AF
Alan Fryer
Author with expertise in Molecular Mechanisms of Cardiac Development and Regeneration
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
8
(88% Open Access)
Cited by:
2,052
h-index:
57
/
i10-index:
113
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Distinct genetic architectures for syndromic and nonsyndromic congenital heart defects identified by exome sequencing

Alejandro Sifrim et al.Aug 1, 2016
Matthew Hurles and colleagues report exome sequencing of 1,891 individuals with syndromic or nonsyndromic congenital heart defects (CHD). They found that nonsyndromic CHD patients were enriched for protein-truncating variants in CHD-associated genes inherited from unaffected parents and identified three new syndromic CHD disorders caused by de novo mutations. Congenital heart defects (CHDs) have a neonatal incidence of 0.8–1% (refs. 1,2). Despite abundant examples of monogenic CHD in humans and mice, CHD has a low absolute sibling recurrence risk (∼2.7%)3, suggesting a considerable role for de novo mutations (DNMs) and/or incomplete penetrance4,5. De novo protein-truncating variants (PTVs) have been shown to be enriched among the 10% of 'syndromic' patients with extra-cardiac manifestations6,7. We exome sequenced 1,891 probands, including both syndromic CHD (S-CHD, n = 610) and nonsyndromic CHD (NS-CHD, n = 1,281). In S-CHD, we confirmed a significant enrichment of de novo PTVs but not inherited PTVs in known CHD-associated genes, consistent with recent findings8. Conversely, in NS-CHD we observed significant enrichment of PTVs inherited from unaffected parents in CHD-associated genes. We identified three genome-wide significant S-CHD disorders caused by DNMs in CHD4, CDK13 and PRKD1. Our study finds evidence for distinct genetic architectures underlying the low sibling recurrence risk in S-CHD and NS-CHD.
0
Citation384
0
Save
0

The prevalence of neurodevelopmental disorders in children prenatally exposed to antiepileptic drugs

L Kerr et al.Jan 31, 2013
The aim of this study was to compare the prevalence of diagnosed neurodevelopmental disorders in children exposed, in utero, to different antiepileptic drug treatments. A prospective cohort of women with epilepsy and a control group of women without epilepsy were recruited from antenatal clinics. The children of this cohort were followed longitudinally until 6 years of age (n=415). Diagnosis of a neurodevelopmental disorder was made independently of the research team. Multiple logistic regression analysis revealed an increase in risk of neurodevelopmental disorders in children exposed to monotherapy sodium valproate (VPA) (6/50, 12.0%; aOR 6.05, 95%CI 1.65 to 24.53, p=0.007) and in those exposed to polytherapy with sodium VPA (3/20, 15.0%; aOR 9.97, 95% CI 1.82 to 49.40, p=0.005) compared with control children (4/214; 1.87%). Autistic spectrum disorder was the most frequent diagnosis. No significant increase was found among children exposed to carbamazepine (1/50) or lamotrigine (2/30). An accumulation of evidence demonstrates that the risks associated with prenatal sodium VPA exposure include an increased prevalence of neurodevelopmental disorders. Whether such disorders are discrete or represent the severe end of a continuum of altered neurodevelopmental functioning requires further investigation. Replication and extension of this research is required to investigate the mechanism(s) underpinning the relationship. Finally, the increased likelihood of neurodevelopmental disorders should be communicated to women for whom sodium VPA is a treatment option.
0
Citation324
0
Save
0

IQ at 6 years after in utero exposure to antiepileptic drugs

Gus Baker et al.Dec 25, 2014
To delineate the risk to child IQ associated with frequently prescribed antiepileptic drugs.Children born to women with epilepsy (n = 243) and women without epilepsy (n = 287) were recruited during pregnancy and followed prospectively. Of these, 408 were blindly assessed at 6 years of age. Maternal and child demographics were collected and entered into statistical models.The adjusted mean IQ was 9.7 points lower (95% confidence interval [CI] -4.9 to -14.6; p < 0.001) for children exposed to high-dose (>800 mg daily) valproate, with a similar significant effect observed for the verbal, nonverbal, and spatial subscales. Children exposed to high-dose valproate had an 8-fold increased need of educational intervention relative to control children (adjusted relative risk, 95% CI 8.0, 2.5-19.7; p < 0.001). Valproate at doses <800 mg daily was not associated with reduced IQ, but was associated with impaired verbal abilities (-5.6, 95% CI -11.1 to -0.1; p = 0.04) and a 6-fold increase in educational intervention (95% CI 1.4-18.0; p = 0.01). In utero exposure to carbamazepine or lamotrigine did not have a significant effect on IQ, but carbamazepine was associated with reduced verbal abilities (-4.2, 95% CI -0.6 to -7.8; p = 0.02) and increased frequency of IQ <85.Consistent with data from younger cohorts, school-aged children exposed to valproate at maternal doses more than 800 mg daily continue to experience significantly poorer cognitive development than control children or children exposed to lamotrigine and carbamazepine.
0
Citation239
0
Save
0

Tumour risks and genotype–phenotype correlations associated with germline variants in succinate dehydrogenase subunit genes SDHBSDHC and SDHD

Katrina Andrews et al.Jan 31, 2018
Background Germline pathogenic variants in SDHB/SDHC / SDHD are the most frequent causes of inherited phaeochromocytomas/paragangliomas. Insufficient information regarding penetrance and phenotypic variability hinders optimum management of mutation carriers. We estimate penetrance for symptomatic tumours and elucidate genotype–phenotype correlations in a large cohort of SDHB/SDHC / SDHD mutation carriers. Methods A retrospective survey of 1832 individuals referred for genetic testing due to a personal or family history of phaeochromocytoma/paraganglioma. 876 patients (401 previously reported) had a germline mutation in SDHB/SDHC / SDHD (n=673/43/160). Tumour risks were correlated with in silico structural prediction analyses. Results Tumour risks analysis provided novel penetrance estimates and genotype–phenotype correlations. In addition to tumour type susceptibility differences for individual genes, we confirmed that the SDHD: p.Pro81Leu mutation has a distinct phenotype and identified increased age-related tumour risks with highly destabilising SDHB missense mutations. By Kaplan-Meier analysis, the penetrance (cumulative risk of clinically apparent tumours) in SDHB and (paternally inherited) SDHD mutation-positive non-probands (n=371/67 with detailed clinical information) by age 60 years was 21.8% (95% CI 15.2% to 27.9%) and 43.2% (95% CI 25.4% to 56.7%), respectively. Risk of malignant disease at age 60 years in non-proband SDHB mutation carriers was 4.2%(95% CI 1.1% to 7.2%). With retrospective cohort analysis to adjust for ascertainment, cumulative tumour risks for SDHB mutation carriers at ages 60 years and 80 years were 23.9% (95% CI 20.9% to 27.4%) and 30.6% (95% CI 26.8% to 34.7%). Conclusions Overall risks of clinically apparent tumours for SDHB mutation carriers are substantially lower than initially estimated and will improve counselling of affected families. Specific genotype–tumour risk associations provides a basis for novel investigative strategies into succinate dehydrogenase-related mechanisms of tumourigenesis and the development of personalised management for SDHB/SDHC / SDHD mutation carriers.
0
Citation196
0
Save