The International Peach Genome Initiative reports the high quality draft genome sequence of peach (Prunus persica). They also resequenced ten additional P. persica accessions, as well as those of Prunus ferganensis, Prunus kansuensis, Prunus davidiana and Prunus mira. Rosaceae is the most important fruit-producing clade, and its key commercially relevant genera (Fragaria, Rosa, Rubus and Prunus) show broadly diverse growth habits, fruit types and compact diploid genomes. Peach, a diploid Prunus species, is one of the best genetically characterized deciduous trees. Here we describe the high-quality genome sequence of peach obtained from a completely homozygous genotype. We obtained a complete chromosome-scale assembly using Sanger whole-genome shotgun methods. We predicted 27,852 protein-coding genes, as well as noncoding RNAs. We investigated the path of peach domestication through whole-genome resequencing of 14 Prunus accessions. The analyses suggest major genetic bottlenecks that have substantially shaped peach genome diversity. Furthermore, comparative analyses showed that peach has not undergone recent whole-genome duplication, and even though the ancestral triplicated blocks in peach are fragmentary compared to those in grape, all seven paleosets of paralogs from the putative paleoancestor are detectable.

ABSTRACT We characterized the response of root hair density to phosphorus (P) availability in Arabidopsis thaliana . Arabidopsis plants were grown aseptically in growth media with varied phosphorus concentrations, ranging from 1 mmol m − 3 to 2000 mmol m − 3 phosphorus. Root hair density (number of root hairs per mm of root length) was analysed starting at 7 d of growth. Root hair density was highly regulated by phosphorus availability, increasing significantly in roots exposed to low‐phosphorus availability. The initial root hairs produced by the radicle were not sensitive to phosphorus availability, but began to respond after 9 d of growth. Root hair density was about five times greater in low phosphorus (1 mmol m − 3 ) than in high phosphorus (1000 mmol m − 3 ) media. Root hair density decreased logarithmically in response to increasing phosphorus concentrations within that range. Root hair density also increased in response to deficiencies of several other nutrients, but not as strongly as to low phosphorus. Indoleacetic acid (IAA), the auxin transport inhibitor 2‐( p ‐chlorophenoxy)‐2‐methylpropionic acid (CMPA), the ethylene precursor 1‐aminocyclopropane‐1‐carboxylic acid (ACC), and the ethylene synthesis inhibitor amino‐oxyacetic acid (AOA) all increased root hair density under high phosphorus but had very little effect under low phosphorus. Low phosphorus significantly changed root anatomy, causing a 9% increase in root diameter, a 31% decrease in the cross‐sectional area of individual trichoblasts, a 40% decrease in the cross‐sectional area of individual atrichoblasts, and 45% more cortical cells in cross‐section. The larger number of cortical cells and smaller epidermal cell size in low phosphorus roots increased the number of trichoblast files from eight to 12. Two‐thirds of increased root hair density in low phosphorus roots was caused by increased likelihood of trichoblasts to form hairs, and 33% of the increase was accounted for by changes in low phosphorus root anatomy resulting in an increased number of trichoblast files. These results show that phosphorus availability can fundamentally alter root anatomy, leading to changes in root hair density, which are presumably important for phosphorus acquisition.