BY
Bo Yuan
Author with expertise in Global Analysis of Ecosystem Services and Land Use
Achievements
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
4
(50% Open Access)
Cited by:
0
h-index:
28
/
i10-index:
73
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Error-Reduced Digital Elevation Model of the Qinghai-Tibet Plateau using ICESat-2 and Fusion Model

Xingang Zhang et al.Jun 5, 2024
Abstract The Qinghai-Tibet Plateau (QTP) holds significance for investigating Earth’s surface processes. However, due to rugged terrain, forest canopy, and snow accumulation, open-access Digital Elevation Models (DEMs) exhibit considerable noise, resulting in low accuracy and pronounced data inconsistency. Furthermore, the glacier regions within the QTP undergo substantial changes, necessitating updates. This study employs a fusion of open-access DEMs and high-accuracy photons from the Ice, Cloud, and land Elevation Satellite-2 (ICESat-2). Additionally, snow cover and canopy heights are considered, and an ensemble learning fusion model is presented to harness the complementary information in the multi-sensor elevation observations. This innovative approach results in the creation of HQTP30, the most accurate representation of the 2021 QTP terrain. Comparative analysis with high-resolution imagery, UAV-derived DEMs, control points, and ICESat-2 highlights the advantages of HQTP30. Notably, in non-glacier regions, HQTP30 achieved a Mean Absolute Error (MAE) of 0.71 m, while in glacier regions, it reduced the MAE by 4.35 m compared to the state-of-the-art Copernicus DEM (COPDEM), demonstrating its versatile applicability.
0

DNA-binding affinity and specificity determine the phenotypic diversity in BCL11B-related disorders

Ivana Lessel et al.Jan 1, 2025
BCL11B is a Cys2-His2 zinc-finger (C2H2-ZnF) domain-containing, DNA-binding, transcription factor with established roles in the development of various organs and tissues, primarily the immune and nervous systems. BCL11B germline variants have been associated with a variety of developmental syndromes. However, genotype-phenotype correlations along with pathophysiologic mechanisms of selected variants mostly remain elusive. To dissect these, we performed genotype-phenotype correlations of 92 affected individuals harboring a pathogenic or likely pathogenic BCL11B variant, followed by immune phenotyping, analysis of chromatin immunoprecipitation DNA-sequencing data, dual-luciferase reporter assays, and molecular modeling. These integrative analyses enabled us to define three clinical subtypes of BCL11B-related disorders. It is likely that gene-disruptive BCL11B variants and missense variants affecting zinc-binding cysteine and histidine residues cause mild to moderate neurodevelopmental delay with increased propensity for behavioral and dental anomalies, allergies and asthma, and reduced type 2 innate lymphoid cells. Missense variants within C2H2-ZnF DNA-contacting α helices cause highly variable clinical presentations ranging from multisystem anomalies with demise in the first years of life to late-onset, hyperkinetic movement disorder with poor fine motor skills. Those not in direct DNA contact cause a milder phenotype through reduced, target-specific transcriptional activity. However, missense variants affecting C2H2-ZnFs, DNA binding, and "specificity residues" impair BCL11B transcriptional activity in a target-specific, dominant-negative manner along with aberrant regulation of alternative DNA targets, resulting in more severe and unpredictable clinical outcomes. Taken together, we suggest that the phenotypic severity and variability is largely dependent on the DNA-binding affinity and specificity of altered BCL11B proteins.
0

Prognostic Implications of Cardiac Geometry in Cirrhosis: Findings From a Large Cohort

Yu Jia et al.Jan 3, 2025
ABSTRACT Background and Aims Cirrhosis is characterised by hyperdynamic circulation, which contributes to cirrhotic cardiomyopathy (CCM). However, the expert consensus on CCM did not initially include cardiac structure because of scant evidence. Therefore, this study investigated the associations of cardiac chamber geometry with mortality and CCM. Methods We retrospectively included 2514 cirrhotic patients from 2011 to 2023. In accordance with the guidelines for echocardiography, left ventricular (LV) hypertrophy (LVH) and LV, left atrial (LA), right ventricular (RV), and right atrial (RA) enlargement were evaluated. Cox and logistic regression analyses were performed to examine the relationships among cardiac chamber, all‐cause mortality, and CCM. Results The prevalence rates of LV hypertrophy and LV, LA, RV, and RA enlargement were 21.9%, 21.3%, 30.4%, 5.9%, and 10.9%, respectively. Concentric LVH (HR: 1.305, 95% confidence interval (CI): 1.153–1.466), eccentric LVH (HR: 1.272, 95% CI: 1.139–1.426), LV enlargement (HR: 1.305, 95% CI: 1.153–1.466), and LA enlargement (HR: 1.254, 95% CI: 1.130–1.379) were significantly associated with mortality during the median follow‐up of 2.1 years. In a subcohort of 1898 individuals, CCM, with a prevalence of 29.0%, was independently associated with concentric LVH (OR: 1.834, 95% CI: 1.214–2.707), eccentric LVH (OR: 3.063, 95% CI: 2.379–3.903), LV enlargement (OR: 2.519, 95% CI: 2.150–2.977), LA enlargement (OR: 3.559, 95% CI: 2.770–4.321), and RA enlargement (OR: 1.416, 95% CI: 1.025–1.915). LV abnormalities showed 90% specificity and 35% sensitivity for CCM diagnosis. Conclusions Geometric pattern changes in the LV and LA are prevalent and independently associated with all‐cause mortality and CCM. These indicators have potential for hazard stratification and CCM redefinition.