We present the Data Release 9 Quasar (DR9Q) catalog from the Baryon Oscillation Spectroscopic Survey (BOSS) of the Sloan Digital Sky Survey III. The catalog includes all BOSS objects that were targeted as quasar candidates during the survey, are spectrocopically confirmed as quasars via visual inspection, have luminosities Mi[z=2]<-20.5 (in a $\Lambda$CDM cosmology with H0 = 70 km/s/Mpc, $\Omega_{\rm M}$ = 0.3, and $\Omega_{\Lambda}$ = 0.7) and either display at least one emission line with full width at half maximum (FWHM) larger than 500 km/s or, if not, have interesting/complex absorption features. It includes as well, known quasars (mostly from SDSS-I and II) that were reobserved by BOSS. This catalog contains 87,822 quasars (78,086 are new discoveries) detected over 3,275 deg$^{2}$ with robust identification and redshift measured by a combination of principal component eigenspectra newly derived from a training set of 8,632 spectra from SDSS-DR7. The number of quasars with $z>2.15$ (61,931) is ~2.8 times larger than the number of z>2.15 quasars previously known. Redshifts and FWHMs are provided for the strongest emission lines (CIV, CIII], MgII). The catalog identifies 7,533 broad absorption line quasars and gives their characteristics. For each object the catalog presents five-band (u,g,r,i,z) CCD-based photometry with typical accuracy of 0.03 mag, and information on the morphology and selection method. The catalog also contains X-ray, ultraviolet, near-infrared, and radio emission properties of the quasars, when available, from other large-area surveys.

We present a measurement of baryon acoustic oscillations (BAO) in the cross-correlation of quasars with the Ly$\alpha$-forest flux-transmission at a mean redshift $z=2.40$. The measurement uses the complete SDSS-III data sample: 168,889 forests and 234,367 quasars from the SDSS Data Release DR12. In addition to the statistical improvement on our previous study using DR11, we have implemented numerous improvements at the analysis level allowing a more accurate measurement of this cross-correlation. We also developed the first simulations of the cross-correlation allowing us to test different aspects of our data analysis and to search for potential systematic errors in the determination of the BAO peak position. We measure the two ratios $D_{H}(z=2.40)/r_{d} = 9.01 \pm 0.36$ and $D_{M}(z=2.40)/r_{d} = 35.7 \pm 1.7$, where the errors include marginalization over the non-linear velocity of quasars and the metal - quasar cross-correlation contribution, among other effects. These results are within $1.8\sigma$ of the prediction of the flat-$\Lambda$CDM model describing the observed CMB anisotropies. We combine this study with the Ly$\alpha$-forest auto-correlation function [2017A&A...603A..12B], yielding $D_{H}(z=2.40)/r_{d} = 8.94 \pm 0.22$ and $D_{M}(z=2.40)/r_{d} = 36.6 \pm 1.2$, within $2.3\sigma$ of the same flat-$\Lambda$CDM model.