We conducted a multi-stage genome-wide association study of natural hair color in more than 10,000 men and women of European ancestry from the United States and Australia. An initial analysis of 528,173 single nucleotide polymorphisms (SNPs) genotyped on 2,287 women identified IRF4 and SLC24A4 as loci highly associated with hair color, along with three other regions encompassing known pigmentation genes. We confirmed these associations in 7,028 individuals from three additional studies. Across these four studies, SLC24A4 rs12896399 and IRF4 rs12203592 showed strong associations with hair color, with p = 6.0×10−62 and p = 7.46×10−127, respectively. The IRF4 SNP was also associated with skin color (p = 6.2×10−14), eye color (p = 6.1×10−13), and skin tanning response to sunlight (p = 3.9×10−89). A multivariable analysis pooling data from the initial GWAS and an additional 1,440 individuals suggested that the association between rs12203592 and hair color was independent of rs1540771, a SNP between the IRF4 and EXOC2 genes previously found to be associated with hair color. After adjustment for rs12203592, the association between rs1540771 and hair color was not significant (p = 0.52). One variant in the MATP gene was associated with hair color. A variant in the HERC2 gene upstream of the OCA2 gene showed the strongest and independent association with hair color compared with other SNPs in this region, including three previously reported SNPs. The signals detected in a region around the MC1R gene were explained by MC1R red hair color alleles. Our results suggest that the IRF4 and SLC24A4 loci are associated with human hair color and skin pigmentation.

IMPORTANCEUse of aspirin and other nonsteroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDs) is associated with lower risk of colorectal cancer.OBJECTIVE To identify common genetic markers that may confer differential benefit from aspirin or NSAID chemoprevention, we tested gene × environment interactions between regular use of aspirin and/or NSAIDs and single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in relation to risk of colorectal cancer. DESIGN, SETTING, AND PARTICIPANTSCase-control study using data from 5 case-control and 5 cohort studies initiated between 1976 and 2003 across the United States, Canada, Australia, and Germany and including colorectal cancer cases (n=8634) and matched controls (n=8553) ascertained between 1976 and 2011.Participants were all of European descent.EXPOSURES Genome-wide SNP data and information on regular use of aspirin and/or NSAIDs and other risk factors. MAIN OUTCOMES AND MEASURES Colorectal cancer.RESULTS Regular use of aspirin and/or NSAIDs was associated with lower risk of colorectal cancer (prevalence, 28% vs 38%; odds ratio [OR], 0.69 [95% CI, 0.64-0.74];P = 6.2 × 10 -28 ) compared with nonregular use.In the conventional logistic regression analysis, the SNP rs2965667 at chromosome 12p12.3near the MGST1 gene showed a genome-wide significant interaction with aspirin and/or NSAID use (P = 4.6 × 10 -9 for interaction).Aspirin and/or NSAID use was associated with a lower risk of colorectal cancer among individuals with rs2965667-TT genotype (prevalence, 28% vs 38%; OR, 0.66 [95% CI, 0.61-0.70];P = 7.7 × 10 -33 ) but with a higher risk among those with rare (4%) TA or AA genotypes (prevalence, 35% vs 29%; OR, 1.89 [95% CI, 1.27-2.81];P = .002).In case-only interaction analysis, the SNP rs16973225 at chromosome 15q25.2near the IL16 gene showed a genome-wide significant interaction with use of aspirin and/or NSAIDs (P = 8.2 × 10 -9 for interaction).Regular use was associated with a lower risk of colorectal cancer among individuals with rs16973225-AA genotype (prevalence, 28% vs 38%; OR, 0.66 [95% CI, 0.62-0.71];P = 1.9 × 10 -30 ) but was not associated with risk of colorectal cancer among those with less common (9%) AC or CC genotypes (prevalence, 36% vs 39%; OR, 0.97 [95% CI, 0.78-1.20];P = .76). CONCLUSIONS AND RELEVANCEIn this genome-wide investigation of gene × environment interactions, use of aspirin and/or NSAIDs was associated with lower risk of colorectal cancer, and this association differed according to genetic variation at 2 SNPs at chromosomes 12 and 15.Validation of these findings in additional populations may facilitate targeted colorectal cancer prevention strategies.