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Chemistry PhD '20, University of Birmingham
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Reversible, High-Affinity Surface Capturing of Proteins Directed by Supramolecular Assembly

Giuseppe Palma et al.Feb 6, 2019
The ability to design surfaces with reversible, high-affinity protein binding sites represents a significant step forward in the advancement of analytical methods for diverse biochemical and biomedical applications. Herein, we report a dynamic supramolecular strategy to directly assemble proteins on surfaces based on multivalent host–guest interactions. The host–guest interactions are achieved by one-step nanofabrication of a well-oriented β-cyclodextrin host-derived self-assembled monolayer on gold (β-CD-SAM) that forms specific inclusion complexes with hydrophobic amino acids located on the surface of the protein. Cytochrome c, insulin, α-chymotrypsin, and RNase A are used as model guest proteins. Surface plasmon resonance and static time-of-flight secondary ion mass spectrometry studies demonstrate that all four proteins interact with the β-CD-SAM in a specific manner via the hydrophobic amino acids on the surface of the protein. The β-CD-SAMs bind the proteins with high nanomolar to single-digit micromolar dissociation constants (KD). Importantly, while the proteins can be captured with high affinity, their release from the surface can be achieved under very mild conditions. Our results expose the great advantages of using a supramolecular approach for controlling protein immobilization, in which the strategy described herein provides unprecedented opportunities to create advanced bioanalytic and biosensor technologies.
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3D Visualization of Proteins within Metal–Organic Frameworks via Ferritin‐Enabled Electron Microscopy

Rakia Dhaoui et al.Dec 15, 2023
Abstract Electron tomography holds great promise as a tool for investigating the 3D morphologies and internal structures of metal‐organic framework‐based protein biocomposites (protein@MOFs). Understanding the 3D spatial arrangement of proteins within protein@MOFs is paramount for developing synthetic methods to control their spatial localization and distribution patterns within the biocomposite crystals. In this study, the naturally occurring iron oxide mineral core of the protein horse spleen ferritin (Fn) is leveraged as a contrast agent to directly observe individual proteins once encapsulated into MOFs by electron microscopy techniques. This methodology couples scanning electron microscopy, transmission electron microscopy, and electron tomography to garner detailed 2D and 3D structural interpretations of where proteins spatially lie in Fn@MOF crystals, addressing the significant gaps in understanding how synthetic conditions relate to overall protein spatial localization and aggregation. These findings collectively reveal that adjusting the ligand‐to‐metal ratios, protein concentration, and the use of denaturing agents alters how proteins are arranged, localized, and aggregated within MOF crystals.
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