Genomic landscapes of 92 adult and 111 pediatric patients with B-cell acute lymphoblastic leukemia (B-ALL) were investigated using next-generation sequencing and copy number alteration analysis. Recurrent gene mutations and fusions were tested in an additional 87 adult and 93 pediatric patients. Among the 29 newly identified in-frame gene fusions, those involving MEF2D and ZNF384 were clinically relevant and were demonstrated to perturb B-cell differentiation, with EP300-ZNF384 inducing leukemia in mice. Eight gene expression subgroups associated with characteristic genetic abnormalities were identified, including leukemia with MEF2D and ZNF384 fusions in two distinct clusters. In subgroup G4 which was characterized by ERG deletion, DUX4-IGH fusion was detected in most cases. This comprehensive dataset allowed us to compare the features of molecular pathogenesis between adult and pediatric B-ALL and to identify signatures possibly related to the inferior outcome of adults to that of children. We found that, besides the known discrepancies in frequencies of prognostic markers, adult patients had more cooperative mutations and greater enrichment for alterations of epigenetic modifiers and genes linked to B-cell development, suggesting difference in the target cells of transformation between adult and pediatric patients and may explain in part the disparity in their responses to treatment.

Introduction Corticosteroids are used for toxicity management, raising concerns about whether they may affect the anti-leukemic effects of chimeric antigen receptor (CAR)-T cells. Methods and results In this study, we retrospectively analyzed patients (fined two subgroups based on disease burden. Of the 75 cases in the low disease burden (LDB) group (MRD < 5%, no extramedullary disease), there was no significant difference between the use of steroids and event-free survival (EFS) ( p = 0.21) and overall survival (OS) ( p = 0.26), and the same was found for the 119 cases in the high disease burden (HDB) group. After eliminating the effect of consolidative transplantation on the prognosis, the EFS of the patients who did not use steroids was better ( p = 0.037) in the LDB group, but the difference was not significant in the HDB group. The median cumulative dexamethasone-equivalent dose was 0.56 mg/kg, and the EFS and OS were similar in the different cumulative dose groups. Furthermore, there was no difference in the recovery of B cells and the expansion of CAR-T cell copies. Conclusion and discussion In conclusion, under the guidance of current CRS prevention and control measures, the rational use of corticosteroids does not affect the clinical efficacy and overall survival of CAR-T cell therapy in patients with B-ALL and also does not affect the persistence of CAR-T cells in vivo , but the dosage threshold needs further clinical or experimental verification.