Kadir Şimşek
Author with expertise in Magnetic Resonance Imaging Applications in Medicine
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Age-trajectories of higher-order diffusion properties of major brain metabolites in cerebral and cerebellar grey matter using in vivo diffusion-weighted MR spectroscopy at 3T

Kadir Şimşek et al.Jun 5, 2024
Abstract Healthy brain aging involves changes in both brain structure and function, including alterations in cellular composition and microstructure across brain regions. Unlike diffusion-weighted MRI (dMRI), diffusion-weighted MR spectroscopy (dMRS) can assess cell-type specific microstructural changes, providing indirect information on both cell composition and microstructure through the quantification and interpretation of metabolites’ diffusion properties. This work investigates age-related changes in the higher-order diffusion properties of three major intracellular metabolites (N-Acetyl-aspartate, Creatine and Choline) beyond the classical apparent diffusion coefficient in cerebral and cerebellar grey matter of healthy human brain. Twenty-five subjects were recruited and scanned using a diffusion-weighted semi-LASER sequence in two brain regions-of-interest (ROI) at 3T: posterior-cingulate (PCC) and cerebellar cortices. Metabolites’ diffusion was characterized by quantifying metrics from both Gaussian and non-Gaussian signal representations and biophysical models. All studied metabolites exhibited lower apparent diffusivities and higher apparent kurtosis values in the cerebellum compared to the PCC, likely stemming from the higher microstructural complexity of cellular composition in the cerebellum. Multivariate regression analysis (accounting for ROI tissue composition as a covariate) showed slight decrease (or no change) of all metabolites’ diffusivities and slight increase of all metabolites’ kurtosis with age, none of which statistically significant (p>0.05). The proposed age-trajectories provide benchmarks for identifying anomalies in the diffusion properties of major brain metabolites which could be related to pathological mechanisms altering both the brain microstructure and cellular composition.
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Normative age-trajectories of higher-order diffusion properties of major brain metabolites in cerebral and cerebellar gray matter using dMRS

Kadir Şimşek et al.Nov 26, 2024
Motivation: Healthy brain aging involves intricate changes in both brain structure and function, including alterations in cellular composition and microstructure across various regions. We focus on microstructural changes by studying normative age-trajectories in cerebral and cerebellar gray matter in human brain. Goal(s): Investigating microstructural changes in cerebral and cerebellar gray matter in human brain and provide benchmarks for the normative age-trajectories of higher-order metabolite diffusion properties. Approach: Using DW-MRS and diffusion modelling for characterizing microstructural changes Results: Our findings provide benchmarks for identifying anomalies in the diffusion properties of major brain metabolites, stemming from pathological mechanisms altering both the brain microstructure and cellular compositionImpact: This work investigates microstructural changes with aging in gray matter cerebral and cerebellar cortex in human brain DW-MRS. Moreover, it offers the first normative age-trajectories of metabolite diffusion characteristics, setting benchmark for detection and characterization of microstructural anomalies.
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Diffusion in dendritic spines: impact on permeative exchange estimation with time-dependent diffusion-weighted MRI

Kadir Şimşek et al.Nov 26, 2024
Motivation: Diffusion exchange models NEXI and SMEX assumes permeative exchange between intra- and extra-neurite compartments. Here, we hypothesize fine microstructures, like spines in dendritic segments, without permeable membranes can mimic permeative exchange. Goal(s): We aim to emphasize the significance of taking diffusion-mediated exchange into account when interpreting model-based estimates of exchange in intricate microstructures like the gray matter of the brain. Approach: Monte-Carlo water diffusion simulations in spiny dendritic branches, also featuring undulations and beadingResults: Our results question the way we interpret dMRI exchange estimates, emphasizing the need to exercise caution when inferring these estimates solely as indicators of membrane permeability. Impact: Diffusion exchange models assumes permeative exchange between intra- and extra-neurite compartments. We hypothesize fine microstructures without permeable membranes can mimic permeative exchange. We aim to emphasize considering the impact of intricate microstructures in gray matter when interpreting model-based exchange estimates