
0
Citation625
0
Save
0

University Students' Expectations of Teaching

Paul Sander et al.Oct 1, 2000
This study used a specially designed questionnaire to explore undergraduate students' expectations of and preferences in teaching, learning and assessment. A convenience sample of 395 first-year university undergraduates at the start of their university life was used. They were enrolled on a Medical, Business Studies or Psychology degree course at one of three British universities. Overall, the similarities in expectations and preferences between the three groups were greater than the differences. Specifically, the students expected to be taught by formal and interactive lectures but preferred to be taught by interactive lectures and group-based activities. Their least favoured learning methods were formal lecture, role-play and student presentations. Coursework assessment preference was for essays, research projects and problems/exercises. Although there was an overall preference slightly in favour of coursework assessment rather than examinations, this was not consistent across all three centres. Students asked to rate various qualities of a good teacher selected 'teaching skill', followed by 'approachability' as the most important. The effective collection and value to institutions of students' expectations is discussed.
0
Paper
Citation454
0
Save
0

Genetic Diversity and Conservation Units: Dealing With the Species-Population Continuum in the Age of Genomics

David Coates et al.Oct 23, 2018
Current approaches to biodiversity conservation are largely based on geographic areas, ecosystems, ecological communities and species, with less attention ongenetic diversity and the evolutionary continuum from populations to species. Conservation management generally rests on discrete categories, such as identified species, and, for threated taxa, intraspecific units. Species, in particular, provide a common measure of biodiversity yet in both theory and nature, speciation is typically a protracted process progressing from connected populations to unambiguous species with variable rates of phenotypic, ecological and genetic divergence. Thus, most recognised species are not genetically uniform and are sometimes highly structured into historically isolated populations worthy of consideration as intraspecific units that represent unique genetic diversity for conservation. Genome screens offer unprecedented resolution of structure across taxonomic boundaries in species complexes, and have the potential to oversplit species if not interpreted conservatively. This highlights the blurred line between populations and species, and can confound simple dichotomies of ‘species’ versus ‘not species’. At the same time, like plants, there is increasing evidence than even distantly related animal species can hybridize and exchange genes. A review of conservation legislation reveals that legal definitions of ‘species’ are quite flexible and can accommodate a range of infra-specific taxa and divergent populations, as well as taxonomically recognised species. For example, the legislative definition of a species around the world can include: species, subspecies, varieties, and geographically and/or genetically distinct populations. In principle, this flexibility allows for protection of genetic diversity and maintenance of evolutionary processes at a broad range of infra-specific levels. However, evolutionary biologists often fail to adequately justify and then translate their evidence for genetically defined units into categories suited to assessment under local legislation. We recommend that (i). genomic data should be interpreted conservatively when formally naming species, (ii). concomitantly, there should be stronger impetus and a more uniform approach to identifying clearly justified intraspecific units, (iii). guidelines be developed for recognising and labelling intraspecific data that align with best scientific practice, and (iv). that the more nuanced view of species and speciation emerging from genomic analyses is communicated more effectively by scientists to decision makers.
0
Citation345
0
Save
0

Introducing BASE: the Biomes of Australian Soil Environments soil microbial diversity database

Andrew Bissett et al.May 18, 2016
Microbial inhabitants of soils are important to ecosystem and planetary functions, yet there are large gaps in our knowledge of their diversity and ecology. The 'Biomes of Australian Soil Environments' (BASE) project has generated a database of microbial diversity with associated metadata across extensive environmental gradients at continental scale. As the characterisation of microbes rapidly expands, the BASE database provides an evolving platform for interrogating and integrating microbial diversity and function. BASE currently provides amplicon sequences and associated contextual data for over 900 sites encompassing all Australian states and territories, a wide variety of bioregions, vegetation and land-use types. Amplicons target bacteria, archaea and general and fungal-specific eukaryotes. The growing database will soon include metagenomics data. Data are provided in both raw sequence (FASTQ) and analysed OTU table formats and are accessed via the project's data portal, which provides a user-friendly search tool to quickly identify samples of interest. Processed data can be visually interrogated and intersected with other Australian diversity and environmental data using tools developed by the 'Atlas of Living Australia'. Developed within an open data framework, the BASE project is the first Australian soil microbial diversity database. The database will grow and link to other global efforts to explore microbial, plant, animal, and marine biodiversity. Its design and open access nature ensures that BASE will evolve as a valuable tool for documenting an often overlooked component of biodiversity and the many microbe-driven processes that are essential to sustain soil function and ecosystem services.
0
Paper
Citation220
0
Save