HL
Huijuan Li
Author with expertise in Epidemiology and Management of Bipolar Disorder
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
3
(100% Open Access)
Cited by:
107
h-index:
20
/
i10-index:
30
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Novel Risk Loci Associated With Genetic Risk for Bipolar Disorder Among Han Chinese Individuals

Huijuan Li et al.Dec 2, 2020
The genetic basis of bipolar disorder (BD) in Han Chinese individuals is not fully understood.To explore the genetic basis of BD in the Han Chinese population.A genome-wide association study (GWAS), followed by independent replication, was conducted to identify BD risk loci in Han Chinese individuals. Individuals with BD were diagnosed based on DSM-IV criteria and had no history of schizophrenia, mental retardation, or substance dependence; individuals without any personal or family history of mental illnesses, including BD, were included as control participants. In total, discovery samples from 1822 patients and 4650 control participants passed quality control for the GWAS analysis. Replication analyses of samples from 958 patients and 2050 control participants were conducted. Summary statistics from the European Psychiatric Genomics Consortium 2 (PGC2) BD GWAS (20 352 cases and 31 358 controls) were used for the trans-ancestry genetic correlation analysis, polygenetic risk score analysis, and meta-analysis to compare BD genetic risk between Han Chinese and European individuals. The study was performed in February 2020.Single-nucleotide variations with P < 5.00 × 10-8 were considered to show genome-wide significance of statistical association.The Han Chinese discovery GWAS sample included 1822 cases (mean [SD] age, 35.43 [14.12] years; 838 [46%] male) and 4650 controls (mean [SD] age, 27.48 [5.97] years; 2465 [53%] male), and the replication sample included 958 cases (mean [SD] age, 37.82 [15.54] years; 412 [43%] male) and 2050 controls (mean [SD] age, 27.50 [6.00] years; 1189 [58%] male). A novel BD risk locus in Han Chinese individuals was found near the gene encoding transmembrane protein 108 (TMEM108, rs9863544; P = 2.49 × 10-8; odds ratio [OR], 0.650; 95% CI, 0.559-0.756), which is required for dendritic spine development and glutamatergic transmission in the dentate gyrus. Trans-ancestry genetic correlation estimation (ρge = 0.652, SE = 0.106; P = 7.30 × 10-10) and polygenetic risk score analyses (maximum liability-scaled Nagelkerke pseudo R2 = 1.27%; P = 1.30 × 10-19) showed evidence of shared BD genetic risk between Han Chinese and European populations, and meta-analysis identified 2 new GWAS risk loci near VRK2 (rs41335055; P = 4.98 × 10-9; OR, 0.849; 95% CI, 0.804-0.897) and RHEBL1 (rs7969091; P = 3.12 × 10-8; OR, 0.932; 95% CI, 0.909-0.956).This GWAS study identified several loci and genes involved in the heritable risk of BD, providing insights into its genetic architecture and biological basis.
0
Citation46
0
Save
0

Further confirmation of netrin 1 receptor (DCC) as a depression risk gene via integrations of multi-omics data

Huijuan Li et al.Mar 17, 2020
Genome-wide association studies (GWAS) of major depression and its relevant biological phenotypes have been extensively conducted in large samples, and transcriptome-wide analyses in the tissues of brain regions relevant to pathogenesis of depression, e.g., dorsolateral prefrontal cortex (DLPFC), have also been widely performed recently. Integrating these multi-omics data will enable unveiling of depression risk genes and even underlying pathological mechanisms. Here, we employ summary data-based Mendelian randomization (SMR) and integrative risk gene selector (iRIGS) approaches to integrate multi-omics data from GWAS, DLPFC expression quantitative trait loci (eQTL) analyses and enhancer-promoter physical link studies to prioritize high-confidence risk genes for depression, followed by independent replications across distinct populations. These integrative analyses identify multiple high-confidence depression risk genes, and numerous lines of evidence supporting pivotal roles of the netrin 1 receptor (DCC) gene in this illness across different populations. Our subsequent explorative analyses further suggest that DCC significantly predicts neuroticism, well-being spectrum, cognitive function and putamen structure in general populations. Gene expression correlation and pathway analyses in DLPFC further show that DCC potentially participates in the biological processes and pathways underlying synaptic plasticity, axon guidance, circadian entrainment, as well as learning and long-term potentiation. These results are in agreement with the recent findings of this gene in neurodevelopment and psychiatric disorders, and we thus further confirm that DCC is an important susceptibility gene for depression, and might be a potential target for new antidepressants.
0
Citation34
0
Save