KS
Keisuke Shirai
Author with expertise in Natural Killer Cells in Immunity
Achievements
Cited Author
Open Access Advocate
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
8
(63% Open Access)
Cited by:
1,516
h-index:
30
/
i10-index:
56
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Using Multiplexed Assays of Oncogenic Drivers in Lung Cancers to Select Targeted Drugs

Mark Kris et al.May 20, 2014

Importance

 Targeting oncogenic drivers (genomic alterations critical to cancer development and maintenance) has transformed the care of patients with lung adenocarcinomas. The Lung Cancer Mutation Consortium was formed to perform multiplexed assays testing adenocarcinomas of the lung for drivers in 10 genes to enable clinicians to select targeted treatments and enroll patients into clinical trials. 

Objectives

 To determine the frequency of oncogenic drivers in patients with lung adenocarcinomas and to use the data to select treatments targeting the identified driver(s) and measure survival. 

Design, Setting, and Participants

 From 2009 through 2012, 14 sites in the United States enrolled patients with metastatic lung adenocarcinomas and a performance status of 0 through 2 and tested their tumors for 10 drivers. Information was collected on patients, therapies, and survival. 

Interventions

 Tumors were tested for 10 oncogenic drivers, and results were used to select matched targeted therapies. 

Main Outcomes and Measures

 Determination of the frequency of oncogenic drivers, the proportion of patients treated with genotype-directed therapy, and survival. 

Results

 From 2009 through 2012, tumors from 1007 patients were tested for at least 1 gene and 733 for 10 genes (patients with full genotyping). An oncogenic driver was found in 466 of 733 patients (64%). Among these 733 tumors, 182 tumors (25%) had theKRASdriver; sensitizingEGFR, 122 (17%);ALKrearrangements, 57 (8%); otherEGFR, 29 (4%); 2 or more genes, 24 (3%);ERBB2(formerlyHER2), 19 (3%);BRAF, 16 (2%);PIK3CA, 6 (<1%);METamplification, 5 (<1%);NRAS, 5 (<1%);MEK1, 1 (<1%);AKT1, 0. Results were used to select a targeted therapy or trial in 275 of 1007 patients (28%). The median survival was 3.5 years (interquartile range [IQR], 1.96-7.70) for the 260 patients with an oncogenic driver and genotype-directed therapy compared with 2.4 years (IQR, 0.88-6.20) for the 318 patients with any oncogenic driver(s) who did not receive genotype-directed therapy (propensity score–adjusted hazard ratio, 0.69 [95% CI, 0.53-0.9],P = .006). 

Conclusions and Relevance

 Actionable drivers were detected in 64% of lung adenocarcinomas. Multiplexed testing aided physicians in selecting therapies. Although individuals with drivers receiving a matched targeted agent lived longer, randomized trials are required to determine if targeting therapy based on oncogenic drivers improves survival. 

Trial Registration

 clinicaltrials.gov Identifier:NCT01014286.
0
Citation1,516
0
Save
0

In-hospital outcomes and mortality of drug-induced pneumonitis and radiation pneumonitis in patients with thoracic cancer.

Yi Lee et al.Jun 1, 2024
12042 Background: Pneumonitis is one of the challenging adverse events in thoracic oncology patients undergoing cancer therapy. The cancer treatments, including targeted agents, systemic chemotherapy, immune-checkpoint inhibitors, and radiation therapy have recently advanced, however, the data on incidence of drug-induced and radiation pneumonitis (DP and RP) and their association with in-hospital outcomes is limited. Methods: Data from the National Inpatient Sample Database from 2016 to 2019 were analyzed. Adult patients with primary lung cancer were included and categorized into three groups: (1). Patients without pneumonitis, (2). Patients with DP, (3). Patients with RP. Outcomes included in-hospital mortality, intensive care unit (ICU) admission, and hospital length of stay (LOS). Data were extracted using ICD-10 codes. Results: Our analysis included 1,631,940 hospitalized primary lung cancer patients (based on a weighted sample). Among all, 4,515 patients had DP, and 16,905 patients had RP. Overall, 69.3% had smoking history, however, no significant difference between DP and RP. There was a higher prevalence of chronic obstructive pulmonary disease (COPD) in RP than DP (66.5% vs 53.2%; p<0.05) (Table). The in-hospital mortality rate was highest in DP compared to other groups. Coarsened exact matching method was used to balance covariates between non-pneumonitis and pneumonitis patients (DP and RP). Multivariate logistic regression showed that pneumonitis patients had higher odds of intubation (OR: 1.57; 95% CI: 1.24-1.99; p<0.05) and mortality (OR: 1.48; 95% CI: 1.28-1.71; p<0.05) than non-pneumonitis. Pneumonitis patients also had 23% longer length of stay than non-pneumonitis patients. We then compared the outcomes between DP and RP using the same matching algorithm, however, there was no significant difference in the outcomes between the two groups. Over the study years, the trend for DP significantly increased, whereas the RP trend was stable. Conclusions: Hospitalized pneumonitis patients had relatively poor clinical outcomes compared to patients without pneumonitis. The trend of hospitalized drug-induced pneumonitis is increasingly common. [Table: see text]
0

CD39 Is Expressed on Functional Effector and Tissue-resident Memory CD8+ T Cells

Shawn Musial et al.Jul 8, 2024
Abstract The ecto-ATPase CD39 is expressed on exhausted CD8+ T cells in chronic viral infection and has been proposed as a marker of tumor-specific CD8+ T cells in cancer, but the role of CD39 in an effector and memory T cell response has not been clearly defined. We report that CD39 is expressed on Ag-specific CD8+ short-lived effector cells, while it’s co-ectoenzyme, CD73, is found on memory precursor effector cells (MPECs) in vivo. Inhibition of CD39 enzymatic activity during in vitro T cell priming enhances MPEC differentiation in vivo after transfer and infection. The enriched MPEC phenotype is associated with enhanced tissue resident memory T cell (TRM cell) establishment in the brain and salivary gland following an acute intranasal viral infection, suggesting that CD39 ATPase activity plays a role in memory CD8+ T cell differentiation. We also show that CD39 is expressed on human and murine TRM cells across several nonlymphoid tissues and melanoma, whereas CD73 is expressed on both circulating and resident memory subsets in mice. In contrast to exhausted CD39+ T cells in chronic infection, CD39+ TRM cells are fully functional when stimulated ex vivo with cognate Ag, further expanding the identity of CD39 beyond a T cell exhaustion marker.