KL
Kai Li
Author with expertise in Ubiquitin-Proteasome Proteolytic Pathway
Achievements
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
7
(43% Open Access)
Cited by:
971
h-index:
38
/
i10-index:
130
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

RNA demethylase ALKBH5 prevents pancreatic cancer progression by posttranscriptional activation of PER1 in an m6A-YTHDF2-dependent manner

Xingya Guo et al.May 19, 2020
Abstract Background N6-methyladenosine (m6A) is the most abundant reversible methylation modification of eukaryotic mRNA, and it plays vital roles in tumourigenesis. This study aimed to explore the role of the m6A demethylase ALKBH5 in pancreatic cancer (PC). Methods The expression of ALKBH5 and its clinicopathological impact were evaluated in PC cohorts. The effects of ALKBH5 on the biological characteristics of PC cells were investigated on the basis of gain-of-function and loss-of-function analyses. Subcutaneous and orthotopic models further uncovered the role of ALKBH5 in tumour growth. mRNA and m6A sequencing and assays of m6A methylated RNA immunoprecipitation-qPCR (MeRIP-qPCR) were performed to identify the targeted effect of ALKBH5 on PER1. P53-binding sites in the ALKBH5 promoter were investigated by ChIP and luciferase assays to reveal the interplay between ALKBH5 and PER1-activated ATM-CHK2-P53/CDC25C signalling. Results ALKBH5 loss characterized the occurrence and poor clinicopathological manifestations in patients with PC. Overexpression of ALKBH5 reduced tumoural proliferative, migrative, invasive activities in vitro and ameliorated tumour growth in vivo, whereas ALKBH5 knockdown facilitated PC progression. Mechanistically, ALKBH5 posttranscriptionally activated PER1 by m6A demethylation in an m6A-YTHDF2-dependent manner. PER1 upregulation led to the reactivation of ATM-CHK2-P53/CDC25C signalling, which inhibited cell growth. P53-induced activation of ALKBH5 transcription acted as a feedback loop regulating the m6A modifications in PC. Conclusion ALKBH5 serves as a PC suppressor by regulating the posttranscriptional activation of PER1 through m6A abolishment, which may highlight a demethylation-based approach for PC diagnosis and therapy.
0
Citation291
0
Save
0

Refining the optimal CAF cluster marker for predicting TME-dependent survival expectancy and treatment benefits in NSCLC patients

Kai Li et al.Jul 21, 2024
Abstract The tumor microenvironment (TME) plays a pivotal role in the onset, progression, and treatment response of cancer. Among the various components of the TME, cancer-associated fibroblasts (CAFs) are key regulators of both immune and non-immune cellular functions. Leveraging single-cell RNA sequencing (scRNA) data, we have uncovered previously hidden and promising roles within this specific CAF subgroup, paving the way for its clinical application. However, several critical questions persist, primarily stemming from the heterogeneous nature of CAFs and the use of different fibroblast markers in various sample analyses, causing confusion and hindrance in their clinical implementation. In this groundbreaking study, we have systematically screened multiple databases to identify the most robust marker for distinguishing CAFs in lung cancer, with a particular focus on their potential use in early diagnosis, staging, and treatment response evaluation. Our investigation revealed that COL1A1, COL1A2, FAP, and PDGFRA are effective markers for characterizing CAF subgroups in most lung adenocarcinoma datasets. Through comprehensive analysis of treatment responses, we determined that COL1A1 stands out as the most effective indicator among all CAF markers. COL1A1 not only deciphers the TME signatures related to CAFs but also demonstrates a highly sensitive and specific correlation with treatment responses and multiple survival outcomes. For the first time, we have unveiled the distinct roles played by clusters of CAF markers in differentiating various TME groups. Our findings confirm the sensitive and unique contributions of CAFs to the responses of multiple lung cancer therapies. These insights significantly enhance our understanding of TME functions and drive the translational application of extensive scRNA sequence results. COL1A1 emerges as the most sensitive and specific marker for defining CAF subgroups in scRNA analysis. The CAF ratios represented by COL1A1 can potentially serve as a reliable predictor of treatment responses in clinical practice, thus providing valuable insights into the influential roles of TME components. This research marks a crucial step forward in revolutionizing our approach to cancer diagnosis and treatment.
0
Citation1
0
Save
0

Lentivirus-mediated long-term overexpression of specific microRNA in mammalian cells

Shupei Qiao et al.Jul 28, 2019
The establishment of a method that would overexpress or suppress of specific microRNA activity is essential for the functional analysis of these molecules and for the development of miRNA therapeutic applications. There already exist excellent ways to inhibit miRNA function in vitro and in vivo by overexpressing miRNA target sequences, which include miRNA decoys, sponges, or antagomirs that are complementary to an miRNA seed region. Conversely, no methods to induce stable gain of function phenotypes for specific miRNAs have, as yet, been reported. Furthermore, the discovery of complementary miRNA pairs raises suspicion regarding the existing methods used for miRNA overexpression. In our study, we will study whether the traditional methods for miRNA overexpression can be used for specific miRNA overexpression while complementary miRNA pairs exist. In addition, we test various miRNA-expression cassettes that were designed to efficiently overexpress specific miRNA through the shRNA lentivirus expression system. We report the optimal conditions that were established for the design of such miRNA-expression cassettes. We finally demonstrate that the miRNA expression cassettes achieve efficient and long term overexpression of specific miRNAs. Meanwhile, our results also support the notion that miRNA miRNA interactions are implicated in potential, mutual regulatory patterns and beyond the seed sequence of miRNA, extensive pairing interactions between a miRNA and its target also lead to target-directed miRNA degradation. Our results indicate that our method offers a simple and efficient means to overexpress the specific miRNA with long-term which will be very useful for future studies in miRNA biology, as well as contributed to the development of miRNA-based therapy for clinical applications.