DE
David Eisele
Author with expertise in Epidemiology and Treatment of Head and Neck Cancer
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
9
(100% Open Access)
Cited by:
3,876
h-index:
69
/
i10-index:
223
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Salivary Transcriptome Diagnostics for Oral Cancer Detection

Yang Li et al.Dec 15, 2004
Abstract Purpose: Oral fluid (saliva) meets the demand for noninvasive, accessible, and highly efficient diagnostic medium. Recent discovery that a large panel of human RNA can be reliably detected in saliva gives rise to a novel clinical approach, salivary transcriptome diagnostics. The purpose of this study is to evaluate the diagnostic value of this new approach by using oral squamous cell carcinoma (OSCC) as the proof-of-principle disease. Experimental Design: Unstimulated saliva was collected from patients (n = 32) with primary T1/T2 OSCC and normal subjects (n = 32) with matched age, gender, and smoking history. RNA isolation was done from the saliva supernatant, followed by two-round linear amplification with T7 RNA polymerase. Human Genome U133A microarrays were applied for profiling human salivary transcriptome. The different gene expression patterns were analyzed by combining a t test comparison and a fold-change analysis on 10 matched cancer patients and controls. Quantitative polymerase chain reaction (qPCR) was used to validate the selected genes that showed significant difference (P &lt; 0.01) by microarray. The predictive power of these salivary mRNA biomarkers was analyzed by receiver operating characteristic curve and classification models. Results: Microarray analysis showed there are 1,679 genes exhibited significantly different expression level in saliva between cancer patients and controls (P &lt; 0.05). Seven cancer-related mRNA biomarkers that exhibited at least a 3.5-fold elevation in OSCC saliva (P &lt; 0.01) were consistently validated by qPCR on saliva samples from OSCC patients (n = 32) and controls (n = 32). These potential salivary RNA biomarkers are transcripts of IL8, IL1B, DUSP1, HA3, OAZ1, S100P, and SAT. The combinations of these biomarkers yielded sensitivity (91%) and specificity (91%) in distinguishing OSCC from the controls. Conclusions: The utility of salivary transcriptome diagnostics is successfully demonstrated in this study for oral cancer detection. This novel clinical approach could be exploited to a robust, high-throughput, and reproducible tool for early cancer detection. Salivary transcriptome profiling can be applied to evaluate its usefulness for other major disease applications as well as for normal health surveillance.
0
Citation581
0
Save
0

The prognostic role of sex, race, and human papillomavirus in oropharyngeal and nonoropharyngeal head and neck squamous cell cancer

Carole Fakhry et al.Feb 27, 2017
BACKGROUND Human papillomavirus (HPV) is a well‐established prognostic marker for oropharyngeal squamous cell cancer (OPSCC). Because of the limited numbers of women and nonwhites in studies to date, sex and racial/ethnic differences in prognosis have not been well explored. In this study, survival differences were explored by the tumor HPV status among 1) patients with OPSCCs by sex and race and 2) patients with nonoropharyngeal (non‐OP) head and neck squamous cell cancers (HNSCCs). METHODS This retrospective, multi‐institution study included OPSCCs and non‐OP HNSCCs of the oral cavity, larynx, and nasopharynx diagnosed from 1995 to 2012. Race/ethnicity was categorized as white non‐Hispanic, black non‐Hispanic, Asian non‐Hispanic, and Hispanic of any race. Tumors were centrally tested for p16 overexpression and the presence of HPV by HPV16 DNA and high‐risk HPV E6/E7 messenger RNA in situ hybridization. Kaplan‐Meier and Cox proportional hazards models were used to evaluate overall survival (OS). RESULTS The study population included 239 patients with OPSCC and 621 patients with non‐OP HNSCC with a median follow‐up time of 3.5 years. After adjustments for the tumor HPV status, age, current tobacco use, and stage, the risk of death was lower for women versus men with OPSCC (adjusted hazard ratio, 0.55; P = .04). The results were similar with p16. In contrast, for non‐OP HNSCCs, HPV positivity, p16 positivity, and sex were not associated with OS. CONCLUSIONS For OPSCC, there are differences in survival by sex, even after the tumor HPV status has been taken into account. For non‐OP HNSCC, the HPV status and the p16 status are not of prognostic significance. Cancer 2017;123:1566–1575. © 2017 American Cancer Society .
0
Citation214
0
Save