SZ
Shi Zhao
Author with expertise in Modeling the Dynamics of COVID-19 Pandemic
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
14
(71% Open Access)
Cited by:
3,989
h-index:
39
/
i10-index:
120
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Estimating the Unreported Number of Novel Coronavirus (2019-nCoV) Cases in China in the First Half of January 2020: A Data-Driven Modelling Analysis of the Early Outbreak

Shi Zhao et al.Feb 1, 2020
In December 2019, an outbreak of respiratory illness caused by a novel coronavirus (2019-nCoV) emerged in Wuhan, China and has swiftly spread to other parts of China and a number of foreign countries. The 2019-nCoV cases might have been under-reported roughly from 1 to 15 January 2020, and thus we estimated the number of unreported cases and the basic reproduction number, R0, of 2019-nCoV.We modelled the epidemic curve of 2019-nCoV cases, in mainland China from 1 December 2019 to 24 January 2020 through the exponential growth. The number of unreported cases was determined by the maximum likelihood estimation. We used the serial intervals (SI) of infection caused by two other well-known coronaviruses (CoV), Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) and Middle East Respiratory Syndrome (MERS) CoVs, as approximations of the unknown SI for 2019-nCoV to estimate R0.We confirmed that the initial growth phase followed an exponential growth pattern. The under-reporting was likely to have resulted in 469 (95% CI: 403-540) unreported cases from 1 to 15 January 2020. The reporting rate after 17 January 2020 was likely to have increased 21-fold (95% CI: 18-25) in comparison to the situation from 1 to 17 January 2020 on average. We estimated the R0 of 2019-nCoV at 2.56 (95% CI: 2.49-2.63).The under-reporting was likely to have occurred during the first half of January 2020 and should be considered in future investigation.
0

Diverse effects of a low dose supplement of lipidated curcumin in healthy middle aged people

Robert DiSilvestro et al.Sep 26, 2012
Curcumin extracts of turmeric are proposed to produce health benefits. To date, human intervention studies have focused mainly on people with existing health problems given high doses of poorly absorbed curcumin. The purpose of the current study was to check whether in healthy people, a low dose of a lipidated curcumin extract could alter wellness-related measures.The present study was conducted in healthy middle aged people (40-60 years old) with a low dose of curcumin (80 mg/day) in a lipidated form expected to have good absorption. Subjects were given either curcumin (N = 19) or placebo (N = 19) for 4 wk. Blood and saliva samples were taken before and after the 4 weeks and analyzed for a variety of blood and saliva measures relevant to health promotion.Curcumin, but not placebo, produced the following statistically significant changes: lowering of plasma triglyceride values, lowering of salivary amylase levels, raising of salivary radical scavenging capacities, raising of plasma catalase activities, lowering of plasma beta amyloid protein concentrations, lowering of plasma sICAM readings, increased plasma myeloperoxidase without increased c-reactive protein levels, increased plasma nitric oxide, and decreased plasma alanine amino transferase activities.Collectively, these results demonstrate that a low dose of a curcumin-lipid preparation can produce a variety of potentially health promoting effects in healthy middle aged people.
4

Characterization of the evolutionary dynamics of influenza A H3N2 hemagglutinin

Maggie Wang et al.Jun 17, 2020
Abstract Virus evolution drives the annual influenza epidemics in human population worldwide. However, it has been challenging to evaluate the mutation effect of the influenza virus on evading the population immunity. In this study, we introduce a novel statistical and computational approach to measure the dynamic molecular determinants underlying epidemics by the effective mutations (EMs), and account for the time of waning mutation advantage against herd immunity by the effective mutation periods (EMPs). Extensive analysis is performed on the genome and epidemiology data of 13-year worldwide H3N2 epidemics involving nine regions in four continents. We showed that the identified EM processed similar profile in geographically adjacent regions, while only 40% are common to Europe, North America, Asia and Oceania, indicating that the regional specific mutations also contributed significantly to the global H3N2 epidemics. The mutation dynamics calibrated that around 90% of the common EMs underlying global epidemics were originated from South East Asia, led by Thailand and India, and the rest were originated from North America. New Zealand was found to be the dominate sink region of H3N2 circulation, followed by UK. All regions might act as the intersection in the H3N2 transmission network. The proposed methodology provided a way to characterize key amino acids from the genetic epidemiology point of view. This approach is not restricted by the genomic region or type of the virus, and will find broad applications in identifying therapeutic targets for combating infectious diseases.
4
Citation6
0
Save
0

Outcomes and Hospital Service Use Among Patients With COPD in a Nurse- and Allied Health–Led Clinic

Kailu Wang et al.Jul 5, 2024
Importance Multidisciplinary disease management efforts enable the improvement in lung function among patients with chronic obstructive pulmonary disease (COPD), but there is little evidence of its association with risks of adverse health outcomes and health care service use. Objective To examine the association between the use of a nurse- and allied health–led primary care clinic for respiratory patients, namely the Nurse and Allied Health Clinic–Respiratory Care (NAHC-Respiratory), and their risks of mortality and morbidity and health care service use. Design, Setting, and Participants This territory-wide, population-based, propensity-matched, retrospective cohort study used data from the electronic health records of all patients who used public health care services in Hong Kong, China, from January 1, 2010, to December 31, 2019. All patients with COPD treated in public outpatient clinics between January 1, 2010, and December 31, 2014, were included. Patients who attended NAHC-Respiratory and usual care only were propensity score–matched at a 1:2 ratio. Data analyses were conducted between August 2023 and April 2024. Exposure Attendance at NAHC-Respiratory. Main Outcomes and Measures All-cause and cause-specific mortality, incidence of COPD complications, and use of emergency department and inpatient services until the end of 2019 were compared between the NAHC-Respiratory and usual care participants using Cox proportional hazard regression, Poisson regression, and log-link gamma regression models after matching. Results This study included 9048 eligible patients after matching, including 3093 in the exposure group (2814 [91.0%] men; mean [SD] age, 69.8 [9.5] years) and 5955 in the reference group (5431 [91.2%] men; mean [SD] age, 69.5 [11.7] years). Compared with patients in the usual care–only group (reference), patients in the exposure group had lower risks of all-cause mortality (hazard ratio [HR], 0.84; 95% CI, 0.78-0.90) as well as pneumonia-caused (HR, 0.85; 95% CI, 0.74-0.97), respiratory-caused (HR, 0.86; 95% CI, 0.77-0.96), and cardiovascular-caused (HR, 0.74; 95% CI, 0.59-0.93) mortality. Exposure was associated with reduced rates of emergency department visits (incidence rate ratio [IRR], 0.92; 95% CI, 0.86-0.98) and hospitalization through emergency department (IRR, 0.89; 95% CI, 0.83-0.95). Conclusions In this cohort study, the use of a nurse- and allied health–led clinic in primary care settings was associated with reduced risks of mortality and use of hospital services among patients with COPD. These findings emphasize the important role of health care workers other than physicians in disease management in the primary care setting. The NAHC-Respiratory model and service components can be used to help improve primary care programs to benefit more patients with COPD.
0
Citation1
0
Save
0

New estimates of the Zika virus epidemic attack rate in Northeastern Brazil from 2015 to 2016: A modelling analysis based on Guillain-Barre Syndrome (GBS) surveillance data

Daihai He et al.May 31, 2019
Background Between January 2015 and August 2016, two epidemic waves of Zika virus (ZIKV) disease swept the Northeastern region of Brazil. As a result, two waves of Guillain-Barre Syndrome (GBS), were observed concurrently. The mandatory reporting of ZIKV disease began region-wide in February 2016, and it is believed that ZIKV cases were significantly under-reported before that. The changing reporting rate has made it difficult to estimate the ZIKV infection attack rate, and studies in the literature vary widely from 17% to > 50%. The same applies for other key epidemiological parameters. In contrast, the diagnosis and reporting of GBS cases were reasonably reliable given the severity and easy recognition of the diseases symptoms. In this paper, we aim to estimate the real number of ZIKV cases (i.e., the infection attack rate), and their dynamics in time, by scaling up from GBS surveillance data in NE Brazil. Methodology A mathematical compartmental model is constructed that makes it possible to infer the true epidemic dynamics of ZIKV cases based on surveillance data of excess GBS cases. The model includes the possibility that asymptomatic ZIKV cases are infectious. The model is fitted to the GBS surveillance data and the key epidemiological parameters are inferred by using the plug-and-play likelihood-based estimation. We make use of regional weather data to determine possible climate-driven impacts on the reproductive number R0, and to infer the true ZIKV epidemic dynamics. Findings and Conclusions The GBS surveillance data can be used to study ZIKV epidemics and may be appropriate when ZIKV reporting rates are not well understood. The overall infection attack rate (IAR) of ZIKV is estimated to be 24.1% (95% CI: 17.1% - 29.3%) of the population. By examining various asymptomatic scenarios, the IAR is likely to be lower than 33% over the two ZIKV waves. The risk rate from symptomatic ZIKV infection to develop GBS was estimated as = 0.0061% (95% CI: 0.0050% - 0.0086%) which is signicantly less than current estimates. We found a positive association between local temperature and the basic reproduction number, R0. Our analysis revealed that asymp- tomatic infections affect the estimation of ZIKV epidemics and need to also be carefully considered in related modelling studies. According to the estimated effective reproduction number and population wide susceptibility, we comment that a ZIKV outbreak would be unlikely in NE Brazil in the near future.
Load More