A pair of degenerate PCR primers (FAP59/64) was designed from two relatively conserved regions of the L1 open reading frame of most human papillomaviruses (HPV). The size of the generated amplicon was about 480 bp. PCR using these primers was found capable of amplifying DNA from 87% (65/75) of the HPV types tested, its sensitivity being 1-10 copies for HPV-5, -20 and -30 clones. HPV was found in 63% (5/8) of tumour samples and in 63% (5/8) of normal skin biopsies from patients with various cutaneous tumours. HPV-5, HPV-8, HPV-12, HPVvs20-4 and six putatively novel HPV types were identified. No correlation was found to exist between specific HPV and tumour types. Skin surface swab samples from one or more sites on three of four healthy volunteers were found to contain HPV, types 12 and 49 being identified, as well as eight novel HPV types, two of which were also found among the patients. In all, HPV was detected in 75% (9/12) of those tested, five HPV types and 12 novel candidate types being identified, and 37% (7/19) of HPV-positive samples were found to manifest more than one HPV type. All the HPV detected manifested high degrees of nucleotide sequence similarity with HPV types associated with skin lesions and epidermodysplasia verruciformis. The overall HPV finding in the skin samples was 50% (20/40) using the FAP primers as compared to 18% (7/40) using another PCR test designed for skin types. The results thus suggest the new method to be sensitive and generally applicable for detecting cutaneous HPV.

ABSTRACT Human papillomaviruses (HPV) are epitheliotropic viruses, with some types suggested to be associated with skin cancer. In this study, swab samples collected from five different sites on the skin of renal transplant recipients, dialysis patients, and age- and sex-matched healthy controls were analyzed for HPV DNA by a newly designed PCR test. Most individuals were found to have asymptomatic HPV infections; more specifically, 94% of the renal transplant patients, 82% of the dialysis patients, and 80% of the healthy controls were positive for HPV DNA. The multiplicity of the HPVs detected was astounding: 20 previously described and 30 putatively new types were identified by cloning and sequencing of 33 samples from 13 individuals. These results demonstrate that normal human skin harbors an array of papillomaviruses, most of them previously unknown.

Cancer is a leading cause of disease burden in Australia, particularly fatal burden, accounting for an estimated thirty percent of deaths. Many cancers develop because of exposure to lifestyle and environmental factors that are potentially modifiable. We aimed to quantify the proportions and numbers of cancer deaths and cases in Australia in 2013 attributable to 20 modifiable factors in eight broad groupings that are established causes of cancer, namely: tobacco smoke (smoking and second‐hand), dietary factors (low intake of fruit, non‐starchy vegetables and dietary fibre; and high intake of red and processed meat), overweight/obesity, alcohol, physical inactivity, solar ultraviolet radiation, infections (seven agents), and reproductive factors (lack of breastfeeding, menopausal hormone therapy use, combined oral contraceptive use). We estimated population attributable fractions (PAF) using standard formulae incorporating exposure prevalence and relative risk data. Of all cancer deaths in Australia in 2013, approximately 38% overall (males 41%, females 34%) could be attributed to the factors assessed; the corresponding PAF for cancer cases was 33% (males 34%, females 32%). Tobacco smoke was the leading cause of cancer deaths and cases, with PAFs of 23 and 13%, respectively, followed by dietary factors (5% deaths/5% cases), overweight/obesity (5%/4%) and infections (5%/3%). Cancer sites with the highest numbers of potentially preventable deaths/cases were lung ( n = 6,776/9,272), colorectum ( n = 1,974/7,380) and cutaneous melanoma ( n = 1,390/7,918). We estimate that about 16,700 cancer deaths and 41,200 cancer cases could be prevented in Australia each year if people's exposures to 20 causal factors were aligned with levels recommended to minimise cancer risk.