Inherited deficiency of the RNA lariat–debranching enzyme 1 (DBR1) is a rare etiology of brainstem viral encephalitis. The cellular basis of disease and the range of viral predisposition are unclear. We report inherited DBR1 deficiency in a 14-year-old boy who suffered from isolated SARS-CoV-2 brainstem encephalitis. The patient is homozygous for a previously reported hypomorphic and pathogenic DBR1 variant (I120T). Consistently, DBR1 I120T/I120T fibroblasts from affected individuals from this and another unrelated kindred have similarly low levels of DBR1 protein and high levels of RNA lariats. DBR1 I120T/I120T human pluripotent stem cell (hPSC)–derived hindbrain neurons are highly susceptible to SARS-CoV-2 infection. Exogenous WT DBR1 expression in DBR1 I120T/I120T fibroblasts and hindbrain neurons rescued the RNA lariat accumulation phenotype. Moreover, expression of exogenous RNA lariats, mimicking DBR1 deficiency, increased the susceptibility of WT hindbrain neurons to SARS-CoV-2 infection. Inborn errors of DBR1 impair hindbrain neuron–intrinsic antiviral immunity, predisposing to viral infections of the brainstem, including that by SARS-CoV-2.

Multisystem inflammatory syndrome in children (MIS-C) is a rare condition following SARS-CoV-2 infection associated with intestinal manifestations. Genetic predisposition, including inborn errors of the OAS-RNAseL pathway, has been reported. We sequenced 154 MIS-C patients and utilized a novel statistical framework of gene burden analysis, "burdenMC," which identified an enrichment for rare predicted-deleterious variants in BTNL8 (OR = 4.2, 95% CI: 3.5-5.3, P < 10-6). BTNL8 encodes an intestinal epithelial regulator of Vγ4+γδ T cells implicated in regulating gut homeostasis. Enrichment was exclusive to MIS-C, being absent in patients with COVID-19 or bacterial disease. Using an available functional test for BTNL8, rare variants from a larger cohort of MIS-C patients (n = 835) were tested which identified eight variants in 18 patients (2.2%) with impaired engagement of Vγ4+γδ T cells. Most of these variants were in the B30.2 domain of BTNL8 implicated in sensing epithelial cell status. These findings were associated with altered intestinal permeability, suggesting a possible link between disrupted gut homeostasis and MIS-C-associated enteropathy triggered by SARS-CoV-2.

ABSTRACT Objectives To externally validate a clinical prediction model for surgical site infection (SSI) after lower third molar (L3M) surgery and evaluate its clinical usefulness. Methods We conducted a retrospective cohort study of patients who underwent L3M surgery at Hokkaido University Hospital. The study was designed to evaluate the historical and methodological transportability. Clinical usefulness was evaluated using decision curve analysis on the data of the non‐antibiotic‐treated patients. Results We obtained 2543 validation cohorts from April 2020 to March 2023, and 640 non‐antibiotic cohorts from July 2010 to September 2023. The incidences of SSI after L3M surgery were 5.3% (135/2543) and 7.7% (49/640) in the validation and non‐antibiotic cohorts, respectively. The discrimination ability of the prediction model was acceptable for the external validation cohort ( c ‐statistic: 0.67; 95% CI: 0.62–0.71) and adequate for the non‐antibiotic cohort ( c ‐statistic: 0.72; 95% CI: 0.63–0.79). In both cohorts, the model showed excellent calibration between the observed and predicted probabilities. Decision curve analysis showed increased net benefit across a range of meaningful risk thresholds. Conclusion A simple risk prediction model for SSI after L3M surgery demonstrated clinical transportability and usefulness. This model may help surgeons/clinicians determine the appropriateness of prophylactic antibiotics administration for patients in L3M surgery.