Abstract Background A year following the onset of the COVID-19 pandemic, new infections and deaths continue to increase in Europe. Serological studies, through providing evidence of past infection, can aid understanding of the population dynamics of SARS-CoV-2 infection. Objectives This systematic review of SARS-CoV-2 seroprevalence studies in Europe was undertaken to inform public health strategies including vaccination, that aim to accelerate population immunity. Methods We searched the databases Web of Science, MEDLINE, EMBASE, SCOPUS, Cochrane Database of Systematic Reviews and grey literature sources for studies reporting seroprevalence of SARS-CoV-2 antibodies in Europe published between 01/12/2019 - 30/09/20. We provide a narrative synthesis of included studies. Studies were categorized into subgroups including healthcare workers (HCWs), community, outbreaks, pregnancy and children/school. Due to heterogeneity in other subgroups, we only performed a random effects meta-analysis of the seroprevalence amongst HCWs stratified by their country. Results 109 studies were included spanning 17 European countries, that estimated the seroprevalence of SAR-CoV2 from samples obtained between November 2019 – August 2020. A total of 53/109 studies included HCWs with a reported seroprevalence among HCWs ranging from 0.7% to 45.3%, which did not differ significantly by country. In community studies significant heterogeneity was reported in the seroprevalence among different age groups and the majority of studies reported there was no significant difference by gender. Conclusion This review demonstrates a wide heterogeneity in reported seroprevalence of SARS-CoV-2 antibodies between populations. Continued evaluation of seroprevalence is required to understand the impact of public health measures and inform interventions including vaccination programmes.

Abstract Rotarix® vaccine was introduced into the Malawi national immunization program in October 2012. We analyzed data on children <5 years old hospitalized with acute gastroenteritis from January 2012 to June 2022, and compared to pre-vaccination data from 1997 to 2009. We estimated vaccine coverage before, during, and after the COVID-19 pandemic using data from rotavirus-negative children. We compared the observed weekly number of rotavirus-associated gastroenteritis (RVGE) cases by age to predictions from a previously developed mathematical model to estimate overall vaccine effectiveness. The number of RVGE and rotavirus-negative acute gastroenteritis cases declined substantially following vaccine introduction. Vaccine coverage among rotavirus-negative controls was >90% with two doses by July 2014, and declined to a low of ~80% in October 2020 before returning to pre-pandemic levels by July 2021. Our models captured the post-vaccination trends in RVGE incidence. Comparing observed RVGE cases to the model-predicted incidence without vaccination, overall effectiveness was estimated to be modest at 36.0% (95% prediction interval: 33.6%, 39.9%), peaking in 2014, and was highest in infants (52.5%; 95% prediction interval: 50.1%, 54.9%). Our mathematical models provide a validated platform for assessing strategies to improve rotavirus vaccine impact in low-income settings.

Malawi experienced its deadliest Vibrio cholerae (Vc) outbreak following devastating cyclones, with >58,000 cases and >1700 deaths reported between March 2022 and May 2023. Here, we use population genomics to investigate the attributes and origin of the Malawi 2022-2023 Vc outbreak isolates. Our results demonstrate the predominance of ST69 clone, also known as the seventh cholera pandemic El Tor (7PET) lineage, expressing O1 Ogawa (~ 80%) serotype followed by Inaba (~ 16%) and sporadic non-O1/non-7PET serogroups (~ 4%). Phylogenetic reconstruction revealed that the Malawi outbreak strains correspond to a recent importation from Asia into Africa (sublineage AFR15). These isolates harboured known antimicrobial resistance and virulence elements, notably the ICE

Abstract Objective To quantify changes in inequalities in uptake of childhood vaccination during a period of steadily declining overall childhood vaccination rates in England. Design Longitudinal study. Setting General practice data for five vaccines administered to children (first and second doses of the measles, mumps, and rubella vaccine (MMR1 and MMR2, respectively), rotavirus vaccine, pneumococcal conjugate vaccine (PCV) booster, and six-in-one (DTaP/IPV/Hib/HepB) vaccine covering diphtheria, tetanus, pertussis, polio, Haemophilus influenzae type b, and hepatitis B) from the Cover of Vaccination Uptake Evaluated Rapidly dataset in England. Participants Children aged <5 years eligible for vaccinations between April 2019 and March 2023 registered at primary care practices in England. 2 386 317 (2 309 674 for rotavirus vaccine) children included in the study were eligible at age 1 year, 2 456 020 at 2 years, and 2 689 304 at 5 years. Main outcome measures Changes in quarterly vaccine uptake over time and compared by deprivation level. Regression analyses were used to quantify the change in inequalities in vaccine uptake over time—expressed as changes in the slope index of inequality (SII). Cumulative susceptibility to measles and rotavirus disease at age 5 years was estimated. Analyses were repeated at regional level. Results The absolute inequality in vaccine uptake at baseline (2019-20) was largest for MMR2 in children at age 5 years (SII −9.6%, 95% confidence interval (CI) −10.2% to −9.0%). For all vaccinations studied, the SII for uptake increased over the study period: from −5.1% to −7.7% for the six-in-one vaccine, −7.4% to −10.2% for rotavirus, −7.9% to −9.7% for PCV booster, −8.0% to −10.0% for MMR1 at age 2 years, −3.1% to −5.6% for MMR1 at age 5 years, and −9.6% to −13.4% for MMR2 at age 5 years. The number of children susceptible to measles by the end of the study period increased 15-fold in the least deprived group (from 1364 to 20 958) and 20-fold in the most deprived group (from 1296 to 25 345). For rotavirus, a 14-fold increase was observed in the least deprived group (from 2292 to 32 981) and a 16-fold increase in the most deprived group (from 2815 to 45 201). Regional analysis showed greatest inequalities in uptake in London and the northern regions. Conclusion The findings of this study suggest that inequalities in childhood vaccination are increasing in England, as uptake rates for five key childhood vaccinations decreased between 2019 and 2023, below the World Health Organization’s recommended 95% uptake target, and with noticeable regional differences. Urgent action is needed to strengthen systems for childhood vaccination, with a key focus on reducing inequalities.

Background Gastrointestinal (GI) infections affect one in five people in the UK and local authorities play a crucial role in controlling these infections. However, there have been substantial reductions in funding for environmental and regulatory (ER) services that enable GI infectious disease prevention and control via food safety and infection control (FSIC) services. This study investigates how local funding cuts to these services have varied across England to understand the potential consequences of inequalities in GI infections. Methods We carried out a longitudinal observational ecological study, using a panel of annual data between 2009/2010 and 2020/2021. Analysis of ER service expenditure and FSIC service expenditure included 312 and 303 local authorities respectively. Generalised estimating equation models were used to estimate the annual per cent change of ER service expenditure between 2009/2010 and 2020/2021 in addition to FSIC expenditure change overall, and as a share of total ER expenditure. Models analysed trends by local authority structure, population density and deprivation level. Results ER services saw the largest cuts in unitary authorities, declining by 1.9%. London boroughs had the greatest reductions in FSIC expenditure, decreasing by 9.9%. Both ER and FSIC expenditure decreased with increasing population density. Areas of higher deprivation had the largest reduction in expenditure, with ER and FSIC cuts of 2.4% and 22.8%, respectively, compared with a 1.2% and 7.5% reduction in the least deprived areas. The share of ER expenditure spent on FSIC decreased by 13.4% in the most deprived authorities compared with 6.3% in the least deprived areas. Conclusion The unequal distribution of cuts shows the need for increased and equitable investment into these services to enable resilience to emerging infectious disease threats and to prevent the widening of health inequalities.

Pneumococcal disease in older adults in the United Kingdom is rising despite immunisation. A key gap in the literature is the clinical effectiveness of revaccination with the pneumococcal polysaccharide vaccine (PPV23). A cohort study was performed in England, using electronic medical records in the Clinical Practice Research Datalink. Individuals aged ≥64 years and vaccinated with PPV23 were included. Rates of hospitalised pneumonia (HP) and invasive pneumococcal disease (IPD) were compared between individuals receiving a single PPV23 dose versus those receiving two doses using multi-level Cox proportional hazards models. Propensity score weighting was performed to minimise the effect of confounding covariates across the comparison groups. Between 2006 and 2019, there were 462 505 eligible participants. Of those, 6747 (1·5 %) received revaccination. Two doses compared to one dose was associated with an increased risk of HP (adjusted Hazard Ratio [aHR] 1·95; 95 %CI 1·74–2·20) and IPD (aHR 1·44; 95 %CI 1·41–1·46). In participants aged 64–74 years PPV23 revaccination was associated with more IPD (aHR 2·02; 95 %CI 1·75–2·33) and HP (aHR 1·46; 95 %CI 1·42–1.49). In those aged ≥75 years PPV23 revaccination was associated with more HP (aHR 1·12; 95 %CI 1·08–1·16) with no statistically significant difference detected in risk of IPD (aHR 1·20; 95 %CI 0·94–1·52). No clear benefit of PPV23 revaccination was measured in older adults in this observational study. The small proportion of revaccinated subjects limits the strength of the conclusions. Further research evaluating the clinical effectiveness of PPV23 revaccination is required.

Objectives To evaluate the effectiveness of localised Tier 3 restrictions, implemented in England in December 2020, on reducing COVID-19 hospitalisations compared with less stringent Tier 2 measures and the variations by neighbourhood deprivation and the prevalence of Alpha (B.1.1.7) variant, the primary variant of concern then, to measure hospital services’ burden and inequalities across different communities. Design Observational study using a synthetic control method, comparing weekly hospitalisation rates in Tier 3 areas to a synthetic control from Tier 2 areas. Setting England between 4 October 2020 and 21 February 2021. Participants 23 million people under Tier 3 restrictions, compared with a synthetic control group derived from 29 million people under Tier 2 restrictions. Interventions Tier 3 restrictions in designated areas were implemented from 7 December 2020, imposing stricter limits on gatherings and hospitality than Tier 2, followed by a national lockdown on 6 January 2021. Primary and secondary outcome measures Weekly COVID-19-related hospitalisations for neighbourhoods in England over 11 weeks following the interventions. Results Implementing Tier 3 restrictions were associated with a 17% average reduction in hospitalisations compared with Tier 2 areas (95% CI 13% to 21%; 8158 (6286 to 9981) in total). The effects were similar across different levels of neighbourhood deprivation and prevalence of the Alpha variant. Conclusions Regionally targeted Tier 3 restrictions in England had a moderate but significant effect on reducing hospitalisations. The impact did not exacerbate socioeconomic inequalities during the pandemic. Our findings suggest that regionally targeted restrictions can be effective in managing infectious diseases.