JY
Jing Yan
Author with expertise in Remote Sensing in Vegetation Monitoring and Phenology
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
6
(67% Open Access)
Cited by:
240
h-index:
12
/
i10-index:
18
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Transcriptomic and Metabolomic Analysis Reveals Multifaceted Impact of Gcn5 Knockdown in Drosophila Development

Y. Li et al.Dec 4, 2024
Background: General control nonderepressible 5 (Gcn5) is a lysine acetyltransferase (KAT) that is evolutionarily conserved across eukaryotes, with two homologs (Kat2a and Kat2b) identified in humans and one (Gcn5) in Drosophila. Gcn5 contains a P300/CBP-associated factor (PCAF) domain, a Gcn5-N-acetyltransferase (GNAT) domain, and a Bromodomain, allowing it to regulate gene expression through the acetylation of both histone and non-histone proteins. In Drosophila, Gcn5 is crucial for embryonic development, with maternal Gcn5 supporting early development. However, the functional mechanisms of Gcn5 after the depletion of maternal deposits remain unclear. Methods: Our study employed the Gal4/UAS-RNAi system to achieve whole-body or heart-specific Gcn5 knockdown in Drosophila and selected 96-hour-old surviving larvae for transcriptomic and metabolomic analyses. Results: Omics results revealed that Gcn5 knockdown significantly impacts various metabolic pathways, as well as lysosomes, non-homologous end-joining, Toll and Imd signaling pathways, and circadian rhythms, among others. Furthermore, defects in chitin synthesis may be associated with impaired pupation. Additionally, heart-specific Gcn5 knockdown affected cardiac physiology but appeared to have a potential protective effect against age-related cardiac decline. Conclusions: These findings deepen our understanding of Gcn5’s roles in Drosophila development and provide valuable insights for developing Gcn5-targeted therapies, particularly considering its involvement in various human diseases.
0

Capture of Totipotency in Mouse Embryonic Stem Cells in the Absence of Pdzk1

Wenhao Zhang et al.Dec 4, 2024
Abstract Totipotent cells can differentiate into three lineages: the epiblast, primitive endoderm, and trophectoderm. Naturally, only early fertilized embryos possess totipotency, and they lose this ability as they develop. The expansion of stem cell differentiation potential has been a hot topic in developmental biology for years, particularly with respect to the generation totipotent‐like stem cells. Here, the study describes the establishment of totipotency in embryonic stem cells (ESCs) via the deletion of a single gene, Pdzk1 . Pdzk1 ‐knockout (KO) ESCs substantially contribute to the fetus, placenta, and yolk sac in chimera assays but can also self‐organize to form standard blastocyst‐like structures containing the three lineages efficiently; thus, they exhibit full developmental potential as early blastomeres. Single‐cell transcriptome and bulk RNA‐seq comprehensive analyses revealed that Pdzk1 ‐KO activates several lineage inducers ( C1qa , C1qb , Fgf5 , and Cdx2 ) to break down barriers between embryonic and extraembryonic tissues, making these lineages switch smoothly and resulting in a totipotent‐like state. This versatile and scalable system provides a robust experimental model for differentiation potency and cell fate studies.
0

A Trade‐Off Between Leaf Carbon Economics and Plant Size Among Mangrove Species in Dongzhaigang, China

Dalong Jiang et al.Nov 1, 2024
ABSTRACT Plant size is closely linked to its leaf trait characteristics, which are essential for determining its form and function. These relationships constitute a fundamental component of the global spectrum of plant diversity. Despite this, the size–trait relationships in coastal mangroves have often been overlooked, with a common assumption that they would mirror those found in terrestrial tropical trees. However, recent studies have begun to challenge this assumption, revealing unique adaptations and trait variations in mangroves that are influenced by their specific environmental conditions, such as salinity and nutrient availability. In this research, we investigated the leaf structural traits, plant height, and diameter at breast height or basal height (DBH) of 10 shrub and tree species. This study was carried out along an intertidal gradient within a mangrove forest located in Southeast China. We found that leaf traits differed significantly between shrubs and trees in their response to intertidal gradients, indicating that different species have evolved specific adaptations to thrive in their respective intertidal zones. This insight can help us decipher the selective pressures that have shaped trait evolution. Among all species, leaf carbon (C) economics (leaf dry mass content, leaf mass per area, and leaf density) decreased significantly with increasing plant height and DBH. For each growth form and intertidal zone, the relationships between plant size (height or DBH) and leaf C economics traits were consistent with those in the pooled dataset. Our study reveals that mangrove plants exhibit size‐related adjustments in leaf C economic strategies, indicating that plant size potentially acts as a proxy for the “slow–fast” continuum of plant performance. This discovery is pivotal for advancing our understanding of plant functional ecology and for enhancing the precision of global C cycle models, which are highly responsive to perturbations in atmospheric CO 2 and climate change.
0

Jasmonic acid improves cadmium tolerance in rice (Oryza sativa) by reducing the production of nitric oxide

Ji Yang et al.Jan 1, 2025
The involvement of jasmonic acid (JA) in the rice's response to cadmium (Cd) stress is well recognized, though the underlying mechanisms remain unclear. In this study, exposure to Cd stress rapidly elevated endogenous JA concentrations in rice roots, meanwhile, a mutant coleoptile photomorphogenesis 2 (cpm2) which produces less JA, was more sensitive to Cd stress than its wild type (WT). JA mitigated Cd toxicity by decreasing Cd absorption in root cell wall and shoot, which was achieved by up-regulating the expression of the Cd-chelation and efflux-related genes such as OsHMA3, OsABCG36 and OsCAL1; down-regulating the transcript level of the Cd uptake and translocation-related genes, including OsHMA2, OsCCX2, OsNRAMP1/5, and OsZIP5/7. Additionally, a reduction in hemicellulose content was observed in the root cell wall. Further analysis indicated that the mitigation effect of JA on Cd accumulation was dependent on the inhibition of nitric oxide (NO) synthesis, as the NO donor SNP could diminish this effect. In summary, JA effectively reduced Cd content in rice by modulating the cell wall's capacity for Cd uptake, potentially through reducing the production of NO.