JL
Jens Levy
Author with expertise in Global Impact of Arboviral Diseases
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
9
(100% Open Access)
Cited by:
1,625
h-index:
25
/
i10-index:
42
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Rapid Scale-up of Antiretroviral Therapy at Primary Care Sites in Zambia

Jeffrey Stringer et al.Aug 13, 2006
ContextThe Zambian Ministry of Health has scaled-up human immunodeficiency virus/acquired immunodeficiency syndrome (HIV/AIDS) care and treatment services at primary care clinics in Lusaka, using predominately nonphysician clinicians.ObjectiveTo report on the feasibility and early outcomes of the program.Design, Setting, and PatientsOpen cohort evaluation of antiretroviral-naive adults treated at 18 primary care facilities between April 26, 2004, and November 5, 2005. Data were entered in real time into an electronic patient tracking system.InterventionThose meeting criteria for antiretroviral therapy (ART) received drugs according to Zambian national guidelines.Main Outcome MeasuresSurvival, regimen failure rates, and CD4 cell response.ResultsWe enrolled 21 755 adults into HIV care, and 16 198 (75%) started ART. Among those starting ART, 9864 (61%) were women. Of 15 866 patients with documented World Health Organization (WHO) staging, 11 573 (73%) were stage III or IV, and the mean (SD) entry CD4 cell count among the 15 336 patients with a baseline result was 143/μL (123/μL). Of 1142 patients receiving ART who died, 1120 had a reliable date of death. Of these patients, 792 (71%) died within 90 days of starting therapy (early mortality rate: 26 per 100 patient-years), and 328 (29%) died after 90 days (post-90-day mortality rate: 5.0 per 100 patient-years). In multivariable analysis, mortality was strongly associated with CD4 cell count between 50/μL and 199/μL (adjusted hazard ratio [AHR], 1.4; 95% confidence interval [CI], 1.0-2.0), CD4 cell count less than 50/μL (AHR, 2.2; 95% CI, 1.5-3.1), WHO stage III disease (AHR, 1.8; 95% CI, 1.3-2.4), WHO stage IV disease (AHR, 2.9; 95% CI, 2.0-4.3), low body mass index (<16; AHR,2.4; 95% CI, 1.8-3.2), severe anemia (<8.0 g/dL; AHR, 3.1; 95% CI, 2.3-4.0), and poor adherence to therapy (AHR, 2.9; 95% CI, 2.2-3.9). Of 11 714 patients at risk, 861 failed therapy by clinical criteria (rate, 13 per 100 patient-years). The mean (SD) CD4 cell count increase was 175/μL (174/μL) in 1361 of 1519 patients (90%) receiving treatment long enough to have a 12-month repeat.ConclusionMassive scale-up of HIV and AIDS treatment services with good clinical outcomes is feasible in primary care settings in sub-Saharan Africa. Most mortality occurs early, suggesting that earlier diagnosis and treatment may improve outcomes.
0
Citation650
0
Save
0

Clinical Outcomes and CD4 Cell Response in Children Receiving Antiretroviral Therapy at Primary Health Care Facilities in Zambia

Carolyn Bolton‐Moore et al.Oct 22, 2007
The Zambian Ministry of Health provides pediatric antiretroviral therapy (ART) at primary care clinics in Lusaka, where, despite scale-up of perinatal prevention efforts, many children are already infected with the human immunodeficiency virus (HIV).To report early clinical and immunologic outcomes of children enrolled in the pediatric treatment program.Open cohort assessment using routinely collected clinical and outcome data from an electronic medical record system in use at 18 government primary health facilities in Lusaka, Zambia. Care was provided primarily by nurses and clinical officers ("physician extenders" akin to physician assistants in the United States). Patients were children (<16 years of age) presenting for HIV care between May 1, 2004, and June 29, 2007.Three-drug ART (zidovudine or stavudine plus lamivudine plus nevirapine or efavirenz) for children who met national treatment criteria.Survival, weight gain, CD4 cell count, and hemoglobin response.After enrollment of 4975 children into HIV care, 2938 (59.1%) started ART. Of those initiating ART, the median age was 81 months (interquartile range, 36-125), 1531 (52.1%) were female, and 2087 (72.4%) with World Health Organization stage information were in stage III or IV. At the time of analysis, 158 children (5.4%) had withdrawn from care and 382 (13.0%) were at least 30 days late for follow-up. Of the remaining 2398 children receiving ART, 198 (8.3%) died over 3018 child-years of follow-up (mortality rate, 6.6 deaths per 100 child-years; 95% confidence interval [CI], 5.7-7.5); of these deaths, 112 (56.6%) occurred within 90 days of therapy initiation (early mortality rate, 17.4/100 child-years; post-90-day mortality rate, 2.9/100 child-years). Mortality was associated with CD4 cell depletion, lower weight-for-age, younger age, and anemia in multivariate analysis. The mean CD4 cell percentage at ART initiation among the 1561 children who had at least 1 repeat measurement was 12.9% (95% CI, 12.5%-13.3%) and increased to 23.7% (95% CI, 23.1%-24.3%) at 6 months, 27.0% (95% CI, 26.3%-27.6%) at 12 months, 28.0% (95% CI, 27.2%-28.8%) at 18 months, and 28.4% (95% CI, 27.4%-29.4%) at 24 months.Care provided by clinicians such as nurses and clinical officers can result in good outcomes for HIV-infected children in primary health care settings in sub-Saharan Africa. Mortality during the first 90 days of therapy is high, pointing to a need for earlier intervention.
0

Aerosol transmission is an important mode of influenza A virus spread

Benjamin Cowling et al.Jun 4, 2013
Influenza A viruses are believed to spread between humans through contact, large respiratory droplets and small particle droplet nuclei (aerosols), but the relative importance of each of these modes of transmission is unclear. Volunteer studies suggest that infections via aerosol transmission may have a higher risk of febrile illness. Here we apply a mathematical model to data from randomized controlled trials of hand hygiene and surgical face masks in Hong Kong and Bangkok households. In these particular environments, inferences on the relative importance of modes of transmission are facilitated by information on the timing of secondary infections and apparent differences in clinical presentation of secondary infections resulting from aerosol transmission. We find that aerosol transmission accounts for approximately half of all transmission events. This implies that measures to reduce transmission by contact or large droplets may not be sufficient to control influenza A virus transmission in households. Influenza A viruses spread through contact, large and small respiratory droplets (aerosols), but the relative importance of these modes of transmission is unclear. Cowling et al. model data from community trials of face masks and hand hygiene and find that aerosol transmission accounts for half of influenza occurrences.
0

High Rate of Subclinical Chikungunya Virus Infection and Association of Neutralizing Antibody with Protection in a Prospective Cohort in The Philippines

In‐Kyu Yoon et al.May 7, 2015
Background Chikungunya virus (CHIKV) is a globally re-emerging arbovirus for which previous studies have indicated the majority of infections result in symptomatic febrile illness. We sought to characterize the proportion of subclinical and symptomatic CHIKV infections in a prospective cohort study in a country with known CHIKV circulation. Methods/Findings A prospective longitudinal cohort of subjects ≥6 months old underwent community-based active surveillance for acute febrile illness in Cebu City, Philippines from 2012-13. Subjects with fever history were clinically evaluated at acute, 2, 5, and 8 day visits, and at a 3-week convalescent visit. Blood was collected at the acute and 3-week convalescent visits. Symptomatic CHIKV infections were identified by positive CHIKV PCR in acute blood samples and/or CHIKV IgM/IgG ELISA seroconversion in paired acute/convalescent samples. Enrollment and 12-month blood samples underwent plaque reduction neutralization test (PRNT) using CHIKV attenuated strain 181/clone25. Subclinical CHIKV infections were identified by ≥8-fold rise from a baseline enrollment PRNT titer <10 without symptomatic infection detected during the intervening surveillance period. Selected CHIKV PCR-positive samples underwent viral isolation and envelope protein-1 gene sequencing. Of 853 subjects who completed all study procedures at 12 months, 19 symptomatic infections (2.19 per 100 person-years) and 87 subclinical infections (10.03 per 100 person-years) occurred. The ratio of subclinical-to-symptomatic infections was 4.6:1 varying with age from 2:1 in 6 month-5 year olds to 12:1 in those >50 years old. Baseline CHIKV PRNT titer ≥10 was associated with 100% (95%CI: 46.1, 100.0) protection from symptomatic CHIKV infection. Phylogenetic analysis demonstrated Asian genotype closely related to strains from Asia and the Caribbean. Conclusions Subclinical infections accounted for a majority of total CHIKV infections. A positive baseline CHIKV PRNT titer was associated with protection from symptomatic CHIKV infection. These findings have implications for assessing disease burden, understanding virus transmission, and supporting vaccine development.
0
Citation140
0
Save
0

Reconstruction of 60 Years of Chikungunya Epidemiology in the Philippines Demonstrates Episodic and Focal Transmission

Henrik Salje et al.Sep 25, 2015
Proper understanding of the long-term epidemiology of chikungunya has been hampered by poor surveillance. Outbreak years are unpredictable and cases often misdiagnosed. Here we analyzed age-specific data from 2 serological studies (from 1973 and 2012) in Cebu, Philippines, to reconstruct both the annual probability of infection and population-level immunity over a 60-year period (1952–2012). We also explored whether seroconversions during 2012–2013 were spatially clustered. Our models identified 4 discrete outbreaks separated by an average delay of 17 years. On average, 23% (95% confidence interval [CI], 16%–37%) of the susceptible population was infected per outbreak, with >50% of the entire population remaining susceptible at any point. Participants who seroconverted during 2012–2013 were clustered at distances of <230 m, suggesting focal transmission. Large-scale outbreaks of chikungunya did not result in sustained multiyear transmission. Nevertheless, we estimate that >350 000 infections were missed by surveillance systems. Serological studies could supplement surveillance to provide important insights on pathogen circulation.
0
Citation85
0
Save
0

Incidence of Dengue Virus Infection in Adults and Children in a Prospective Longitudinal Cohort in the Philippines

Maria Alera et al.Feb 4, 2016
Background The mean age of dengue has been increasing in some but not all countries. We sought to determine the incidence of dengue virus (DENV) infection in adults and children in a prospective cohort study in the Philippines where dengue is hyperendemic. Methodology/Principal Findings A prospective cohort of subjects ≥6 months old in Cebu City, Philippines, underwent active community-based surveillance for acute febrile illnesses by weekly contact. Fever history within the prior seven days was evaluated with an acute illness visit followed by 2, 5, and 8-day, and 3-week convalescent visits. Blood was collected at the acute and 3-week visits. Scheduled visits took place at enrolment and 12 months that included blood collections. Acute samples were tested by DENV PCR and acute/convalescent samples by DENV IgM/IgG ELISA to identify symptomatic infections. Enrolment and 12-month samples were tested by DENV hemagglutination inhibition (HAI) assay to identify subclinical infections. Of 1,008 enrolled subjects, 854 completed all study activities at 12 months per-protocol undergoing 868 person-years of surveillance. The incidence of symptomatic and subclinical infections was 1.62 and 7.03 per 100 person-years, respectively. However, in subjects >15 years old, only one symptomatic infection occurred whereas 27 subclinical infections were identified. DENV HAI seroprevalence increased sharply with age with baseline multitypic HAIs associated with fewer symptomatic infections. Using a catalytic model, the historical infection rate among dengue naïve individuals was estimated to be high at 11–22%/year. Conclusions/Significance In this hyperendemic area with high seroprevalence of multitypic DENV HAIs in adults, symptomatic dengue rarely occurred in individuals older than 15 years. Our findings demonstrate that dengue is primarily a pediatric disease in areas with high force of infection. However, the average age of dengue could increase if force of infection decreases over time, as is occurring in some hyperendemic countries such as Thailand.
0
Citation62
0
Save
0

Influenza Vaccine Effectiveness in the Tropics: Moderate Protection in a Case Test-Negative Analysis of a Hospital-Based Surveillance Population in Bangkok between August 2009 and January 2013

Jens Levy et al.Aug 12, 2015
Influenza in the tropics occurs year round with peaks that correspond variably to temperate regions. However, data on influenza vaccine effectiveness (VE) in the tropics is sparse. We report on the effectiveness of influenza vaccine to prevent medically attended laboratory confirmed influenza from sentinel surveillance conducted at a Thai military medical facility in Bangkok, Thailand from August 2009 to January 2013. Patients ≥6 months old presenting with influenza-like illness underwent combined nasal/throat swabs which were tested by influenza RT-PCR. A case test-negative study design was used to evaluate VE. Of 2999 samples available for analysis,1059 (35.3%) were PCR-positive (cases) and 1940 (64.6%) were PCR-negative (test-negative controls). Five hundred and seven (16.9%) of these patients reported being vaccinated within the previous 12 months. Periods of high and low influenza activity were defined based on publicly available Thai Ministry of Public Health data. Overall VE adjusted for age and epiweek was found to be 50.1% (95%CI: 35.0, 61.9%). The May to April adjusted VE for year 2010, 2011 and 2012 was 57.7% (95%CI: 33.7, 73.8%), 57.1% (95% CI: 35.2, 68.3%) and 37.6% (95% CI: 3.5, 62.9%).During high influenza activity in years with the same vaccine formulation, the adjusted VE was 54.9% (95%CI: 38.9, 66.9%). VE appeared to be much higher during high versus low influenza activity periods. The adjusted point estimate for VE was highest in the 18–49 year age group (76.6%) followed by 6–23 months (58.1%) and 2–17 years (52.5%). Adjusted estimates were not done for those ≥50 years of age due to small numbers. VE in patients with underlying disease was 75.5% compared to 48.0% in those without. Our findings demonstrate moderate protection by influenza vaccination and support the utility of influenza vaccination in the tropics including in very young children and those with underlying disease.
0
Citation13
0
Save
0

Elevated transmission of upper respiratory illness among new recruits in military barracks in Thailand

Jens Levy et al.Aug 14, 2015
Background New recruits within military barracks present conditions favorable for the spread of respiratory pathogens. However, respiratory pathogen transmission in such confined settings in the tropics has not been well studied. Methods Recruits in four successive Royal Thai Army basic training classes living in military barracks were monitored for the symptoms of influenza‐like illness ( ILI ) or upper respiratory illness ( URI ). Classes 1 and 2 were also monitored after basic training. Nasal/throat swabs from acute illnesses were collected and tested by influenza RT ‐ PCR (all four classes). In addition, class 1 had multiplex PCR performed along with the analysis of bed locations within the barracks. Results Influenza‐like illness/upper respiratory illness rates ranged from 4·7 to 6·9 per 100 recruit‐weeks in the four classes and generally decreased during the course of basic training ( P < 0·05 in three of four classes). Rates during basic training were 1·7 (95% CI : 1·29, 2·29) and 2·5 (95% CI : 1·5, 4·1) times higher than after basic training (classes 1 and 2, respectively). In class 1, coronavirus, parainfluenza virus, and rhinovirus were the most commonly identified respiratory pathogens; only one influenza PCR ‐positive infection was detected in all four classes. Bed locations of URI / ILI cases in class 1 tended to be in closer proximity to each other. Conclusion Basic training recruits in military barracks in the tropics had high rates of acute respiratory illnesses with illness patterns consistent with external seeding followed by substantial internal transmission. Our findings may contribute to control measures in similar confined settings both within and outside the military.
0
Citation11
0
Save
0

Resolution of a Chikungunya Outbreak in a Prospective Cohort, Cebu, Philippines, 2012–2014

Anon Srikiatkhachorn et al.Aug 29, 2016
To the Editor: Chikungunya is a reemerging, mosquitoborne infectious disease caused by chikungunya virus (CHIKV). Its classic manifestations include fever and joint inflammation, which can develop into chronic joint disease. Infections in immunocompromised persons can lead to severe organ involvement and death. Chikungunya outbreaks appear to occur in 2 patterns: 1) spatially and temporally restricted outbreaks in endemic areas (1,2); and 2) large epidemics that occur periodically every 40–50 years affecting multiple geographic areas (3). The mechanisms associated with the initiation of these large outbreaks are not well understood. An A226V amino acid substitution in the virus envelope, which enhances replication in Aedes albopictus, a mosquito vector for CHIKV, and expansion of vectors into areas with previously immunologically naive populations are thought to be responsible for some recent epidemics (4). In chikungunya-endemic areas, environmental factors such as changes in rainfall and vector densities have been implicated in smaller scale outbreaks. The mechanisms underlying outbreak resolution are not well understood. Herd immunity afforded by exposed persons might play an important role in preventing ongoing virus transmission. Reported seroprevalence rates in affected areas have ranged from 10% to ≈40% after an outbreak (5–7).
0
Citation8
0
Save