Mollie Kelly TufmanVerified
Verified Account
Verified
Ph.D. Biochemist | First Author on Developmental Cell Publication | Experienced Peer Reviewer and Scientific Editor
Biochemical Sciences PhD '14, Drexel University
Member for 2 months and 27 days
I'm a Ph.D. biochemist with a passion for peer reviewing, editing, and scientific writing. I’ve been fortunate enough to contribute to significant research, including serving as the first author on a high-impact Developmental Cell publication focused on cardiovascular development. With experience in...
Show more
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Peer Reviewer
Key Stats
Upvotes received:
9
Publications:
7
(86% Open Access)
Cited by:
250
h-index:
0
/
i10-index:
0
Reputation
Epidemiology
69%
Molecular Biology
50%
Cellular And Molecular Neuroscience
9%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Hepatitis B Virus Capsid Assembly Modulators, but Not Nucleoside Analogs, Inhibit the Production of Extracellular Pregenomic RNA and Spliced RNA Variants

Angela Lam et al.May 31, 2017
ABSTRACT The hepatitis B virus (HBV) core protein serves multiple essential functions in the viral life cycle, and antiviral agents that target the core protein are being developed. Capsid assembly modulators (CAMs) are compounds that target core and misdirect capsid assembly, resulting in the suppression of HBV replication and virion production. Besides HBV DNA, circulating HBV RNA has been detected in patient serum and can be associated with the treatment response. Here we studied the effect of HBV CAMs on the production of extracellular HBV RNA using infected HepaRG cells and primary human hepatocytes. Representative compounds from the sulfonamide carboxamide and heteroaryldihydropyrimidine series of CAMs were evaluated and compared to nucleos(t)ide analogs as inhibitors of the viral polymerase. The results showed that CAMs blocked extracellular HBV RNA with efficiencies similar to those with which they blocked pregenomic RNA (pgRNA) encapsidation, HBV DNA replication, and Dane particle production. Nucleos(t)ide analogs inhibited viral replication and virion production but not encapsidation or production of extracellular HBV RNA. Profiling of HBV RNA from both culture supernatants and patient serum showed that extracellular viral RNA consisted of pgRNA and spliced pgRNA variants with an internal deletion(s) but still retained the sequences at both the 5′ and 3′ ends. Similar variants were detected in the supernatants of infected cells with and without nucleos(t)ide analog treatment. Overall, our data demonstrate that HBV CAMs represent direct antiviral agents with a profile differentiated from that of nucleos(t)ide analogs, including the inhibition of extracellular pgRNA and spliced pgRNA.
0
Citation90
0
Save
0

Preclinical Characterization of NVR 3-778, a First-in-Class Capsid Assembly Modulator against Hepatitis B Virus

Angela Lam et al.Oct 26, 2018
NVR 3-778 is the first capsid assembly modulator (CAM) that has demonstrated antiviral activity in hepatitis B virus (HBV)-infected patients. NVR 3-778 inhibited the generation of infectious HBV DNA-containing virus particles with a mean antiviral 50% effective concentration (EC50) of 0.40 µM in HepG2.2.15 cells. The antiviral profile of NVR 3-778 indicates pan-genotypic antiviral activity and a lack of cross-resistance with nucleos(t)ide inhibitors of HBV replication. The combination of NVR 3-778 with nucleos(t)ide analogs in vitro resulted in additive or synergistic antiviral activity. Mutations within the hydrophobic pocket at the dimer-dimer interface of the core protein could confer resistance to NVR 3-778, which is consistent with the ability of the compound to bind to core and to induce capsid assembly. By targeting core, NVR 3-778 inhibits pregenomic RNA encapsidation, viral replication, and the production of HBV DNA- and HBV RNA-containing particles. NVR 3-778 also inhibited de novo infection and viral replication in primary human hepatocytes with EC50 values of 0.81 µM against HBV DNA and between 3.7 and 4.8 µM against the production of HBV antigens and intracellular HBV RNA. NVR 3-778 showed favorable pharmacokinetics and safety in animal species, allowing serum levels in excess of 100 µM to be achieved in mice and, thus, enabling efficacy studies in vivo The overall preclinical profile of NVR 3-778 predicts antiviral activity in vivo and supports its further evaluation for safety, pharmacokinetics, and antiviral activity in HBV-infected patients.
0
Paper
Citation56
0
Save
0

Getting Smart about p21-Activated Kinases

Mollie Kelly Tufman et al.Nov 30, 2010
p21-activated kinases (PAKs) are a family of Cdc42/Racactivated serine/threonine kinases involved in a variety of cellular processes, such as motility, migration, and cytoskeletal reorganization (1).Various members of the PAK family are known to influence brain development and cognitive function, but there remain many unanswered questions regarding PAK functions in neurons, the significance of individual PAK isoforms, and their molecular mechanisms of action (5).A new genetic study by Huang and colleagues provides insight into how murine PAKs, specifically PAK1 and PAK3, are involved in brain development through morphogenesis of dendritic spines, as well as development of synaptic networks (4).As PAK3 mutations in humans cause mental retardation (3), the findings in this new study may lead to new approaches to treat disorders of cognitive function.On structural and biochemical grounds, the PAK family of kinases can be divided into two groups, group I (PAK1, -2, and -3) and group II (PAK4, -5, and -6) (1).All PAKs contain a highly conserved N-terminal Cdc42/Rac-binding domain and C-terminal protein kinase domain but differ substantially between these two domains.Within the group I PAKs, PAK1 and PAK3 are nearly identical in amino acid sequences (81% overall and Ͼ95% in the Cdc42/Rac-binding and kinase domains), and both are highly expressed in the brain.These features
0
Citation9
0
Save