EP
Ellen Press
Author with expertise in Global Challenge of Antibiotic Resistance in Bacteria
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
6
(100% Open Access)
Cited by:
1,952
h-index:
24
/
i10-index:
26
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Emergence of Ceftazidime-Avibactam Resistance Due to Plasmid-Borne bla KPC-3 Mutations during Treatment of Carbapenem-Resistant Klebsiella pneumoniae Infections

Ryan Shields et al.Dec 29, 2016
ABSTRACT Ceftazidime-avibactam is a novel β-lactam/β-lactamase inhibitor with activity against carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE) that produce Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC). We report the first cases of ceftazidime-avibactam resistance to develop during treatment of CRE infections and identify resistance mechanisms. Ceftazidime-avibactam-resistant K. pneumoniae emerged in three patients after ceftazidime-avibactam treatment for 10 to 19 days. Whole-genome sequencing (WGS) of longitudinal ceftazidime-avibactam-susceptible and -resistant K. pneumoniae isolates was used to identify potential resistance mechanisms. WGS identified mutations in plasmid-borne bla KPC-3 , which were not present in baseline isolates. bla KPC-3 mutations emerged independently in isolates of a novel sequence type 258 sublineage and resulted in variant KPC-3 enzymes. The mutations were validated as resistance determinants by measuring MICs of ceftazidime-avibactam and other agents following targeted gene disruption in K. pneumoniae , plasmid transfer, and bla KPC cloning into competent Escherichia coli . In rank order, the impact of KPC-3 variants on ceftazidime-avibactam MICs was as follows: D179Y/T243M double substitution > D179Y > V240G. Remarkably, mutations reduced meropenem MICs ≥4-fold from baseline, restoring susceptibility in K. pneumoniae from two patients. Cefepime and ceftriaxone MICs were also reduced ≥4-fold against D179Y/T243M and D179Y variant isolates, but susceptibility was not restored. Reverse transcription-PCR revealed that expression of bla KPC-3 encoding D179Y/T243M and D179Y variants was diminished compared to bla KPC-3 expression in baseline isolates. In conclusion, the development of resistance-conferring bla KPC-3 mutations in K. pneumoniae within 10 to 19 days of ceftazidime-avibactam exposure is troubling, but clinical impact may be ameliorated if carbapenem susceptibility is restored in certain isolates.
0
Citation401
0
Save
0

Performance of Candida Real-time Polymerase Chain Reaction, -D-Glucan Assay, and Blood Cultures in the Diagnosis of Invasive Candidiasis

M. Nguyen et al.Mar 19, 2012
Background.The sensitivity of blood cultures for diagnosing invasive candidiasis (IC) is poor.Methods.We performed a validated Candida real-time polymerase chain reaction (PCR) and the Fungitell 1,3-b-D-glucan (BDG) assay on blood samples collected from prospectively identified patients with IC (n 5 55) and hospitalized controls (n 5 73).Patients with IC had candidemia (n 5 17), deep-seated candidiasis (n 5 33), or both (n 5 5).Controls had mucosal candidiasis (n 5 5), Candida colonization (n 5 48), or no known Candida colonization (n 5 20).Results.PCR using plasma or sera was more sensitive than whole blood for diagnosing IC (P 5 .008).Plasma or sera PCR was more sensitive than BDG in diagnosing IC (80% vs 56%; P 5 .03),with comparable specificity (70% vs 73%; P 5 .31).The tests were similar in diagnosing candidemia (59% vs 68%; P 5 .77),but PCR was more sensitive for deep-seated candidiasis (89% vs 53%; P 5 .004).PCR and BDG were more sensitive than blood cultures among patients with deep-seated candidiasis (88% and 62% vs 17%; P 5 .0005and .003,respectively).PCR and culture identified the same Candida species in 82% of patients.The sensitivity of blood cultures combined with PCR or BDG among patients with IC was 98% and 79%, respectively.Conclusions.Candida PCR and, to a lesser extent, BDG testing significantly enhanced the ability of blood cultures to diagnose IC.
0

Ceftolozane-Tazobactam for the Treatment of Multidrug-Resistant Pseudomonas aeruginosa Infections: Clinical Effectiveness and Evolution of Resistance

Ghady Haidar et al.Feb 25, 2017
Data on the use of ceftolozane-tazobactam and emergence of ceftolozane-tazobactam resistance during multidrug resistant (MDR)-Pseudomonas aeruginosa infections are limited.We performed a retrospective study of 21 patients treated with ceftolozane-tazobactam for MDR-P. aeruginosa infections. Whole genome sequencing and quantitative real-time polymerase chain reaction were performed on longitudinal isolates.Median age was 58 years; 9 patients (43%) were transplant recipients. Median simplified acute physiology score-II (SAPS-II) was 26. Eighteen (86%) patients were treated for respiratory tract infections; others were treated for bloodstream, complicated intraabdominal infections, or complicated urinary tract infections. Ceftolozane-tazobactam was discontinued in 1 patient (rash). Thirty-day all-cause and attributable mortality rates were 10% (2/21) and 5% (1/21), respectively; corresponding 90-day mortality rates were 48% (10/21) and 19% (4/21). The ceftolozane-tazobactam failure rate was 29% (6/21). SAPS-II score was the sole predictor of failure. Ceftolozane-tazobactam resistance emerged in 3 (14%) patients. Resistance was associated with de novo mutations, rather than acquisition of resistant nosocomial isolates. ampC overexpression and mutations were identified as potential resistance determinants.In this small study, ceftolozane-tazobactam was successful in treating 71% of patients with MDR-P. aeruginosa infections, most of whom had pneumonia. The emergence of ceftolozane-tazobactam resistance in 3 patients is worrisome and may be mediated in part by AmpC-related mechanisms. More research on treatment responses and resistance during various types of MDR-P. aeruginosa infections is needed to define ceftolozane-tazobactam's place in the armamentarium.
0
Citation250
0
Save
0

Pneumonia and Renal Replacement Therapy Are Risk Factors for Ceftazidime-Avibactam Treatment Failures and Resistance among Patients with Carbapenem-Resistant Enterobacteriaceae Infections

Ryan Shields et al.Mar 1, 2018
ABSTRACT Ceftazidime-avibactam was used to treat 77 patients with carbapenem-resistant Enterobacteriaceae (CRE) infections at our center. Thirty- and 90-day survival rates were 81% and 69%, respectively; these rates were higher than those predicted by SAPS II and SOFA scores at the onset of infection. Clinical success was achieved for 55% of patients but differed by the site of infection. Success rates were lowest for pneumonia (36%) and higher for bacteremia (75%) and urinary tract infections (88%). By multivariate analysis, pneumonia ( P = 0.045) and receipt of renal replacement therapy (RRT) ( P = 0.046) were associated with clinical failure. Microbiologic failures occurred in 32% of patients and occurred more commonly among patients infected with KPC-3-producing CRE than among those infected with KPC-2-producing CRE ( P = 0.002). Pneumonia was an independent predictor of microbiologic failure ( P = 0.007). Ceftazidime-avibactam resistance emerged in 10% of patients, including 14% of those infected with Klebsiella pneumoniae and 32% of those with microbiologic failure. RRT was an independent predictor of the development of resistance ( P = 0.009). Resistance was identified exclusively among K. pneumoniae bacteria harboring variant KPC-3 enzymes. Upon phylogenetic analysis of whole-genome sequences, resistant isolates from 87.5% (7/8) of patients clustered within a previously defined sequence type 258 (ST258) clade II sublineage; resistant isolates from one patient clustered independently from other ST258 clade II isolates. In conclusion, our report offers new insights into the utility and limitations of ceftazidime-avibactam across CRE infection types. Immediate priorities are to identify ceftazidime-avibactam dosing and therapeutic regimens that improve on the poor outcomes among patients with pneumonia and those receiving RRT.
0
Citation249
0
Save