Prostate cancer (PCa) is one of the most common cancers among men worldwide, and robot-assisted radical prostatectomy (RARP) is a widely used treatment for localized PCa. Achieving pentafecta outcomes, which include continence, potency, cancer control, free surgical margins, and no major complications, is a critical measure of surgical success and long-term prognosis. However, predicting these outcomes remains challenging. In this retrospective, single-center study, we analyzed data from 1,752 patients who underwent RARP for localized prostate adenocarcinoma between August 2009 and April 2023. The pentafecta outcome was achieved in 290 patients (16.6%). Multivariate analysis revealed that bilateral nerve sparing significantly increased the likelihood of achieving the pentafecta outcome (odds ratio 10.36, 95% CI: 5.75–18.66; p < 0.001). Preoperative potency and bilateral nerve sparing were also identified as key predictors. Nomograms were developed using preoperative and postoperative variables, including age, PSA level, biopsy Gleason score, clinical stage, pathological tumor stage, tumor grade, nerve sparing, and preoperative potency. Internal validation of the nomograms was performed using bootstrapping methods, demonstrating robust predictive performance. These nomograms provide valuable tools for personalized surgical planning and patient counseling and may be applicable to broader populations, given the inclusion of universally recognized predictive factors and rigorous validation. This study presents the development and validation of nomograms to predict pentafecta outcomes before and after RARP. These nomograms provide valuable tools for clinicians to estimate the likelihood of achieving postoperative pentafecta outcomes. Incorporating these nomograms into clinical practice may improve patient counseling and shared decision-making.

10027 Background: The real-time nature of nanopore sequencing allows for simultaneous basecalling of DNA sequences during sequencing. This unique capability enables adaptive sampling (AS), a software-controlled targeted sequencing method. AS is notable for its ability to rapidly and flexibly enrich multiple genes with long fragment reads and detect various modalities of genetic aberrations in a single run. However, the feasibility and significance of AS for cancer have not been previously reported. Methods: We performed AS on a GridION sequencer using samples from 28 pediatric leukemia patients (10 acute myeloid leukemia, 13 B-cell acute lymphoblastic leukemia, and 5 T-cell acute lymphoblastic leukemia). Target regions were comprised of 466 genes associated with hematologic malignancies and included 30-kilo base pairs of flanking regions. After 3 days of sequencing, single-nucleotide variants (SNVs), structural variations (SVs), and copy number variations (CNVs) were determined. In 21 samples, variant calling accuracy was evaluated using short-read-based whole genome sequencing (WGS). Results: In the on-target regions, mean depth was 21.0× and N50 was 11,191 bps at the median. Of the 13 samples with genetic alterations previously detected through clinical testing for diagnostic classifications, all were reconfirmed by AS. Detecting DUX4 rearrangement needed an additional analysis pipeline because of its structural complexity. Among the 15 remaining samples whose genetic alterations had not been determined by clinical diagnostic testing, AS identified putative driver aberrations in 14 samples. All of these genomic abnormalities were structural variations (SVs) or copy number variations (CNVs), most of which were not encompassed within the genes or regions targeted in clinical diagnostic testing. Detected SVs were described with accurate genomic breakpoints, enabling the efficient detection of gene rearrangements and deletions of the entire region of an exon or a gene. Regarding CNVs, both chromosomal-level CNVs, such as high-hyperdiploid, and focal CNVs, such as CDKN2A deletion, were detectable using genome-wide low-coverage reads in the off-target regions. In the other case with acute myeloid leukemia in which genetic abnormalities were not detected either by clinical testing or AS, WGS identified an NPM1 frameshift deletion located outside of known hotspots. Among variants identified by WGS, AS detected 60.9% of the SNVs, 17.6% of the small indels, and 89.2% of the SVs, with a tendency of poor detection efficiency for variants with low variant allele frequency. Conclusions: AS provides a rapid and precise description of the genomic profile of pediatric leukemia, particularly advantageous for identifying SVs and CNVs, which are difficult to detect by capture-based short-read sequencing.