NC
Nadège Calmels
Author with expertise in RNA Methylation and Modification in Gene Expression
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(67% Open Access)
Cited by:
950
h-index:
15
/
i10-index:
22
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

A new highly penetrant form of obesity due to deletions on chromosome 16p11.2

Robin Walters et al.Feb 1, 2010
Obesity is a highly heritable disorder but the genetic associations reported to date account for only a small percentage of the inherited variation in body mass index. Two groups report deletions on chromosome16p11.2 that may explain part of the 'missing heritability' in terms of 'high-penetrance' mutations that are rare but when present are very often associated with severe obesity. This is in contrast to more common gene defects that are less closely associated with clinical symptoms. Bochukova et al. identified rare recurrent copy number variants in 300 patients with severe early-onset obesity, caused by deletions involving several genes including SH2B1, known to be involved in leptin and insulin signalling. Many of the patients also suffered neurodevelopmental disorders. Walters et al. identified deletions of at least 593 kilobases on chromosome 16p11.2 in 31 patients with a previously unrecognized type of extreme obesity. The strategy they used to identify the lesion — using small well-phenotyped cohorts of extreme phenotypes with targeted follow-up in genome-wide association studies and population cohorts — shows promise as a means of identifying 'missing heritability' in complex metabolic diseases more generally. Recently, numerous single nucleotide polymorphisms have been identified as being associated with obesity, but these loci together account for only a small fraction of the known heritable component. Here, an association is reported between rare deletions of at least 593 kilobases at 16p11.2 and a highly penetrant form of obesity. The strategy used of combining study of extreme phenotypes with targeted follow-up is promising for identifying missing heritability in obesity. Obesity has become a major worldwide challenge to public health, owing to an interaction between the Western ‘obesogenic’ environment and a strong genetic contribution1. Recent extensive genome-wide association studies (GWASs) have identified numerous single nucleotide polymorphisms associated with obesity, but these loci together account for only a small fraction of the known heritable component1. Thus, the ‘common disease, common variant’ hypothesis is increasingly coming under challenge2. Here we report a highly penetrant form of obesity, initially observed in 31 subjects who were heterozygous for deletions of at least 593 kilobases at 16p11.2 and whose ascertainment included cognitive deficits. Nineteen similar deletions were identified from GWAS data in 16,053 individuals from eight European cohorts. These deletions were absent from healthy non-obese controls and accounted for 0.7% of our morbid obesity cases (body mass index (BMI) ≥ 40 kg m-2 or BMI standard deviation score ≥ 4; P = 6.4 × 10-8, odds ratio 43.0), demonstrating the potential importance in common disease of rare variants with strong effects. This highlights a promising strategy for identifying missing heritability in obesity and other complex traits: cohorts with extreme phenotypes are likely to be enriched for rare variants, thereby improving power for their discovery. Subsequent analysis of the loci so identified may well reveal additional rare variants that further contribute to the missing heritability, as recently reported for SIM1 (ref. 3). The most productive approach may therefore be to combine the ‘power of the extreme’4 in small, well-phenotyped cohorts, with targeted follow-up in case-control and population cohorts.
0
Citation520
0
Save
0

Changing patient perceptions of the side effects of cancer chemotherapy

Nadège Calmels et al.Jun 28, 2002
Abstract BACKGROUND Quality‐of‐life (QoL) issues have become increasingly important as the number of newly diagnosed patients with cancer increases and survival improves. In 1983, Coates et al. reported a survey of patient perceptions of the side effects of cancer chemotherapy and showed the importance of including patient feedback for the accurate assessment of QoL ( Eur J Cancer Clin Oncol. 1983;19:203–208.). The authors carried out a similar survey in 100 patients with cancer with the objectives of 1) investigating the changes in patient perceptions that have occurred and 2) evaluating the impact of new treatments on the profile of chemotherapy side effects among patients receiving anticancer drugs. METHODS One hundred patients attending the outpatient Medical Oncology Department of the Pitié Salpêtrière Hospital Group were surveyed between August 1998 and February 2000 by trained interviewers who were blinded to the patients' treatment. Patients identified all side effects associated with their treatment using a set of 45 cards that named physical side effects (Group A) and a set of 27 cards that named nonphysical side effects (Group B), and the patients ranked these side effects according to severity. The top 5 cards from each group were then combined, and the resulting 10 cards were rated again by severity, regardless of group. Results were analyzed for the entire cohort and for demographic, social, and clinical subgroups. RESULTS The participants included 65 women and 35 men; the most common malignancies were breast carcinoma (40 patients), gastrointestinal carcinoma (19 patients), lung carcinoma (7 patients), and ovarian carcinoma (9 patients). Patients rated affects my family or partner as the most severe side effect, alopecia was second, and fatigue was the third most severe. Effects on work or home responsibilities, effects on social activities, and loss of interest in sex were ranked fourth, fifth, and sixth, respectively. The results contrasted with those of Coates et al., in which affects my family or partner was ranked 10th, and fatigue was ranked 8th. CONCLUSIONS Patient perceptions of the side effects of cancer chemotherapy have changed markedly. In the current study, fatigue and psychosocial QoL concerns predominated, compared with emesis, nausea, and negative reactions to the treatment visit in the original survey. The current findings are consistent with the progress that has been made in reducing certain chemotherapy‐associated toxicities. Fatigue, however, although it often is related to anemia and is treatable with recombinant human erythropoietin, remains a major concern. The emotional, social, and sexual consequences of cancer treatment present continuing challenges in efforts to optimize QoL and to develop effective supportive care. Cancer 2002;95:155–63. © 2002 American Cancer Society. DOI 10.1002/cncr.10630
0
Citation430
0
Save