YZ
Yadong Zheng
Author with expertise in Tectonic and Geochronological Evolution of Orogens
Achievements
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
6
(33% Open Access)
Cited by:
1,221
h-index:
33
/
i10-index:
84
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

The genomes of four tapeworm species reveal adaptations to parasitism

Isheng Tsai et al.Mar 12, 2013
Tapeworms (Cestoda) cause neglected diseases that can be fatal and are difficult to treat, owing to inefficient drugs. Here we present an analysis of tapeworm genome sequences using the human-infective species Echinococcus multilocularis, E. granulosus, Taenia solium and the laboratory model Hymenolepis microstoma as examples. The 115- to 141-megabase genomes offer insights into the evolution of parasitism. Synteny is maintained with distantly related blood flukes but we find extreme losses of genes and pathways that are ubiquitous in other animals, including 34 homeobox families and several determinants of stem cell fate. Tapeworms have specialized detoxification pathways, metabolism that is finely tuned to rely on nutrients scavenged from their hosts, and species-specific expansions of non-canonical heat shock proteins and families of known antigens. We identify new potential drug targets, including some on which existing pharmaceuticals may act. The genomes provide a rich resource to underpin the development of urgently needed treatments and control. Genome sequences of human-infective tapeworm species reveal extreme losses of genes and pathways that are ubiquitous in other animals, species-specific expansions of non-canonical heat shock proteins and families of known antigens, specialized detoxification pathways, and metabolism that relies on host nutrients; this information is used to identify new potential drug targets. Tapeworms cause echinococcosis and cysticercosis, two of the most severe parasitic diseases found in humans, and both on the World Health Organization's list of neglected tropical diseases. The publication of four tapeworm genome sequences — human-infective tapeworm species Echinococcus multilocularis, E. granulosus, Taenia solium and the laboratory model Hymenolepis microstoma — and identification of potential new drug targets for treating tapeworm infections is therefore a welcome development. Analysis of the sequences provides insights into the evolution of parasitism and reveals extreme losses of genes and pathways ubiquitous in other animals on one hand and species-specific expansions of genes on the other. More than a thousand E. multilocularis proteins emerge as potential targets, and of these, close to 200 with the highest scores may be targeted with existing pharmaceuticals.
0
Citation670
0
Save
0

Pattern and kinematic polarity of late Mesozoic extension in continental NE Asia: Perspectives from metamorphic core complexes

Tao Wang et al.Aug 5, 2011
Late Mesozoic extension in NE Asia resulted in the development of a large extensional province. Metamorphic core complexes (MCCs) are the major features in this province and have 40 Ar/ 39 Ar ages of 130–110 Ma for the mylonites and U‐Pb zircon ages of 150–110 Ma for the integral granitic intrusions. Based on this and previous studies, this paper summarizes major characteristics of these MCCs and recognizes a regional kinematic shear sense. Most MCCs in the Transbaikalia region, Sino‐Mongolia border tract, and the northwest‐central portion of the North China craton (NCC) show a top‐to‐the‐southeast (SE) shear, whereas those in the eastern and southern NCC locally underwent top‐to‐the‐northwest (NW) shear. The three largest basins (Songliao, Huabei and Ordos) in North China are located in the transitional zone between domains of opposing shear sense. We interpret the extension in the Transbaikalia, Sino‐Mongolia tract and northwestern part of the NCC to reflect late‐orogenic collapse of thickened crust following Middle‐Late Jurassic collision along the Okhotsk suture. The southeastward extension is probably controlled by crustal‐scale top‐to‐the‐SE tangential shear. The transition from contraction to extension is marked by detachment faults that nucleated as extensional crenulation cleavage (ecc, i.e., C′) in sub‐horizontal ductile shear zones late in orogenic crustal thickening. The combined effect of gravitational loading and thermal‐uplifting is considered to be the origin of the late‐or post‐orogenic collapse. The top‐to‐the‐NW extension in the NE of the NCC might reflect antithetic sub‐extensional zones or Mesozoic back‐arc extension as a far‐field effect of Cretaceous Pacific plate subduction.
0
Paper
Citation311
0
Save