XW
Xinxia Wang
Author with expertise in RNA Methylation and Modification in Gene Expression
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
9
(67% Open Access)
Cited by:
2,039
h-index:
37
/
i10-index:
77
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

VIRMA mediates preferential m6A mRNA methylation in 3′UTR and near stop codon and associates with alternative polyadenylation

Yanan Yue et al.Feb 23, 2018
N6-methyladenosine (m6A) is enriched in 3'untranslated region (3'UTR) and near stop codon of mature polyadenylated mRNAs in mammalian systems and has regulatory roles in eukaryotic mRNA transcriptome switch. Significantly, the mechanism for this modification preference remains unknown, however. Herein we report a characterization of the full m6A methyltransferase complex in HeLa cells identifying METTL3/METTL14/WTAP/VIRMA/HAKAI/ZC3H13 as the key components, and we show that VIRMA mediates preferential mRNA methylation in 3'UTR and near stop codon. Biochemical studies reveal that VIRMA recruits the catalytic core components METTL3/METTL14/WTAP to guide region-selective methylations. Around 60% of VIRMA mRNA immunoprecipitation targets manifest strong m6A enrichment in 3'UTR. Depletions of VIRMA and METTL3 induce 3'UTR lengthening of several hundred mRNAs with over 50% targets in common. VIRMA associates with polyadenylation cleavage factors CPSF5 and CPSF6 in an RNA-dependent manner. Depletion of CPSF5 leads to significant shortening of 3'UTR of over 2800 mRNAs, 84% of which are modified with m6A and have increased m6A peak density in 3'UTR and near stop codon after CPSF5 knockdown. Together, our studies provide insights into m6A deposition specificity in 3'UTR and its correlation with alternative polyadenylation.
0
Citation723
0
Save
0

Metallic Cobalt Nanoparticles Encapsulated in Nitrogen‐Enriched Graphene Shells: Its Bifunctional Electrocatalysis and Application in Zinc–Air Batteries

Min Zeng et al.Apr 26, 2016
There has been a continuous call for active, durable, and low‐cost electrocatalysts for a range of energy applications. Among many different nonprecious metal based candidates, transition metal nanoparticles encapsulated in graphene layers have gained increasing attention over recent years. In this study, it is demonstrated that metallic cobalt nanoparticles sheathed by multilayered nitrogen‐enriched graphene shells can be facilely prepared using cobalt‐containing Prussian blue colloids as the single precursor. These metallic cobalt cores can be readily leached out by HCl treatment, resulting in hollow graphene spheres. Products with or without acid leaching exhibit great bifunctional activities for electrocatalytic oxygen reduction and hydrogen evolution in both alkaline and acidic electrolytes. Most importantly, it is found that the removal of the metallic cores does not deteriorate but rather enhances the electrocatalytic performance. Based on this and other experimental observations, Co‐N‐C moieties are proposed as the catalytically active sites. At last, it is shown that these catalysts can be employed as the air catalyst of primary zinc–air batteries with excellent current density, power density, and operation durability.
0

m6A mRNA methylation controls autophagy and adipogenesis by targeting Atg5 and Atg7

Xinxia Wang et al.Aug 26, 2019
N 6-methyladenosine (m6A), the most abundant internal modification on mRNAs in eukaryotes, play roles in adipogenesis. However, the underlying mechanism remains largely unclear. Here, we show that m6A plays a critical role in regulating macroautophagy/autophagy and adipogenesis through targeting Atg5 and Atg7. Mechanistically, knockdown of FTO, a well-known m6A demethylase, decreased the expression of ATG5 and ATG7, leading to attenuation of autophagosome formation, thereby inhibiting autophagy and adipogenesis. We proved that FTO directly targeted Atg5 and Atg7 transcripts and mediated their expression in an m6A-dependent manner. Further study identified that Atg5 and Atg7 were the targets of YTHDF2 (YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 2). Upon FTO silencing, Atg5 and Atg7 transcripts with higher m6A levels were captured by YTHDF2, which resulted in mRNA degradation and reduction of protein expression, thus alleviating autophagy and adipogenesis. Furthermore, we generated an adipose-selective fto knockout mouse and find that FTO deficiency decreased white fat mass and impairs ATG5- and ATG7-dependent autophagy in vivo. Together, these findings unveil the functional importance of the m6A methylation machinery in autophagy and adipogenesis regulation, which expands our understanding of such interplay that is essential for development of therapeutic strategies in the prevention and treatment of obesity.Abbreviations 3-MA: 3-methyladenine; ACTB: actin, beta; ATG: autophagy-related; Baf A1: bafilomycin A1; CEBPA: CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), alpha; CEBPB: CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP), beta; FABP4: fatty acid binding protein 4, adipocyte; FTO: fat mass and obesity associated; HFD: high-fat diet; LC-MS/MS: liquid chromatography-tandem mass spectrometry; MAP1LC3B/LC3: microtubule-associated protein 1 light chain 3 beta; m6A: N6-methyladenosine; MEFs: mouse embryo fibroblasts; MeRIP-qPCR: methylated RNA immunoprecipitation-qPCR; PPARG: peroxisome proliferator activated receptor gamma; RIP: RNA-immunoprecipitation; SAT: subcutaneous adipose tissue; siRNA: small interfering RNA; SQSTM1/p62: sequestosome 1; TEM: transmission electron microscopy; ULK1: unc-51 like kinase 1; VAT: visceral adipose tissue; WAT: white adipose tissue; YTHDF: YTH N6-methyladenosine RNA binding protein
0

Analysis of Energy During Spark Discharge in Short Circuit of Capacitive Circuit

Dangshu Wang et al.Jun 16, 2024
In the explosive environments, the electrical sparks with short circuit of capacitor output will ignite the surrounding explosive medium, and the relationship between effective ignition energy, capacitance energy conversion rate, capacitor capacitance and capacitor terminal voltage is unclear. Based on the three stages of breakdown, discharge and attenuation of the discharge characteristic curve of capacitive circuit, this paper deduces the expressions of spark resistance and discharge current including voltage, capacitance and polar distance parameters. Based on the programmable micro-nano gap discharge experimental platform, experiments under different voltages and different capacitances were carried out. It is found that the theoretical voltage-current curve and spark energy conversion rate are in good agreement with the experimental fitting curve and spark energy conversion rate. And with the increase of capacitance or voltage, the peak current and discharge time increase, which leads to the increase of energy. The conversion rate of spark energy decreases with the increase of capacitance or voltage, and the conversion rate changes between 20% and 30%. The change of spark energy conversion rate is also related to spark resistance, and with the decrease of spark resistance, the spark energy conversion rate also decreases. This study can further understand the energy variation in the discharge gap and is of great significance for the research of intrinsically safe circuits.
0

Parishin B blocking TRIB3-AKT1 interaction inhibits breast cancer lung metastasis

Xiongtao Cheng et al.Jan 15, 2025
Background TRIB3 has been reported to mediate breast cancer (BC) proliferation and metastasis by interacting with AKT1, and blocking the interaction between TRIB3 and AKT1 can inhibit the progression of BC. Besides, inhibiting TRIB3 to turn “cold tumor” hot has also been proved to be an effective therapeutic strategy for BC. Thus, this study aim to find drugs that can bind to TRIB3 to inhibit BC progression, and further elucidate its mechanism. Methods The possible inhibitors of TRIB3 were screened by high-throughput molecular docking, CETSA, and CO-IP assay. Then, the effect of TRIB3 inhibitor anti BC was assessed by CCK-8 assay, flow cytometry, plate colony formation assay, and transwell assay; and the RNA-seq was empolyed to study the potential mechanism of Parishin B (PB) anti-BC. Finally, the effect of TRIB3 inhibitor on BC lung metastasis in vivo was evaluated. Results PB was screened as a possible inhibitor of TRIB3, and CETSA and CO-IP assay indicated that PB could target TRIB3 and block TRIB3-AKT1 interaction. In addition, PB exhibited good anti-BC activity without drug toxicity in normal breast cells by experiments in vitro , and RNA-seq analysis suggested PB could inhibit the proliferation and invasion of BC cells related with cell cycle. It was also proved that PB could inhibit BC lung metastasis in vivo . Conclusion The study demonstrated PB can bind to TRIB3 to inhibit BC proliferation and lung metastasis by blocking TRIB3-AKT1 interaction and regulating cell cycle, providing a therapeutic agent for the treatment of BC.