JR
Jean‐Paul Roustan
Author with expertise in Factors Influencing Fruit Ripening and Quality
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
5
(80% Open Access)
Cited by:
1,129
h-index:
31
/
i10-index:
47
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

SlARF4, an Auxin Response Factor Involved in the Control of Sugar Metabolism during Tomato Fruit Development

Maha Sagar et al.Jan 22, 2013
Abstract Successful completion of fruit developmental programs depends on the interplay between multiple phytohormones. However, besides ethylene, the impact of other hormones on fruit quality traits remains elusive. A previous study has shown that down-regulation of SlARF4, a member of the tomato (Solanum lycopersicum) auxin response factor (ARF) gene family, results in a dark-green fruit phenotype with increased chloroplasts (Jones et al., 2002). This study further examines the role of this auxin transcriptional regulator during tomato fruit development at the level of transcripts, enzyme activities, and metabolites. It is noteworthy that the dark-green phenotype of antisense SlARF4-suppressed lines is restricted to fruit, suggesting that SlARF4 controls chlorophyll accumulation specifically in this organ. The SlARF4 underexpressing lines accumulate more starch at early stages of fruit development and display enhanced chlorophyll content and photochemical efficiency, which is consistent with the idea that fruit photosynthetic activity accounts for the elevated starch levels. SlARF4 expression is high in pericarp tissues of immature fruit and then undergoes a dramatic decline at the onset of ripening concomitant with the increase in sugar content. The higher starch content in developing fruits of SlARF4 down-regulated lines correlates with the up-regulation of genes and enzyme activities involved in starch biosynthesis, suggesting their negative regulation by SlARF4. Altogether, the data uncover the involvement of ARFs in the control of sugar content, an essential feature of fruit quality, and provide insight into the link between auxin signaling, chloroplastic activity, and sugar metabolism in developing fruit.
0

Characterization of the Tomato ARF Gene Family Uncovers a Multi-Levels Post-Transcriptional Regulation Including Alternative Splicing

Mohamed Zouine et al.Jan 10, 2014
Background The phytohormone auxin is involved in a wide range of developmental processes and auxin signaling is known to modulate the expression of target genes via two types of transcriptional regulators, namely, Aux/IAA and Auxin Response Factors (ARF). ARFs play a major role in transcriptional activation or repression through direct binding to the promoter of auxin-responsive genes. The present study aims at gaining better insight on distinctive structural and functional features among ARF proteins. Results Building on the most updated tomato (Solanum lycopersicon) reference genome sequence, a comprehensive set of ARF genes was identified, extending the total number of family members to 22. Upon correction of structural annotation inconsistencies, renaming the tomato ARF family members provided a consensus nomenclature for all ARF genes across plant species. In silico search predicted the presence of putative target site for small interfering RNAs within twelve Sl-ARFs while sequence analysis of the 5′-leader sequences revealed the presence of potential small uORF regulatory elements. Functional characterization carried out by transactivation assay partitioned tomato ARFs into repressors and activators of auxin-dependent gene transcription. Expression studies identified tomato ARFs potentially involved in the fruit set process. Genome-wide expression profiling using RNA-seq revealed that at least one third of the gene family members display alternative splicing mode of regulation during the flower to fruit transition. Moreover, the regulation of several tomato ARF genes by both ethylene and auxin, suggests their potential contribution to the convergence mechanism between the signaling pathways of these two hormones. Conclusion All together, the data bring new insight on the complexity of the expression control of Sl-ARF genes at the transcriptional and post-transcriptional levels supporting the hypothesis that these transcriptional mediators might represent one of the main components that enable auxin to regulate a wide range of physiological processes in a highly specific and coordinated manner.
0
Citation183
0
Save
0

Impact of lumbar cerebrospinal fluid drainage to control intracranial hypertension in patients with severe traumatic brain injury: a retrospective monocentric cohort

Geoffrey Dagod et al.Jan 2, 2025
External lumbar drainage (ELD) of cerebrospinal fluid may help control intracranial pressure following a traumatic brain injury. We aimed to assess the efficacy and safety of ELD in post-traumatic intracranial hypertension (IH). This retrospective monocentric cohort study was conducted in the trauma critical care unit of the regional Level-I trauma centre between January 2012 and December 2022. All traumatic brain injury patients with IH (≥ 22 mmHg despite optimal sedation) were included. Data collection focused on the duration and management of IH, complications related to ELD, and outcomes (6-month Glasgow Outcome Scale [GOS]). The influence of ELD on the duration of IH was assessed using a multivariable Cox regression analysis, while its impact on the 6-month GOS ("unfavourable outcome" GOS 1–3, "good outcome" GOS 4–5) was evaluated using a multivariable logistic regression analysis. Ninety patients (mean age 37 [SD, 16], injury severity score [ISS] 29 [IQR, 24–34]) were analyzed during the study period. Of these, 50 (56%) benefited from an ELD during their hospitalization (ELD group). The IH duration was significantly reduced in the ELD group (hazard ratio [HR] 1.74 [95% confidence interval (CI) 1.05–2.87; p = 0.03]). One patient (2%) experienced a cerebral herniation following ELD placement, and two others (4%) developed device-associated meningitis. The ELD group was significantly associated with a lower likelihood of an unfavourable outcome (OR 0.32 [95% CI 0.13–0.77]; p = 0.011) compared to the no ELD group. ELD appears in our cohort to be a safe and effective strategy to control post-traumatic IH, with an acceptable benefit-risk ratio. Our analysis even suggests a potential outcome improvement in patients treated by ELD compared with those having no cerebrospinal fluid drainage.