Identifying the downstream effects of disease-associated SNPs is challenging. To help overcome this problem, we performed expression quantitative trait locus (eQTL) meta-analysis in non-transformed peripheral blood samples from 5,311 individuals with replication in 2,775 individuals. We identified and replicated trans eQTLs for 233 SNPs (reflecting 103 independent loci) that were previously associated with complex traits at genome-wide significance. Some of these SNPs affect multiple genes in trans that are known to be altered in individuals with disease: rs4917014, previously associated with systemic lupus erythematosus (SLE), altered gene expression of C1QB and five type I interferon response genes, both hallmarks of SLE. DeepSAGE RNA sequencing showed that rs4917014 strongly alters the 3' UTR levels of IKZF1 in cis, and chromatin immunoprecipitation and sequencing analysis of the trans-regulated genes implicated IKZF1 as the causal gene. Variants associated with cholesterol metabolism and type 1 diabetes showed similar phenomena, indicating that large-scale eQTL mapping provides insight into the downstream effects of many trait-associated variants.

Background This study aimed to describe the incidence of atrial fibrillation (AF) among older adults during 3 years of follow-up. Methods and Results In this cohort study, 5201 adults ≥65 years old were examined annually on four occasions between June 1989 and May 1993. At baseline, participants answered questionnaires and underwent a detailed examination that included carotid ultrasound, pulmonary function tests, ECG, and echocardiography. Subjects with a pacemaker or AF at baseline (n=357) were excluded. New cases of AF were identified from three sources: (1) annual self-reports, (2) annual ECGs, and (3) hospital discharge diagnoses. Cox proportional-hazards models were used to assess baseline risk factors as predictors of incident AF. Among 4844 participants, 304 developed a first episode of AF during an average follow-up of 3.28 years, for an incidence of 19.2 per 1000 person-years. The onset was strongly associated with age, male sex, and the presence of clinical cardiovascular disease. For men 65 to 74 and 75 to 84 years old, the incidences were 17.6 and 42.7, respectively, and for women, 10.1 and 21.6 events per 1000 person-years. In stepwise models, the use of diuretics, a history of valvular heart disease, coronary disease, advancing age, higher levels of systolic blood pressure, height, glucose, and left atrial size were all associated with an increased risk of AF. The use of β-blockers and high levels of alcohol use, cholesterol, and forced expiratory volume in 1 second were associated with a reduced risk of AF. Conclusions The incidence of AF in older adults may be higher than estimated by previous population studies. Left atrial size appears to be an important risk factor, and the control of blood pressure and glucose may be important in preventing the development of AF.

Daniel Levy and colleagues report a meta-analysis of genome-wide association studies for blood pressure traits as part of the CHARGE consortium, reporting eight loci with replicated association to systolic and/or diastolic blood pressure, with one of these loci also associated to hypertension. Blood pressure is a major cardiovascular disease risk factor. To date, few variants associated with interindividual blood pressure variation have been identified and replicated. Here we report results of a genome-wide association study of systolic (SBP) and diastolic (DBP) blood pressure and hypertension in the CHARGE Consortium (n = 29,136), identifying 13 SNPs for SBP, 20 for DBP and 10 for hypertension at P < 4 × 10−7. The top ten loci for SBP and DBP were incorporated into a risk score; mean BP and prevalence of hypertension increased in relation to the number of risk alleles carried. When ten CHARGE SNPs for each trait were included in a joint meta-analysis with the Global BPgen Consortium (n = 34,433), four CHARGE loci attained genome-wide significance (P < 5 × 10−8) for SBP (ATP2B1, CYP17A1, PLEKHA7, SH2B3), six for DBP (ATP2B1, CACNB2, CSK-ULK3, SH2B3, TBX3-TBX5, ULK4) and one for hypertension (ATP2B1). Identifying genes associated with blood pressure advances our understanding of blood pressure regulation and highlights potential drug targets for the prevention or treatment of hypertension.

Background— The presence of systemic inflammation determined by elevations in C-reactive protein (CRP) has been associated with persistence of atrial fibrillation (AF). The relationship between CRP and prediction of AF has not been studied in a large population-based cohort. Methods and Results— CRP measurement and cardiovascular assessment were performed at baseline in 5806 subjects enrolled in the Cardiovascular Health Study. Patients were followed up for a mean of 6.9±1.6 (median 7.8) years. AF was identified by self-reported history and ECGs at baseline and by ECGs and hospital discharge diagnoses at follow-up. Univariate and multivariate analyses were used to assess CRP as a predictor of baseline and future development of AF. At baseline, 315 subjects (5%) had AF. Compared with subjects in the first CRP quartile (<0.97 mg/L), subjects in the fourth quartile (>3.41 mg/L) had more AF (7.4% versus 3.7%, adjusted OR 1.8, 95% CI 1.2 to 2.5; P =0.002). Of 5491 subjects without AF at baseline, 897 (16%) developed AF during follow-up. Baseline CRP predicted higher risk for developing future AF (fourth versus first quartile adjusted hazard ratio 1.31, 95% CI 1.08 to 1.58; P =0.005). When treated as a continuous variable, elevated CRP predicted increased risk for developing future AF (adjusted hazard ratio for 1-SD increase, 1.24; 95% CI 1.11 to 1.40; P <0.001). Conclusions— CRP is not only associated with the presence of AF but may also predict patients at increased risk for future development of AF.

Abstract

 Atrial fibrillation (AF) is a common arrhythmia in elderly persons and a common cause of embolic stroke. Most studies of the prevalence and correlates of AF have used selected, hospital-based populations. The Cardiovascular Health Study is a population-based, longitudinal study of risk factors for coronary artery disease and stroke in 5,201 men and women aged ≥65 years. AF was diagnosed in 4.8% of women and in 6.2% of men at the baseline examination, and prevalence was strongly associated with advanced age in women. Prevalence of AF was 9.1% in men and women with clinical cardiovascular disease, 4.6% in patients with evidence of subclinical but no clinical cardiovascular disease, and only 1.6% in subjects with neither clinical nor subclinical cardiovascular disease. A history of congestive heart failure, valvular heart disease and stroke, echocardiographic evidence of enlarged left atrial dimension, abnormal mitral or aortic valve function, treated systemic hypertension, and advanced age were independently associated with the prevalence of AF. The low prevalence of AF in the absence of clinical and subclinical cardiovascular disease calls into question the existence and clinical usefulness of the concept of so-called "lone atrial fibrillation" in the elderly.

There is debate about the value of assessing levels of C-reactive protein (CRP) and other biomarkers of inflammation for the prediction of first cardiovascular events.

To assess the association between first myocardial infarction and the use of antihypertensive agents.We conducted a population-based case-control study among enrollees of the Group Health Cooperative of Puget Sound (GHC).Cases were hypertensive patients who sustained a first fatal or nonfatal myocardial infarction from 1986 through 1993 among women and from 1989 through 1993 among men. Controls were a stratified random sample of hypertensive GHC enrollees, frequency matched to the cases on age, sex, and calendar year. All 623 cases and 2032 controls had pharmacologically treated hypertension. Data collection included a review of the ambulatory medical record a brief telephone interview of consenting survivors. Antihypertensive therapy was assessed using the GHC's computerized pharmacy database.The first analysis included only the 335 cases and 1395 controls initially free of cardiovascular disease. Compared with users of diuretics alone, the adjusted risk ratio of myocardial infarction was increased by about 60% among users of calcium channel blockers with or without diuretic (risk ratio = 1.62%; 95% confidence interval [Cl], 1.11 to 2.34; P = .01). The second analysis was restricted to 384 cases and 1108 controls who were taking either a calcium channel blocker or a beta-blocker. Among these subjects, the use of calcium channel blockers compared with beta-blockers was associated with about a 60% increase in the adjusted risk of myocardial infarction (risk ratio = 1.57; 95% Cl, 1.21 to 2.04; P < .001). While high doses of beta-blockers were associated with a decreased risk of myocardial infarction (trend P = .04), high doses of calcium channel blockers were associated with an increased risk (trend P < .01).In this study of hypertensive patients, the use of short-acting calcium channel blockers, especially in high doses, was associated with an increased risk of myocardial infarction. Ongoing large-scale clinical trials will assess the effect of various antihypertensive therapies, including calcium channel blockers, on several important cardiovascular end points. Until these results are available, the findings of this study support the current guidelines from the Joint National Committee on the Detection, Evaluation and Treatment of High Blood Pressure that recommend diuretics and beta-blockers as first-line agents unless contraindicated, unacceptable, or not tolerated.

Trait-associated genetic variants affect complex phenotypes primarily via regulatory mechanisms on the transcriptome. To investigate the genetics of gene expression, we performed cis- and trans-expression quantitative trait locus (eQTL) analyses using blood-derived expression from 31,684 individuals through the eQTLGen Consortium. We detected cis-eQTL for 88% of genes, and these were replicable in numerous tissues. Distal trans-eQTL (detected for 37% of 10,317 trait-associated variants tested) showed lower replication rates, partially due to low replication power and confounding by cell type composition. However, replication analyses in single-cell RNA-seq data prioritized intracellular trans-eQTL. Trans-eQTL exerted their effects via several mechanisms, primarily through regulation by transcription factors. Expression of 13% of the genes correlated with polygenic scores for 1,263 phenotypes, pinpointing potential drivers for those traits. In summary, this work represents a large eQTL resource, and its results serve as a starting point for in-depth interpretation of complex phenotypes. Analyses of expression profiles from whole blood of 31,684 individuals identify cis-expression quantitative trait loci (eQTL) effects for 88% of genes and trans-eQTL effects for 37% of trait-associated variants.

Abstract Markers of inflammation, such as C-reactive protein (CRP), are related to risk of cardiovascular disease (CVD) events in those with angina, but little is known about individuals without prevalent clinical CVD. We performed a prospective, nested case-control study in the Cardiovascular Health Study (CHS; 5201 healthy elderly men and women). Case subjects (n=146 men and women with incident CVD events including angina, myocardial infarction, and death) and control subjects (n=146) were matched on the basis of sex and the presence or absence of significant subclinical CVD at baseline (average follow-up, 2.4 years). In women but not men, the mean CRP level was higher for case subjects than for control subjects ( P ≤.05). In general, CRP was higher in those with subclinical disease. Most of the association of CRP with female case subjects versus control subjects was in the subgroup with subclinical disease: 3.33 versus 1.90 mg/L, P <.05, adjusted for age and time of follow-up. Case-control differences were greatest when the time between baseline and the CVD event was shortest. The strongest associations were with myocardial infarction, and there was an overall odds ratio for incident myocardial infarction for men and women with subclinical disease (upper quartile versus lower three quartiles) of 2.67 (confidence interval [CI]=1.04 to 6.81), with the relationship being stronger in women (4.50 [CI=0.97 to 20.8]) than in men (1.75 [CI=0.51 to 5.98]). We performed a similar study in the Rural Health Promotion Project, in which mean values of CRP were higher for female case subjects than for female control subjects, but no differences were apparent for men. Comparing the upper quintile with the lower four, the odds ratio for CVD case subjects was 2.7 (CI=1.10 to 6.60). In conclusion, CRP was associated with incident events in the elderly, especially in those with subclinical disease at baseline.