Nimalan ThavandiranVerified
Verified Account
Verified
Open & decentralized science | Lab automation | Bioengineering
Bioengineering PhD '19, University of Toronto
+ 1 more
Member for 1 year and 1 day
Focus areas: cell biology, stem cell biology, cardiac biology, cell/tissue/organ engineering, organoids, in vitro models, drug discovery, cell reprogramming, cell and gene therapy, biotechnology, biomaterials, microfluidics & microtechnologies, longevity biotechnology, experimental design.
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Active user
Peer Reviewer
Key Stats
Upvotes received:
32
Publications:
21
(67% Open Access)
Cited by:
2,223
h-index:
14
/
i10-index:
14
Reputation
Surgery
76%
Biomedical Engineering
76%
Molecular Biology
68%
Show more
How is this calculated?
Publications
1

A Microfabricated Platform to Measure and Manipulate the Mechanics of Engineered Cardiac Microtissues

Thomas Boudou et al.Nov 18, 2011
Engineered myocardial tissues can be used to elucidate fundamental features of myocardial biology, develop organotypic in vitro model systems, and as engineered tissue constructs for replacing damaged heart tissue in vivo. However, a key limitation is an inability to test the wide range of parameters (cell source, mechanical, soluble and electrical stimuli) that might impact the engineered tissue in a high-throughput manner and in an environment that mimics native heart tissue. Here we used microelectromechanical systems technology to generate arrays of cardiac microtissues (CMTs) embedded within three-dimensional micropatterned matrices. Microcantilevers simultaneously constrain CMT contraction and report forces generated by the CMTs in real time. We demonstrate the ability to routinely produce ∼200 CMTs per million cardiac cells (<1 neonatal rat heart) whose spontaneous contraction frequency, duration, and forces can be tracked. Independently varying the mechanical stiffness of the cantilevers and collagen matrix revealed that both the dynamic force of cardiac contraction as well as the basal static tension within the CMT increased with boundary or matrix rigidity. Cell alignment is, however, reduced within a stiff collagen matrix; therefore, despite producing higher force, CMTs constructed from higher density collagen have a lower cross-sectional stress than those constructed from lower density collagen. We also study the effect of electrical stimulation on cell alignment and force generation within CMTs and we show that the combination of electrical stimulation and auxotonic load strongly improves both the structure and the function of the CMTs. Finally, we demonstrate the suitability of our technique for high-throughput monitoring of drug-induced changes in spontaneous frequency or contractility in CMTs as well as high-speed imaging of calcium dynamics using fluorescent dyes. Together, these results highlight the potential for this approach to quantitatively demonstrate the impact of physical parameters on the maturation, structure, and function of cardiac tissue and open the possibility to use high-throughput, low volume screening for studies on engineered myocardium.
1

Generation of human embryonic stem cell‐derived mesoderm and cardiac cells using size‐specified aggregates in an oxygen‐controlled bioreactor

Sylvia Niebruegge et al.Sep 2, 2008
Abstract The ability to generate human pluripotent stem cell‐derived cell types at sufficiently high numbers and in a reproducible manner is fundamental for clinical and biopharmaceutical applications. Current experimental methods for the differentiation of pluripotent cells such as human embryonic stem cells (hESC) rely on the generation of heterogeneous aggregates of cells, also called “embryoid bodies” (EBs), in small scale static culture. These protocols are typically (1) not scalable, (2) result in a wide range of EB sizes and (3) expose cells to fluctuations in physicochemical parameters. With the goal of establishing a robust bioprocess we first screened different scalable suspension systems for their ability to support the growth and differentiation of hESCs. Next homogeneity of initial cell aggregates was improved by employing a micro‐printing strategy to generate large numbers of size‐specified hESC aggregates. Finally, these technologies were integrated into a fully controlled bioreactor system and the impact of oxygen concentration was investigated. Our results demonstrate the beneficial effects of stirred bioreactor culture, aggregate size‐control and hypoxia (4% oxygen tension) on both cell growth and cell differentiation towards cardiomyocytes. QRT‐PCR data for markers such as Brachyury, LIM domain homeobox gene Isl‐1, Troponin T and Myosin Light Chain 2v, as well as immunohistochemistry and functional analysis by response to chronotropic agents, documented the impact of these parameters on cardiac differentiation. This study provides an important foundation towards the robust generation of clinically relevant numbers of hESC derived cells. Biotechnol. Bioeng. 2009;102: 493–507. © 2008 Wiley Periodicals, Inc.
2

Microfabricated perfusable cardiac biowire: a platform that mimics native cardiac bundle

Yun Xiao et al.Jan 1, 2014
Tissue engineering enables the generation of three-dimensional (3D) functional cardiac tissue for pre-clinical testing in vitro, which is critical for new drug development. However, current tissue engineering methods poorly recapitulate the architecture of oriented cardiac bundles with supporting capillaries. In this study, we designed a microfabricated bioreactor to generate 3D micro-tissues, termed biowires, using both primary neonatal rat cardiomyocytes and human embryonic stem cell (hESC) derived cardiomyocytes. Perfusable cardiac biowires were generated with polytetrafluoroethylene (PTFE) tubing template, and were integrated with electrical field stimulation using carbon rod electrodes. To demonstrate the feasibility of this platform for pharmaceutical testing, nitric oxide (NO) was released from perfused sodium nitroprusside (SNP) solution and diffused through the tubing. The NO treatment slowed down the spontaneous beating of cardiac biowires based on hESC derived cardiomyocytes and degraded the myofibrillar cytoskeleton of the cardiomyocytes within the biowires. The biowires were also integrated with electrical stimulation using carbon rod electrodes to further improve phenotype of cardiomyocytes, as indicated by organized contractile apparatus, higher Young's modulus, and improved electrical properties. This microfabricated platform provides a unique opportunity to assess pharmacological effects on cardiac tissue in vitro by perfusion in a cardiac bundle model, which could provide improved physiological relevance.
2

Geometric Control of Cardiomyogenic Induction in Human Pluripotent Stem Cells

Céline Bauwens et al.Aug 1, 2011
Although it has been observed that aggregate size affects cardiac development, an incomplete understanding of the cellular mechanisms underlying human pluripotent stem cell-derived cardiomyogenesis has limited the development of robust defined-condition cardiac cell generation protocols. Our objective was thus to elucidate cellular and molecular mechanisms underlying the endogenous control of human embryonic stem cell (hESC) cardiac tissue development, and to test the hypothesis that hESC aggregate size influences extraembryonic endoderm (ExE) commitment and cardiac inductive properties. hESC aggregates were generated with 100, 1000, or 4000 cells per aggregate using microwells. The frequency of endoderm marker (FoxA2 and GATA6)-expressing cells decreased with increasing aggregate size during early differentiation. Cardiogenesis was maximized in aggregates initiated from 1000 cells, with frequencies of 0.49±0.06 cells exhibiting a cardiac progenitor phenotype (KDRlow/C-KITneg) on day 5 and 0.24±0.06 expressing cardiac Troponin T on day 16. A direct relationship between ExE and cardiac differentiation efficiency was established by forming aggregates with varying ratios of SOX7 (a transcription factor required for ExE development) overexpressing or knockdown hESCs to unmanipulated hESCs. We demonstrate, in a defined, serum-free cardiac induction system, that robust and efficient cardiac differentiation is a function of endogenous ExE cell concentration, a parameter that can be directly modulated by controlling hESC aggregate size.
2
Citation84
0
Save
1

A 96-well culture platform enables longitudinal analyses of engineered human skeletal muscle microtissue strength

Mohammad Afshar et al.Apr 24, 2020
Abstract Three-dimensional (3D) in vitro models of human skeletal muscle mimic aspects of native tissue structure and function, thereby providing a promising system for disease modeling, drug discovery or pre-clinical validation, and toxicity testing. Widespread adoption of this research approach is hindered by the lack of easy-to-use platforms that are simple to fabricate and that yield arrays of human skeletal muscle micro-tissues (hMMTs) in culture with reproducible physiological responses that can be assayed non-invasively. Here, we describe a design and methods to generate a reusable mold to fabricate a 96-well platform, referred to as MyoTACTIC, that enables bulk production of 3D hMMTs. All 96-wells and all well features are cast in a single step from the reusable mold. Non-invasive calcium transient and contractile force measurements are performed on hMMTs directly in MyoTACTIC, and unbiased force analysis occurs by a custom automated algorithm, allowing for longitudinal studies of function. Characterizations of MyoTACTIC and resulting hMMTs confirms the capability of the device to support formation of hMMTs that recapitulate biological responses. We show that hMMT contractile force mirrors expected responses to compounds shown by others to decrease (dexamethasone, cerivastatin) or increase (IGF-1) skeletal muscle strength. Since MyoTACTIC supports hMMT long-term culture, we evaluated direct influences of pancreatic cancer chemotherapeutics agents on contraction competent human skeletal muscle myotubes. A single application of a clinically relevant dose of Irinotecan decreased hMMT contractile force generation, while clear effects on myotube atrophy were observed histologically only at a higher dose. This suggests an off-target effect that may contribute to cancer associated muscle wasting, and highlights the value of the MyoTACTIC platform to non-invasively predict modulators of human skeletal muscle function.
1

The Role of Tissue Engineering and Biomaterials in Cardiac Regenerative Medicine

Yong Zhao et al.Nov 1, 2014
In recent years, the development of 3-dimensional engineered heart tissue (EHT) has made large strides forward because of advances in stem cell biology, materials science, prevascularization strategies, and nanotechnology. As a result, the role of tissue engineering in cardiac regenerative medicine has become multifaceted as new applications become feasible. Cardiac tissue engineering has long been established to have the potential to partially or fully restore cardiac function after cardiac injury. However, EHTs may also serve as surrogate human cardiac tissue for drug-related toxicity screening. Cardiotoxicity remains a major cause of drug withdrawal in the pharmaceutical industry. Unsafe drugs reach the market because preclinical evaluation is insufficient to weed out cardiotoxic drugs in all their forms. Bioengineering methods could provide functional and mature human myocardial tissues, ie, physiologically relevant platforms, for screening the cardiotoxic effects of pharmaceutical agents and facilitate the discovery of new therapeutic agents. Finally, advances in induced pluripotent stem cells have made patient-specific EHTs possible, which opens up the possibility of personalized medicine. Herein, we give an overview of the present state of the art in cardiac tissue engineering, the challenges to the field, and future perspectives.
1
Citation48
0
Save
2

Functional arrays of human pluripotent stem cell-derived cardiac microtissues

Nimalan Thavandiran et al.Apr 24, 2020
Abstract To accelerate the cardiac drug discovery pipeline, we set out to develop a platform that would be capable of quantifying tissue-level functions such as contractile force and be amenable to standard multiwell-plate manipulations. We report a 96-well-based array of 3D human pluripotent stem cell (hPSC)-derived cardiac microtissues - termed Cardiac MicroRings (CaMiRi) - in custom 3D-print-molded multiwell plates capable of contractile force measurement. Within each well, two elastomeric microcantilevers are situated above a circumferential ramp. The wells are seeded with cell-laden collagen, which, in response to the gradual slope of the circumferential ramp, self-organizes around tip-gated microcantilevers to form contracting CaMiRi. The contractile force exerted by the CaMiRi is measured and calculated using the deflection of the cantilevers. Platform responses were robust and comparable across wells, and we used it to determine an optimal tissue formulation. We validated the contractile force response of CaMiRi using selected cardiotropic compounds with known effects. Additionally, we developed automated protocols for CaMiRi seeding, image acquisition, and analysis to enable the measurement of contractile force with increased throughput. The unique tissue fabrication properties of the platform, and the consequent effects on tissue function, were demonstrated upon adding hPSC-derived epicardial cells to the system. This platform represents an open-source contractile force screening system useful for drug screening and tissue engineering applications.
2
Citation36
0
Save
Load More