CT
Cheddhi Thomas
Author with expertise in Gliomas
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(100% Open Access)
Cited by:
734
h-index:
11
/
i10-index:
11
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

T2–FLAIR Mismatch, an Imaging Biomarker for IDH and 1p/19q Status in Lower-grade Gliomas: A TCGA/TCIA Project

Sohil Patel et al.Jul 28, 2017
Abstract Purpose: Lower-grade gliomas (WHO grade II/III) have been classified into clinically relevant molecular subtypes based on IDH and 1p/19q mutation status. The purpose was to investigate whether T2/FLAIR MRI features could distinguish between lower-grade glioma molecular subtypes. Experimental Design: MRI scans from the TCGA/TCIA lower grade glioma database (n = 125) were evaluated by two independent neuroradiologists to assess (i) presence/absence of homogenous signal on T2WI; (ii) presence/absence of “T2–FLAIR mismatch” sign; (iii) sharp or indistinct lesion margins; and (iv) presence/absence of peritumoral edema. Metrics with moderate–substantial agreement underwent consensus review and were correlated with glioma molecular subtypes. Somatic mutation, DNA copy number, DNA methylation, gene expression, and protein array data from the TCGA lower-grade glioma database were analyzed for molecular–radiographic associations. A separate institutional cohort (n = 82) was analyzed to validate the T2–FLAIR mismatch sign. Results: Among TCGA/TCIA cases, interreader agreement was calculated for lesion homogeneity [κ = 0.234 (0.111–0.358)], T2–FLAIR mismatch sign [κ = 0.728 (0.538–0.918)], lesion margins [κ = 0.292 (0.135–0.449)], and peritumoral edema [κ = 0.173 (0.096–0.250)]. All 15 cases that were positive for the T2–FLAIR mismatch sign were IDH-mutant, 1p/19q non-codeleted tumors (P &lt; 0.0001; PPV = 100%, NPV = 54%). Analysis of the validation cohort demonstrated substantial interreader agreement for the T2–FLAIR mismatch sign [κ = 0.747 (0.536–0.958)]; all 10 cases positive for the T2–FLAIR mismatch sign were IDH-mutant, 1p/19q non-codeleted tumors (P &lt; 0.00001; PPV = 100%, NPV = 76%). Conclusions: Among lower-grade gliomas, T2–FLAIR mismatch sign represents a highly specific imaging biomarker for the IDH-mutant, 1p/19q non-codeleted molecular subtype. Clin Cancer Res; 23(20); 6078–85. ©2017 AACR.
0
Citation321
0
Save
0

Polymorphous low-grade neuroepithelial tumor of the young (PLNTY): an epileptogenic neoplasm with oligodendroglioma-like components, aberrant CD34 expression, and genetic alterations involving the MAP kinase pathway

Jason Huse et al.Nov 3, 2016
Epileptogenic tumors affecting children and young adults are a morphologically diverse collection of neuroepithelial neoplasms that, as a group, exhibit varying levels of glial and/or neuronal differentiation. Recent advances in molecular profiling technology, including comprehensive DNA sequencing and methylation analysis, have enabled the application of more precise and biologically relevant classification schemes to these tumors. In this report, we describe a morphologically and molecularly distinct epileptogenic neoplasm, the polymorphous low-grade neuroepithelial tumor of the young (PLNTY), which likely accounts for a sizable portion of oligodendroglioma-like tumors affecting the pediatric population. Characteristic microscopic findings most notably include infiltrative growth, the invariable presence of oligodendroglioma-like cellular components, and intense immunolabeling for cluster of differentiation 34 (CD34). Moreover, integrative molecular profiling reveals a distinct DNA methylation signature for PLNTYs, along with frequent genetic abnormalities involving either B-Raf proto-oncogene (BRAF) or fibroblast growth factor receptors 2 and 3 (FGFR2, FGFR3). These findings suggest that PLNTY represents a distinct biological entity within the larger spectrum of pediatric, low-grade neuroepithelial tumors.
0
Citation208
0
Save
0

Mutant IDH1 and seizures in patients with glioma

Hao Chen et al.Apr 13, 2017

Objective:

 Because the d-2-hydroxyglutarate (D2HG) product of mutant isocitrate dehydrogenase 1 (IDH1mut) is released by tumor cells into the microenvironment and is structurally similar to the excitatory neurotransmitter glutamate, we sought to determine whether IDH1mut increases the risk of seizures in patients with glioma, and whether D2HG increases the electrical activity of neurons. 

Methods:

 Three WHO grade II-IV glioma cohorts from separate institutions (total N = 712) were retrospectively assessed for the presence of preoperative seizures and tumor location, WHO grade, 1p/19q codeletion, and IDH1mut status. Rat cortical neurons were grown on microelectrode arrays, and their electrical activity was measured before and after treatment with exogenous D2HG, in the presence or absence of the selective NMDA antagonist, AP5. 

Results:

 Preoperative seizures were observed in 18%–34% of IDH1 wild-type (IDH1wt) patients and in 59%–74% of IDH1mut patients (p < 0.001). Multivariable analysis, including WHO grade, 1p/19q codeletion, and temporal lobe location, showed that IDH1mut was an independent correlate with seizures (odds ratio 2.5, 95% confidence interval 1.6–3.9, p < 0.001). Exogenous D2HG increased the firing rate of cultured rat cortical neurons 4- to 6-fold, but was completely blocked by AP5. 

Conclusions:

 The D2HG product of IDH1mut may increase neuronal activity by mimicking the activity of glutamate on the NMDA receptor, and IDH1mut gliomas are more likely to cause seizures in patients. This has rapid translational implications for the personalized management of tumor-associated epilepsy, as targeted IDH1mut inhibitors may improve antiepileptic therapy in patients with IDH1mut gliomas.
0
Citation205
0
Save