Healthy Research Rewards
ResearchHub is incentivizing healthy research behavior. At this time, first authors of open access papers are eligible for rewards. Visit the publications tab to view your eligible publications.
Got it
MX
Mai Xu
Author with expertise in Brown Adipose Tissue Function and Physiology
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(100% Open Access)
Cited by:
596
h-index:
28
/
i10-index:
40
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Breast Cancer Lung Metastasis Requires Expression of Chemokine Receptor CCR4 and Regulatory T Cells

Purevdorj Olkhanud et al.Jul 1, 2009
Cancer metastasis is a leading cause of cancer morbidity and mortality. More needs to be learned about mechanisms that control this process. In particular, the role of chemokine receptors in metastasis remains controversial. Here, using a highly metastatic breast cancer (4T1) model, we show that lung metastasis is a feature of only a proportion of the tumor cells that express CCR4. Moreover, the primary tumor growing in mammary pads activates remotely the expression of TARC/CCL17 and MDC/CCL22 in the lungs. These chemokines acting through CCR4 attract both tumor and immune cells. However, CCR4-mediated chemotaxis was not sufficient to produce metastasis, as tumor cells in the lung were efficiently eliminated by natural killer (NK) cells. Lung metastasis required CCR4(+) regulatory T cells (Treg), which directly killed NK cells using beta-galactoside-binding protein. Thus, strategies that abrogate any part of this process should improve the outcome through activation of effector cells and prevention of tumor cell migration. We confirm this prediction by killing CCR4(+) cells through delivery of TARC-fused toxins or depleting Tregs and preventing lung metastasis.
0
Citation283
0
Save
0

3D genomic features across >50 diverse cell types reveal insights into the genomic architecture of childhood obesity

Bao Trang et al.Jan 15, 2025
The prevalence of childhood obesity is increasing worldwide, along with the associated common comorbidities of type 2 diabetes and cardiovascular disease in later life. Motivated by evidence for a strong genetic component, our prior genome-wide association study (GWAS) efforts for childhood obesity revealed 19 independent signals for the trait; however, the mechanism of action of these loci remains to be elucidated. To molecularly characterize these childhood obesity loci, we sought to determine the underlying causal variants and the corresponding effector genes within diverse cellular contexts. Integrating childhood obesity GWAS summary statistics with our existing 3D genomic datasets for 57 human cell types, consisting of high-resolution promoter-focused Capture-C/Hi-C, ATAC-seq, and RNA-seq, we applied stratified LD score regression and calculated the proportion of genome-wide SNP heritability attributable to cell type-specific features, revealing pancreatic alpha cell enrichment as the most statistically significant. Subsequent chromatin contact-based fine-mapping was carried out for genome-wide significant childhood obesity loci and their linkage disequilibrium proxies to implicate effector genes, yielded the most abundant number of candidate variants and target genes at the BDNF , ADCY3 , TMEM18, and FTO loci in skeletal muscle myotubes and the pancreatic beta-cell line, EndoC-BH1. One novel implicated effector gene, ALKAL2 – an inflammation-responsive gene in nerve nociceptors – was observed at the key TMEM18 locus across multiple immune cell types. Interestingly, this observation was also supported through colocalization analysis using expression quantitative trait loci (eQTL) derived from the Genotype-Tissue Expression (GTEx) dataset, supporting an inflammatory and neurologic component to the pathogenesis of childhood obesity. Our comprehensive appraisal of 3D genomic datasets generated in a myriad of different cell types provides genomic insights into pediatric obesity pathogenesis.