Activation of the transcription factor NF-κB by tumor necrosis factor (TNF) and interleukin-1 (IL-1) requires the NF-κB-inducing kinase (NIK). In a yeast two-hybrid screen for NIK-interacting proteins, we have identified a protein kinase previously known as CHUK. Overexpression of CHUK activates a NF-κB-dependent reporter gene. A catalytically inactive mutant of CHUK is a dominant-negative inhibitor of TNF-, IL-1-, TRAF-, and NIK-induced NF-κB activation. CHUK associates with the NF-κB inhibitory protein, IκB-α, in mammalian cells. CHUK specifically phosphorylates IκB-α on both serine 32 and serine 36, modifications that are required for targeted degradation of IκB-α via the ubiquitin-proteasome pathway. This phosphorylation of IκB-α is greatly enhanced by NIK costimulation. Thus, CHUK is a NIK-activated IκB-α kinase that links TNF- and IL-1-induced kinase cascades to NF-κB activation.

TNF-induced activation of the transcription factor NF-kappaB and the c-jun N-terminal kinase (JNK/SAPK) requires TNF receptor-associated factor 2 (TRAF2). The NF-kappaB-inducing kinase (NIK) associates with TRAF2 and mediates TNF activation of NF-kappaB. Herein we show that NIK interacts with additional members of the TRAF family and that this interaction requires the conserved "WKI" motif within the TRAF domain. We also investigated the role of NIK in JNK activation by TNF. Whereas overexpression of NIK potently induced NF-kappaB activation, it failed to stimulate JNK activation. A kinase-inactive mutant of NIK was a dominant negative inhibitor of NF-kappaB activation but did not suppress TNF- or TRAF2-induced JNK activation. Thus, TRAF2 is the bifurcation point of two kinase cascades leading to activation of NF-kappaB and JNK, respectively.

Bulk analysis of renal allograft biopsies (rBx) identified RNA transcripts associated with acute cellular rejection (ACR); however, these lacked cellular context critical to mechanistic understanding. We performed combined single cell RNA transcriptomic and TCRα/β sequencing on rBx from patients with ACR under differing immunosuppression (IS): tacrolimus, iscalimab, and belatacept. TCR analysis revealed a highly restricted CD8 + T cell clonal expansion (CD8 EXP ), independent of HLA mismatch or IS type. Subcloning of TCRα/β cDNAs from CD8 EXP into Jurkat76 cells (TCR -/- ) conferred alloreactivity by mixed lymphocyte reaction. scRNAseq analysis of CD8 EXP revealed effector, memory, and exhausted phenotypes that were influenced by IS type. Successful anti-rejection treatment decreased, but did not eliminate, CD8 EXP , while CD8 EXP were maintained during treatment-refractory rejection. Finally, most rBx-derived CD8 EXP were also observed in matching urine samples. Overall, our data define the clonal CD8 + T cell response to ACR, providing novel insights to improve detection, assessment, and treatment of rejection.