Abstract Background Anti-angiogenesis or inhibition of blood vessel formation is the best way to prevent the growth and metastasis of tumors. Natural sources like plants are currently being explored for its antiangiogenic activity as they are factories of various phytochemicals. The goal of the current study is to investigate the antiangiogenic potential of Elaeagnus umbellata ( E. umbellata ) by using chorioallantoic membrane (CAM) assay and molecular docking. Methods Based on our previous research, the antiangiogenic activity was carried out using active fractions including crude methanol (Eu-Met), ethyl acetate (Eu-EtAc), and chloroform (Eu-Chf) extracts using CAM assay. Furthermore, to understand the binding mechanism of identified compounds, molecular docking was performed against vascular endothelial growth factor receptor 2 (VEGFR-2) using AutoDock vina as docking software. VEGFR-2 is overexpressed in pathological angiogenesis. Results In CAM assay, Eu-Met, Eu-EtAc, and Eu-Chf extracts showed antiangiogenic activities but notable antiangiogenic activities were exhibited by Eu-Chf with IC 50 value of 65.02 μg/mL. In molecular docking, five compounds, catechin, catechin hydrate, morin, quercetin, and rutin, reported in the extract and active fractions (Eu-Met, Eu-EtAc, and Eu-Chf) of E. umbellata showed strong interactions with VEGFR-2 with binding affinities of −9.4, −9.3, −9.9, −10.2, and −9.4 kcal/mol. Conclusion Based on our results, we can claim that E. umbellata possess antiangiogenic activity which needs to be explored further.

Abstract The purpose of this research was to examine the interaction between metabolites of Lactobacillus plantarum YW11, characterized through GC–mass spectra (MS) analysis, and the FN1 protein in cases of familial pulmonary fibrosis, found from hub genes analysis. GC–MS analysis was performed to identify metabolites in L. plantarum . Then, gene expression analysis and functional annotations were conducted to investigate the hub genes. A network of hub genes and transcription factors (TFs) was constructed, highlighting the significance of FN1 in the disease’s etiology. Molecular docking was employed to explore the interaction between the characterized metabolites and the FN1 protein. Toxicity analysis was also carried out. Thirty-two active compounds of L. plantarum YW11 were characterized by GC–MS. The gene expression analysis identified 295 differentially expressed genes, including 10 hub genes and 6 TFs, providing further support for the involvement of FN1 protein in the disease. The results of the molecular docking studies suggest the therapeutic potential of targeting FN1, with the best docking result observed for the interaction between FN1 and the 2,4-di- tert -butylphenol metabolite (energy of −6.9 kcal/mol). The toxicity analysis and molecular dynamic simulations support the suitability of 2,4-di- tert -butylphenol as a candidate for targeting FN1.

Lactic acid bacteria (LAB) play a significant role in milk fermentation; however, the impact of different LAB fermentation types on the metabolic characteristics of fermented milk remains poorly understood. In this study, homofermentative Lactoplantibacillus plantarum K25 and heterofermentative Limosilactobacillus fermentum 13-1 were utilized in yogurt fermentation to produce fermented milk samples D-Lp and D-Lf, respectively, which were compared to the control yogurt sample (D) in terms of flavor and functional properties. Analysis revealed that strain K25 enhanced the production of milky aroma compounds such as 2,3-butanedione (8.82±1.13 ng/g) and hexanoic acid (28.94±1.39 ng/g), while strain 13-1 led to a decrease in 2,3-butanedione (0 ng/g) and acetoin (0 ng/g) levels along with an increase in the content of both acetic acid (23.58±1.99 ng/g) and ethanol (9.92±0.93 ng/g). Both strains demonstrated potential in reducing the bitterness of fermented milk by decreasing the levels of bitter amino acids and dipeptides in samples. Untargeted metabolomics analysis indicated that strain 13-1 induced more significant metabolic changes in fermented milk compared to strain K25. Both strains influenced various amino acid metabolisms, with strain K25 promoting lysine degradation and strain 13-1 enhancing tyro-sine metabolism. Furthermore, an increase in different types of bioactive compounds was observed in different fermented milk samples. This study enhances our understanding of LAB strain metabolism in fermented milk.

Buruli ulcer (BU) a neglected disease induced by the bacterium Mycobacterium ulcerans, predominantly impacts tropical and subtropical areas with its pathophysiology ascribed to the Mycolactone protein. Current antibiotics frequently prove insufficient to manage advanced or chronic ulcers and the rise of drug resistance presents a considerable challenge. This work aims to address these challenges by employing computational methods to identify therapeutic candidates from organic compounds, which may be developed into more effective therapies for Buruli ulcer. The Gas-Chromatography Mass Spectrometry (GCMS) analysis of the Thymus Vulgaris identified the 29 bioactive compounds as potential drug candidates having different medicinal properties. Out of the 29 compounds against the mycolactone protein, 14 compounds demonstrated a binding affinity higher than − 6 kcal/mol predicted through PyRx. Among all compounds, gamma sitosterol and borneol showed the highest binding affinity − 7.7 kcal/mol. The ADMET analysis predicted that the compound borneol crosses the PGP + through the Blood Brain Barrier and gastrointestinal tract without violating Lipinski's rule of 5 having high water solubility, and log p-value of 2.29. The molecular dynamic simulation was performed and showed the Eigenvalue of 1.332692e-04. The leads identified in the study have demonstrated encouraging outcomes with regard to their efficacy, toxicity, pharmacokinetics, and safety. Further experimental investigations can be conducted to evaluate their anti-bacterial activity, and their molecular frameworks could be utilized as a valuable foundation for designing new drugs for the treatment of Buruli ulcer.

The spent black tea extract was utilized in order to synthesize the spent black tea silver nanoparticles (SBT-AgNPs). Various parameters were tested to yield the best production of SBT-AgNPs. The characterization was conducted by X-Ray diffraction, Scanning electron microscopy, Zeta potential and energy dispersive X-ray (EDX). The XRD analysis showed hkl planes corresponding to (111), (200), (220), (311) planes at 2θ theta deg 38.3°, 40.8°, 64.5°, and 74.2°. The scanning electron microscopy reported the plate like round shaped morphology of the AgNPs. The zeta potential was examined to be -17.5 mV and a size distribution by intensity of 157.6 d. nm was observed. The EDX was employed to determine the purity of samples by reporting a strong peak of silver (Ag). The degradation activity was examined by photocatalytic removal of methylene blue and malachite green dyes from textile wastewater. The textile wastewater showed a decrease of methylene blue by 25% and 58.3%. The malachite green was also reduced by 33.3% and 60%, which was remarkably significant owing to the presence of the complex factor in the natural environment. The study sets a promising record to harbor the full potential of available food waste resource, such as spent black tea to form SBT-AgNPs and its application in the dye removal from textile waste. The multifaceted outcomes of this study resulted in an eco-friendly procedure, thereby reusing the waste material for environmental cleanup.

Cyclodipeptides (CDPs) are distinct chemical scaffolds that show a wide range of bioactivities pertinent to medicine, agriculture, chemical catalysis, and material sciences. CDPs, also known as diketopiperazines (DKPs), are tiny naturally occurring peptides that have sparked interest due to their various bioactive features and possible applications in the food, pharmaceutical, and medical sectors. CDPs are produced by the intramolecular cyclization of two amino acids and can be found in a variety of environments, such as fungi, plants, animals, bacteria, and processed foods. CDPs are highly stable because of their solid structure and durability against enzymatic degradation, making them appropriate choices for medicinal and functional food applications. CDPs are frequently seen as undesirable byproducts in processed meals, especially those that include dairy, meat, and fermented drinks; new research indicates that they may improve flavor and benefit human health. Bioactive sub-stances having anti-inflammatory, antibacterial, antioxidant, and neuroprotective qualities have been recognized as CDPs. Certain CDPs, such as cyclo(Phe-Pro), along with cyclo(Pro-Pro), have shown promise in controlling metabolic and cognitive functions in the body, while others, such as cyclo(His-Pro), have demonstrated anticancer activity by causing cancer cells to undergo apoptosis. In spite of widespread research, little is known about the precise health consequences and ideal levels of CDP intake from dietary sources. Considering this, the present review attempts to compile the most recent information on the occurrence, generation, and biological activity of CDPs. To completely comprehend CDPs’ bioactivity and their significance to human health, more research is required. Additionally, creative approaches for using these peptides for creating functional foods and preventing diseases should be investigated.