BB
Bartłomiej Budny
Author with expertise in RNA Methylation and Modification in Gene Expression
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
2
(100% Open Access)
Cited by:
269
h-index:
15
/
i10-index:
20
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

X-exome sequencing of 405 unresolved families identifies seven novel intellectual disability genes

Hao Hu et al.Feb 3, 2015
X-linked intellectual disability (XLID) is a clinically and genetically heterogeneous disorder. During the past two decades in excess of 100 X-chromosome ID genes have been identified. Yet, a large number of families mapping to the X-chromosome remained unresolved suggesting that more XLID genes or loci are yet to be identified. Here, we have investigated 405 unresolved families with XLID. We employed massively parallel sequencing of all X-chromosome exons in the index males. The majority of these males were previously tested negative for copy number variations and for mutations in a subset of known XLID genes by Sanger sequencing. In total, 745 X-chromosomal genes were screened. After stringent filtering, a total of 1297 non-recurrent exonic variants remained for prioritization. Co-segregation analysis of potential clinically relevant changes revealed that 80 families (20%) carried pathogenic variants in established XLID genes. In 19 families, we detected likely causative protein truncating and missense variants in 7 novel and validated XLID genes (CLCN4, CNKSR2, FRMPD4, KLHL15, LAS1L, RLIM and USP27X) and potentially deleterious variants in 2 novel candidate XLID genes (CDK16 and TAF1). We show that the CLCN4 and CNKSR2 variants impair protein functions as indicated by electrophysiological studies and altered differentiation of cultured primary neurons from Clcn4−/− mice or after mRNA knock-down. The newly identified and candidate XLID proteins belong to pathways and networks with established roles in cognitive function and intellectual disability in particular. We suggest that systematic sequencing of all X-chromosomal genes in a cohort of patients with genetic evidence for X-chromosome locus involvement may resolve up to 58% of Fragile X-negative cases.
0
Citation269
0
Save
0

The Effect of Ionising Radiation on the Properties of Tumour-Derived Exosomes and Their Ability to Modify the Biology of Non-Irradiated Breast Cancer Cells—An In Vitro Study

Michał Lach et al.Jan 4, 2025
The vast majority of breast cancer patients require radiotherapy but some of them will develop local recurrences and potentially metastases in the future. Recent data show that exosomal cargo is essential in these processes. Thus, we investigated the influence of ionising radiation on exosome properties and their ability to modify the sensitivity and biology of non-irradiated cells. Exosomes were isolated from breast cancer cell lines (MDA-MB-231, MCF7, and SKBR3) irradiated with 2 Gy (Exo 2 Gy) or no irradiation (Exo 0 Gy). Despite some differences in their molecular profiles, they did not affect cell viability, proliferation, cell cycle phase distribution, and radioresistance; however, both populations showed the ability to modify cell migration and invasion potential, as confirmed by the downregulation of β-catenin, which is responsible for maintaining the epithelial phenotype. Interestingly, exosomes from irradiated BCa cells were more actively deposited in the endothelial cells (EA.hy926). Furthermore, exosomes tend to lower the expression of CD31, which is responsible for maintaining intact vascularity. This preliminary study demonstrates the vital role of exosomes and their altered profile due to irradiation in the pathobiology of breast cancer.