TN
Tri‐Long Nguyen
Author with expertise in Preprints in Scientific Communication
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
4
(100% Open Access)
Cited by:
404
h-index:
14
/
i10-index:
18
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Double-adjustment in propensity score matching analysis: choosing a threshold for considering residual imbalance

Tri‐Long Nguyen et al.Apr 28, 2017
Double-adjustment can be used to remove confounding if imbalance exists after propensity score (PS) matching. However, it is not always possible to include all covariates in adjustment. We aimed to find the optimal imbalance threshold for entering covariates into regression. We conducted a series of Monte Carlo simulations on virtual populations of 5,000 subjects. We performed PS 1:1 nearest-neighbor matching on each sample. We calculated standardized mean differences across groups to detect any remaining imbalance in the matched samples. We examined 25 thresholds (from 0.01 to 0.25, stepwise 0.01) for considering residual imbalance. The treatment effect was estimated using logistic regression that contained only those covariates considered to be unbalanced by these thresholds. We showed that regression adjustment could dramatically remove residual confounding bias when it included all of the covariates with a standardized difference greater than 0.10. The additional benefit was negligible when we also adjusted for covariates with less imbalance. We found that the mean squared error of the estimates was minimized under the same conditions. If covariate balance is not achieved, we recommend reiterating PS modeling until standardized differences below 0.10 are achieved on most covariates. In case of remaining imbalance, a double adjustment might be worth considering.
0

‘Standing together – at a distance’: Documenting changes in mental-health indicators in Denmark during the COVID-19 pandemic

Amy Clotworthy et al.Sep 10, 2020
Aims: There is a need to document the mental-health effects of the COVID-19 pandemic and its associated societal lockdowns. We initiated a large mixed-methods data collection, focusing on crisis-specific worries and mental-health indicators during the lockdown in Denmark. Methods: The study incorporated five data sources, including quantitative surveys and qualitative interviews. The surveys included a time series of cross-sectional online questionnaires starting on 20 March 2020, in which 300 (3×100) Danish residents were drawn every three days from three population groups: the general population ( N=1046), families with children ( N=1032) and older people ( N=1059). These data were analysed by trend analysis. Semi-structured interviews were conducted with 32 people aged 24–83 throughout Denmark to provide context to the survey results and to gain insight into people’s experiences of the lockdown. Results: Absolute level of worries, quality of life and social isolation were relatively stable across all population groups during the lockdown, although there was a slight deterioration in older people’s overall mental health. Many respondents were worried about their loved ones’ health (74–76%) and the potential long-term economic consequences of the pandemic (61–66%). The qualitative interviews documented significant variation in people’s experiences, suggesting that the lockdown’s effect on everyday life had not been altogether negative. Conclusions: People in Denmark seem to have managed the lockdown without alarming changes in their mental health. However, it is important to continue investigating the effects of the pandemic and various public-health measures on mental health over time and across national contexts.
0
Citation61
0
Save
0

Saving time and money in biomedical publishing: the case for free-format submissions with minimal requirements

Amy Clotworthy et al.May 10, 2023
Abstract Background Manuscript preparation and the (re)submission of articles can create a significant workload in academic jobs. In this exploratory analysis, we estimate the time and costs needed to meet the diverse formatting requirements for manuscript submissions in biomedical publishing. Methods We reviewed 302 leading biomedical journals’ submission guidelines and extracted information on the components that tend to vary the most among submission guidelines (the length of the title, the running title, the abstract, and the manuscript; the structure of the abstract and the manuscript, number of items and references allowed, whether the journal has a template). We estimated annual research funding lost due to manuscript formatting by calculating hourly academic salaries, the time lost to reformatting articles, and quantifying the total number of resubmissions per year. We interviewed several researchers and senior journal editors and editors-in-chief to contextualize our findings and develop guidelines that could help both biomedical journals and researchers work more efficiently. Results Among the analyzed journals, we found a huge diversity in submission requirements. By calculating average researcher salaries in the European Union and the USA, and the time spent on reformatting articles, we estimated that ~ 230 million USD were lost in 2021 alone due to reformatting articles. Should the current practice remain unchanged within this decade, we estimate ~ 2.5 billion USD could be lost between 2022 and 2030—solely due to reformatting articles after a first editorial desk rejection. In our interviews, we found alignment between researchers and editors; researchers would like the submission process to be as straightforward and simple as possible, and editors want to easily identify strong, suitable articles and not waste researchers’ time. Conclusions Based on the findings from our quantitative analysis and contextualized by the qualitative interviews, we conclude that free-format submission guidelines would benefit both researchers and editors. However, a minimum set of requirements is necessary to avoid manuscript submissions that lack structure. We developed our guidelines to improve the status quo , and we urge the publishers and the editorial-advisory boards of biomedical journals to adopt them. This may also require support from publishers and major international organizations that govern the work of editors.
0
Paper
Citation6
0
Save