CJ
Cameron Johnstone
Author with expertise in Role of Long Noncoding RNAs in Cancer and Development
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
2
(100% Open Access)
Cited by:
842
h-index:
27
/
i10-index:
34
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Genomic and epigenetic alterations deregulate microRNA expression in human epithelial ovarian cancer

Lin Zhang et al.May 6, 2008
MicroRNAs (miRNAs) are an abundant class of small noncoding RNAs that function as negative gene regulators. miRNA deregulation is involved in the initiation and progression of human cancer; however, the underlying mechanism and its contributions to genome-wide transcriptional changes in cancer are still largely unknown. We studied miRNA deregulation in human epithelial ovarian cancer by integrative genomic approach, including miRNA microarray ( n = 106), array-based comparative genomic hybridization ( n = 109), cDNA microarray ( n = 76), and tissue array ( n = 504). miRNA expression is markedly down-regulated in malignant transformation and tumor progression. Genomic copy number loss and epigenetic silencing, respectively, may account for the down-regulation of ≈15% and at least ≈36% of miRNAs in advanced ovarian tumors and miRNA down-regulation contributes to a genome-wide transcriptional deregulation. Last, eight miRNAs located in the chromosome 14 miRNA cluster ( Dlk1-Gtl2 domain) were identified as potential tumor suppressor genes. Therefore, our results suggest that miRNAs may offer new biomarkers and therapeutic targets in epithelial ovarian cancer.
0
Citation492
0
Save
0

MicroRNA Microarray Identifies Let-7i as a Novel Biomarker and Therapeutic Target in Human Epithelial Ovarian Cancer

Nuo Yang et al.Dec 15, 2008
Abstract MicroRNAs (miRNA) are approximately 22-nucleotide noncoding RNAs that negatively regulate protein-coding gene expression in a sequence-specific manner via translational inhibition or mRNA degradation. Our recent studies showed that miRNAs exhibit genomic alterations at a high frequency and their expression is remarkably deregulated in ovarian cancer, strongly suggesting that miRNAs are involved in the initiation and progression of this disease. In the present study, we performed miRNA microarray to identify the miRNAs associated with chemotherapy response in ovarian cancer and found that let-7i expression was significantly reduced in chemotherapy-resistant patients (n = 69, P = 0.003). This result was further validated by stem-loop real-time reverse transcription-PCR (n = 62, P = 0.015). Both loss-of-function (by synthetic let-7i inhibitor) and gain-of-function (by retroviral overexpression of let-7i) studies showed that reduced let-7i expression significantly increased the resistance of ovarian and breast cancer cells to the chemotherapy drug, cis-platinum. Finally, using miRNA microarray, we found that decreased let-7i expression was significantly associated with the shorter progression-free survival of patients with late-stage ovarian cancer (n = 72, P = 0.042). This finding was further validated in the same sample set by stem-loop real-time reverse transcription-PCR (n = 62, P = 0.001) and in an independent sample set by in situ hybridization (n = 53, P = 0.049). Taken together, our results strongly suggest that let-7i might be used as a therapeutic target to modulate platinum-based chemotherapy and as a biomarker to predict chemotherapy response and survival in patients with ovarian cancer. [Cancer Res 2008;68(24):10307–14]
0
Citation350
0
Save