Transient environmental exposures during mammalian development can permanently alter gene expression and metabolism by influencing the establishment of epigenetic gene regulatory mechanisms. The genomic characteristics that confer such epigenetic plasticity upon specific loci, however, have not been characterized. Methyl donor supplementation of female mice before and during pregnancy permanently increases DNA methylation at the viable yellow agouti (A(vy)) metastable epiallele in the offspring. The current study tested whether another murine metastable epiallele, axin fused (Axin(Fu)), similarly exhibits epigenetic plasticity to maternal diet. We found that methyl donor supplementation of female mice before and during pregnancy increased DNA methylation at Axin(Fu) and thereby reduced by half the incidence of tail kinking in Axin(Fu)/+ offspring. The hypermethylation was tail-specific, suggesting a mid-gestation effect. Our results indicate that stochastic establishment of epigenotype at metastable epialleles is, in general, labile to methyl donor nutrition, and such influences are not limited to early embryonic development.

The primary objective of this project is to significantly advance the state-of-the-art technologies for detecting and characterizing faults and other geological features above and below a target CO2 injection zone including the basement. The project site is the San Juan Basin CarbonSAFE site (SJB CarbonSAFE) undergoing field deployment of an integrated suite of cost-effective and novel geophysical, geochemical, and geomechanical technologies for the detection and characterization of faults and fractures. This project is supported by the US Department of Energy through a cooperative agreement under DE-FE0032064. This paper presents updates on the integration of proposed technologies to reduce risk in a commercial CO2 injection site.The state-of-the-art technologies deployed as part of the project include: 1) permanently deploy an integrated behind-casing fiber optic sensing system, including Distributed Strain Sensing (DSS), Distributed Temperature Sensing (DTS), and a high-sensitivity Distributed Acoustic Sensing (DAS) system that employs a precision-engineered sensing fiber with 100 times (20dB) lower noise floor than conventional DAS systems, to measure subsurface strain, temperature, microseismicity, and time-lapse seismic changes; 2) utilizing Rock Volatile Stratigraphy (RVStrat), a novel geochemical technology that uses drill cuttings and core to locate faults and aseismic faults, evaluate their effect/participation in the subsurface fluids system (emphasizing CO2) and estimate their size and orientation, and provide insights into fault size and orientation; 3) detecting faults near and more distant from the well bore, including faults in the crystalline basement rock, using a novel multi-scale U-Net machine learning method to evaluate 3D surface seismic and 3D vertical seismic profile (VSP) images; 4) performing a wellbore analysis that integrates data available from the SJB CarbonSAFE project including Borehole Acoustic Reflection survey 3D Far-Field Sonic Service dipole sonic, VSP, Diagnostic Formation Integrity Test (DFIT), and fiber measurements coupled with finite element analysis, to identify formation structures such as fractures and faults, and characterize formation geomechanical behavior at different scales; 5) integrating information and analyses from the proposed technologies and developing advanced rock physics and coupled thermo-hydrodynamic-mechanical models in combination with the Monte Carlo method, to determine the state of stress on each mapped fault and estimate long-term slip potential and/or maximum fault slip potential resulting from large-scale CO2 injection.