Abstract Identifying biomedical and socioeconomic predictors of the number of deaths caused by COVID-19 can help the development of effective interventions. In this study, we used the hypothesis-driven regression approach to test the hypothesis that the mask wearing rate, along with age and obesity, can largely predict the cumulative number of deaths across countries. Our regression models explained 69% of the variation in the cumulative number of deaths per million (March to June 2020) among 22 countries, identifying the face mask wearing rate in March as an important predictor. The number of deaths per million predicted by our elastic net regression model showed high correlation (r = 0.86) with observed numbers. These findings emphasize the importance of face masks in preventing the ongoing pandemic of COVID-19. One Sentence Summary Face mask wearing rate in March is a strong predictor of the cumulative number of deaths per million caused by COVID-19 among 22 countries.

Abstract The metazoan 70-kDa heat shock protein (HSP70) family contains several members localized in different subcellular compartments. The cytosolic members have been classified into inducible HSP70s and constitutive heat shock cognates (HSC70s), but their distinction and evolutionary relationship remain unclear because of occasional reports of “constitutive HSP70s” and the lack of cross-phylum comparisons. Here we provide novel insights into the evolution of these important molecular chaperones. Phylogenetic analyses of ∼100 full-length HSP70s revealed an ancient duplication that gave rise to two lineages from which all metazoan cytosolic HSP70s descend. One lineage (A) contains a relatively small number of Lophotrochozoan and Ecdysozoan genes, none of which have been shown to be constitutively expressed (i.e., either inducible or unknown). The other lineage (B) included both inducible and constitutive genes from diverse phyla. Species-specific duplications are present in both lineages, and Lineage B contains well-supported phylum-specific clades for Rotifera, Nematoda, and Chordata. Some genes in Lineage B have likely independently acquired inducibility, which may explain the sporadic distribution of “HSP70” or “HSC70” in previous analyses. Consistent with the diversification history within each group, inducible members show lower purifying selection pressure compared to constitutive members. These results illustrate the evolutionary history of the HSP70 family, encouraging us to propose a new nomenclature: “HSP70 + subcellular localization + linage + copy number in the organism + inducible or constitutive, if known.” e.g., HSP70cA1i for cytosolic Lineage A, copy 1, inducible.

Abstract This study aimed to explore the reproductive histology and oocyte differentiation of the longnose seahorse Hippocampus trimaculatus (Leach, 1814) in captivity. Five mature healthy females were histologically observed. The reproductive systems of the five specimens exhibited similar morphological characteristics with a pair of saccular creamy white ovaries merging caudally into a single gonoduct. There were two germinal ridges lined with a layer of germinal epithelium (GE). The ovarian maturation of this species was considered asynchronous. The oogenic cells were classified into oogonia and oocytes at several developmental phases based on their size and characteristics. Oogonia were identified among the connective tissue in the middle area of the GE. The stromal compartment contained oocytes that were classified into four distinct phases: the primary growth (PG) phase having two steps (perinucleolar and oil droplets‐cortical alveolar steps) and the secondary growth (SG) phase with three oocyte types, including early SG oocytes, late SG oocytes, and fully grown oocytes. The atretic oocytes (AO) were observed in all stages of oogenesis. Postovulatory follicles were also seen among the ovarian connective tissue. The occurrence of postovulatory follicles suggested that the specimens analysed in this study were in the spawning period. This research provides new insights into the identification of the reproductive cycles and morphological characteristics of the ovary of H. trimaculatus .

ABSTRACT Metazoan 70 kDa heat shock protein (HSP70) genes have been classified into four lineages: cytosolic A (HSP70cA), cytosolic B (HSP70cB), endoplasmic reticulum (HSP70er), and mitochondria (HSP70m). Because previous studies have identified no HSP70cA genes in vertebrates, we hypothesized that this gene has lost on the evolutionary path to vertebrates. To test this hypothesis, the present study conducted a comprehensive database search followed by phylogenetic and synteny analyses. The HSP70cA gene was present in invertebrates and animals that belong to subphyla of Chordata, Cephalochordata (lancelets) and Tunicata (tunicates). However, the genomes of early vertebrates in the subphylum Craniata (lamprey, hagfish, elephant shark, and coelacanth) contained only HSP70cB genes, suggesting the loss of the HSP70cA gene in the early period of vertebrate evolution. Synteny analysis using available genomic resources indicated that the synteny around the HSP70 genes was generally conserved between tunicates, but it was largely different between tunicates and lamprey. These results suggest the presence of dynamic chromosomal rearrangement in early vertebrates, which possibly caused the loss of the HSP70cA gene in the vertebrate lineage.

Abstract The biodegradable polymer poly-β-hydroxybutyrate (PHB) is a promising carbon source for biological mitigation of nitrogen pollution, a significant problem in aquaculture that physical and chemical methods have not provided a comprehensive solution. Here we investigated the impact of PHB on the zero-water-change largemouth bass culture by 30- and 40-day experiments. PHB loaded into the filter circulation pump at 4 g L − 1 , optimum value determined by the first experiment, significantly reduced the levels of nitrate by 99.65%, nitrite by 95.96%, and total nitrogen by 85.22% compared to the control without PHB. PHB also significantly increased denitrifying bacteria (e.g., Proteobacteria and Fusobacteria) and expression of denitrification genes (e.g., nirK and nirS ) in the microbial community, improving growth and health parameters of largemouth bass. While the impact may vary in other culture systems, PHB thus demonstrated its remarkable utility in aquaculture, highlighting ecological assessment and application to larger aquaculture operations as future considerations.

Abstract Task-free functional connectivity in animal models provides an experimental framework to examine connectivity phenomena under controlled conditions and allows comparison with invasive or terminal procedures. To date, animal acquisitions are performed with varying protocols and analyses that hamper result comparison and integration. We introduce StandardRat , a consensus rat functional MRI acquisition protocol tested across 20 centers. To develop this protocol with optimized acquisition and processing parameters, we initially aggregated 65 functional imaging datasets acquired in rats from 46 centers. We developed a reproducible pipeline for the analysis of rat data acquired with diverse protocols and determined experimental and processing parameters associated with a more robust functional connectivity detection. We show that the standardized protocol enhances biologically plausible functional connectivity patterns, relative to pre-existing acquisitions. The protocol and processing pipeline described here are openly shared with the neuroimaging community to promote interoperability and cooperation towards tackling the most important challenges in neuroscience.

Seafood mislabeling is a widespread problem that have produced a growing distrust of seafood industry. In this study, we examined the prevalence of mislabeling in fish samples from regional markets in the greater Houston area and close-by coastal communities. A total of 63 fish fillet samples were purchased, labeled, and stored at -20˚C in individual packages until DNA extraction. DNA fragments of roughly 700 base pairs encoding cytochrome oxidase I (COI) were PCR-amplified from each DNA sample. With 99.6–100% nucleotide identity in the GenBank and BOLD databases, all samples were correctly identified at the species level. The scientific names identified by DNA barcoding were matched with legally acceptable market names using the US Food and Drug Administration (FDA) Seafood List. Out of the 63 samples examined, 13 samples (20.6%) were mislabeled. Moreover, 24 samples (38.1%) did not use the acceptable market names, indicating that the FDA policy is poorly implemented in seafood industry. The first DNA barcoding survey this area warranted the need of continuous monitoring and the dissemination of the regulation combined with taxonomic knowledge.

Abstract Seafood mislabeling is a widespread problem that have produced a growing distrust of seafood industry. In this study, we examined the prevalence of mislabeling in fish samples from regional markets in the greater Houston area and close-by coastal communities. A total of 63 fish fillet samples were purchased, labeled, and stored at -20°C in individual packages until DNA extraction. DNA fragments of roughly 700 base pairs encoding cytochrome oxidase I (COI) were PCR-amplified from each DNA sample. With 99.6–100% nucleotide identity in the GenBank and BOLD databases, all samples were correctly identified at the species level. The scientific names identified by DNA barcoding were matched with legally acceptable market names using the US Food and Drug Administration (FDA) Seafood List. Out of the 63 samples examined, 13 samples (20.6%) were mislabeled. Moreover, 24 samples (38.1%) did not use the acceptable market names, indicating that the FDA policy is poorly implemented in seafood industry. The first DNA barcoding survey this area warranted the need of continuous monitoring and the dissemination of the regulation combined with taxonomic knowledge.