Papillary renal-cell carcinoma, which accounts for 15 to 20% of renal-cell carcinomas, is a heterogeneous disease that consists of various types of renal cancer, including tumors with indolent, multifocal presentation and solitary tumors with an aggressive, highly lethal phenotype. Little is known about the genetic basis of sporadic papillary renal-cell carcinoma, and no effective forms of therapy for advanced disease exist.

We describe the landscape of somatic genomic alterations of 66 chromophobe renal cell carcinomas (ChRCCs) on the basis of multidimensional and comprehensive characterization, including mtDNA and whole-genome sequencing. The result is consistent that ChRCC originates from the distal nephron compared with other kidney cancers with more proximal origins. Combined mtDNA and gene expression analysis implicates changes in mitochondrial function as a component of the disease biology, while suggesting alternative roles for mtDNA mutations in cancers relying on oxidative phosphorylation. Genomic rearrangements lead to recurrent structural breakpoints within TERT promoter region, which correlates with highly elevated TERT expression and manifestation of kataegis, representing a mechanism of TERT upregulation in cancer distinct from previously observed amplifications and point mutations.

Renal cell carcinoma (RCC) is not a single disease, but several histologically defined cancers with different genetic drivers, clinical courses, and therapeutic responses. The current study evaluated 843 RCC from the three major histologic subtypes, including 488 clear cell RCC, 274 papillary RCC, and 81 chromophobe RCC. Comprehensive genomic and phenotypic analysis of the RCC subtypes reveals distinctive features of each subtype that provide the foundation for the development of subtype-specific therapeutic and management strategies for patients affected with these cancers. Somatic alteration of BAP1, PBRM1, and PTEN and altered metabolic pathways correlated with subtype-specific decreased survival, while CDKN2A alteration, increased DNA hypermethylation, and increases in the immune-related Th2 gene expression signature correlated with decreased survival within all major histologic subtypes. CIMP-RCC demonstrated an increased immune signature, and a uniform and distinct metabolic expression pattern identified a subset of metabolically divergent (MD) ChRCC that associated with extremely poor survival.

The NCCN Guidelines for Kidney Cancer provide multidisciplinary recommendations for the clinical management of patients with clear cell and non–clear cell renal carcinoma. These guidelines are developed by a multidisciplinary panel of leading experts from NCCN Member Institutions consisting of medical oncologists, hematologists and hematologic oncologists, radiation oncologists, urologists, and pathologists. The NCCN Guidelines are in continuous evolution and are updated annually or sometimes more often, if new high-quality clinical data become available in the interim.

Gleason scores from standard, 12-core prostate biopsies are upgraded historically in 25-33% of patients. Multiparametric prostate magnetic resonance imaging (MP-MRI) with ultrasound (US)-targeted fusion biopsy may better sample the true gland pathology.The rate of Gleason score upgrading from an MRI/US-fusion-guided prostate-biopsy platform is compared with a standard 12-core biopsy regimen alone.There were 582 subjects enrolled from August 2007 through August 2012 in a prospective trial comparing systematic, extended 12-core transrectal ultrasound biopsies to targeted MRI/US-fusion-guided prostate biopsies performed during the same biopsy session.The highest Gleason score from each biopsy method was compared.An MRI/US-fusion-guided platform with electromagnetic tracking was used for the performance of the fusion-guided biopsies.A diagnosis of prostate cancer (PCa) was made in 315 (54%) of the patients. Addition of targeted biopsy led to Gleason upgrading in 81 (32%) cases. Targeted biopsy detected 67% more Gleason ≥4+3 tumors than 12-core biopsy alone and missed 36% of Gleason ≤3+4 tumors, thus mitigating the detection of lower-grade disease. Conversely, 12-core biopsy led to upgrading in 67 (26%) cases over targeted biopsy alone but only detected 8% more Gleason ≥4+3 tumors. On multivariate analysis, MP-MRI suspicion was associated with Gleason score upgrading in the targeted lesions (p<0.001). The main limitation of this study was that definitive pathology from radical prostatectomy was not available.MRI/US-fusion-guided biopsy upgrades and detects PCa of higher Gleason score in 32% of patients compared with traditional 12-core biopsy alone. Targeted biopsy technique preferentially detects higher-grade PCa while missing lower-grade tumors.

The NCCN Guidelines for Kidney Cancer focus on the screening, diagnosis, staging, treatment, and management of renal cell carcinoma (RCC). Patients with relapsed or stage IV RCC typically undergo surgery and/or receive systemic therapy. Tumor histology and risk stratification of patients is important in therapy selection. The NCCN Guidelines for Kidney Cancer stratify treatment recommendations by histology; recommendations for first-line treatment of ccRCC are also stratified by risk group. To further guide management of advanced RCC, the NCCN Kidney Cancer Panel has categorized all systemic kidney cancer therapy regimens as “Preferred,” “Other Recommended Regimens,” or “Useful in Certain Circumstances.” This categorization provides guidance on treatment selection by considering the efficacy, safety, evidence, and other factors that play a role in treatment selection. These factors include pre-existing comorbidities, nature of the disease, and in some cases consideration of access to agents. This article summarizes surgical and systemic therapy recommendations for patients with relapsed or stage IV RCC.

Background The standard of care for patients with intermediate-to-high risk renal cell carcinoma is partial or radical nephrectomy followed by surveillance. We aimed to investigate use of nivolumab before nephrectomy followed by adjuvant nivolumab in patients with high-risk renal cell carcinoma to determine recurrence-free survival compared with surgery only. Methods In this open-label, randomised, phase 3 trial (PROSPER EA8143), patients were recruited from 183 community and academic sites across the USA and Canada. Eligible patients were aged 18 years or older with an Eastern Cooperative Oncology Group performance status of 0–1, with previously untreated clinical stage T2 or greater or Tany N+ renal cell carcinoma of clear cell or non-clear cell histology planned for partial or radical nephrectomy. Selected patients with oligometastatic disease, who were disease free at other disease sites within 12 weeks of surgery, were eligible for inclusion. We randomly assigned (1:1) patients using permuted blocks (block size of 4) within stratum (clinical TNM stage) to either nivolumab plus surgery, or surgery only followed by surveillance. In the nivolumab group, nivolumab 480 mg was administered before surgery, followed by nine adjuvant doses. The primary endpoint was investigator-reviewed recurrence-free survival in patients with renal cell carcinoma assessed in all randomly assigned patients regardless of histology. Safety was assessed in all randomly assigned patients who started the assigned protocol treatment. This trial is registered with ClinicalTrials.gov, NCT03055013, and is closed to accrual. Findings Between Feb 2, 2017, and June 2, 2021, 819 patients were randomly assigned to nivolumab plus surgery (404 [49%]) or surgery only (415 [51%]). 366 (91%) of 404 patients assigned to nivolumab plus surgery and 387 (93%) of 415 patients assigned to surgery only group started treatment. Median age was 61 years (IQR 53–69), 248 (30%) of 819 patients were female, 571 (70%) were male, 672 (88%) were White, and 77 (10%) were Hispanic or Latino. The Data and Safety Monitoring Committee stopped the trial at a planned interim analysis (March 25, 2022) because of futility. Median follow-up was 30·4 months (IQR 21·5–42·4) in the nivolumab group and 30·1 months (21·9–41·8) in the surgery only group. 381 (94%) of 404 patients in the nivolumab plus surgery group and 399 (96%) of 415 in the surgery only group had renal cell carcinoma and were included in the recurrence-free survival analysis. As of data cutoff (May 24, 2023), recurrence-free survival was not significantly different between nivolumab (125 [33%] of 381 had recurrence-free survival events) versus surgery only (133 [33%] of 399; hazard ratio 0·94 [95% CI 0·74–1·21]; one-sided p=0·32). The most common treatment-related grade 3–4 adverse events were elevated lipase (17 [5%] of 366 patients in the nivolumab plus surgery group vs none in the surgery only group), anaemia (seven [2%] vs nine [2%]), increased alanine aminotransferase (ten [3%] vs one [<1%]), abdominal pain (four [1%] vs six [2%]), and increased serum amylase (nine [2%] vs none). 177 (48%) patients in the nivolumab plus surgery group and 93 (24%) in the surgery only group had grade 3–5 adverse events due to any cause, the most common of which were anaemia (23 [6%] vs 19 [5%]), hypertension (27 [7%] vs nine [2%]), and elevated lipase (18 [5%] vs six [2%]). 48 (12%) of 404 patients in the nivolumab group and 40 (10%) of 415 in the surgery only group died, of which eight (2%) and three (1%), respectively, were determined to be treatment-related. Interpretation Perioperative nivolumab before nephrectomy followed by adjuvant nivolumab did not improve recurrence-free survival versus surgery only followed by surveillance in patients with high-risk renal cell carcinoma. Funding US National Institutes of Health National Cancer Institute and Bristol Myers Squibb.

Abstract The tricarboxylic citric acid cycle enzyme fumarate hydratase (FH) is a tumor suppressor. When lost in cells, its substrate fumarate accumulates to mM levels and drives oncogenic signaling and transformation. Germline alterations lead to an autosomal dominant condition known as hereditary leiomyomatosis and renal cell cancer (HLRCC) where patients are predisposed to various benign tumors and an aggressive form of kidney cancer. FH alterations of unclear significance are frequently observed with germline testing; thus, there is an unmet need to classify FH variants by their cancer-associated risk, allowing for screening, early diagnosis and treatment. Here we quantify catalytic efficiency of 74 FH variants of uncertain significance. Over half were enzymatically inactive which is strong evidence of pathogenicity. We generated a panel of HLRCC cell lines expressing FH variants with a range of catalytic activities, then correlated fumarate levels with metabolic features. We found that fumarate accumulation blocks purine biosynthesis, rendering FH-deficient cells reliant on purine salvage to maintain purine nucleotide pools. Genetic or pharmacologic inhibition of the purine salvage pathway reduced HLRCC tumor growth in vivo . Together, these findings suggest pathogenicity of many patient-associated FH variants and reveal purine salvage as a targetable vulnerability in FH-deficient tumors. Statement of Significance This study functionally characterizes patient-associated FH variants with unknown significance for pathogenicity. This study also reveals nucleotide salvage pathways as a targetable feature of FH-deficient cancers, which are shown to be sensitive to the purine salvage pathway inhibitor 6-mercaptopurine. This presents a new rapidly translatable treatment strategy for FH-deficient cancers.

Hereditary Leiomyomatosis and Renal Cell Cancer (HLRCC) is an inherited cancer syndrome associated with a highly aggressive form of type 2 papillary renal cell carcinoma (PRCC). Germ line inactivating alterations in Fumarate Hydratase (FH) cause HLRCC, and result in elevated levels of reactive oxygen species (ROS). Recent work indicates that FH -/- PRCC cells have increased ABL1 activation, which promotes tumor growth, but how ABL1 is activated remained unclear. Oxidation can regulate protein-tyrosine phosphatase (PTP) catalytic activity; conceivably, ROS-catalyzed inactivation of an ABL-directed PTP might account for ABL1 activation in this malignancy. Previously, our group developed q-oxPTPome, a method that can globally monitor the oxidation of classical PTPs. We have now refined the q-oxPTPome approach, increasing its sensitivity by >10X. Applying q-oxPTPome to FH-deficient cell models shows that multiple PTPs are either highly oxidized (including PTPN12) or overexpressed. In general, highly oxidized PTPs were those that have relatively high sensitivity to exogenous H2O2. Most PTP oxidation in FH-deficient cells is reversible, although nearly 40% of PTPN13 is oxidized irreversibly to the sulfonic acid state. Using substrate-trapping mutants, we mapped PTPs to their putative substrates, and found that only PTPN12 could target ABL1. Furthermore, knockdown experiments identify PTPN12 as the major ABL1 phosphatase in HLRCC. Overall, our results show that ROS-induced PTPN12 oxidation accounts for ABL1 phosphorylation in HLRCC-associated PRCC, reveal a novel mechanism for inactivating a tumor suppressor gene product, and establish a direct link between pathological PTP oxidation and neoplastic disease.

Abstract Background The PD-1 inhibitor pembrolizumab is approved as monotherapy for the adjuvant treatment of patients with renal cell carcinoma (RCC) who are at increased risk of recurrence following nephrectomy or nephrectomy and resection of metastatic lesions based on results from the phase 3 KEYNOTE-564 trial. Novel combination strategies could provide further clinical benefit in the adjuvant setting. V940 (mRNA-4157) is an individualized neoantigen therapy that is hypothesized to increase the antitumor activity of T cells and enhance the activity of pembrolizumab. V940 plus pembrolizumab showed improved clinical outcomes for stage III/IV melanoma compared with pembrolizumab alone in the phase 2b KEYNOTE-942 study. INTerpath-004 is a global, multicenter, randomized, double-blind, phase 2 trial (NCT06307431) designed to evaluate the efficacy and safety of adjuvant pembrolizumab with V940 or placebo in patients with RCC who have undergone nephrectomy. Methods Eligible patients are adults with histologically or cytologically confirmed RCC with clear cell or papillary histology (intermediate-high risk [pT2 Gr4, N0, M0 or pT3 Gr3/4, N0, M0], high-risk [pT4, N0, M0 or pT any stage, N1, M0], or M1 NED [solid, isolated, soft tissue metastases that can be completely resected at the time of nephrectomy or ≤2 years from nephrectomy]) with or without sarcomatoid features. Patients must have undergone nephrectomy and/or metastasectomy ≤12 weeks prior to randomization and be tumor-free as assessed by investigator. Patients must not have received prior systemic therapy ≤4 weeks or radiotherapy ≤2 weeks prior to randomization. Approximately 272 patients will be randomly assigned 1:1 to receive pembrolizumab 400 mg intravenously every 6 weeks for up to 9 cycles in combination with either V940 1 mg or placebo intramuscularly every 3 weeks for up to 9 doses or treatment discontinuation due to unacceptable toxicity, disease recurrence, patient withdrawal, or investigator decision. Randomization will be stratified by histology (clear cell vs papillary) and disease risk (intermediate-high vs high vs M1 NED). Imaging assessments (computed tomography or magnetic resonance imagery) will be performed every 12 weeks through year 2, every 16 weeks in years 3-5, and every 24 weeks in year 6 and beyond. The primary endpoint is disease-free survival by investigator assessment. Secondary endpoints include distant metastasis-free survival, overall survival, and safety parameters including adverse events (AEs), laboratory test results, and vital signs. AEs will be monitored throughout the study and for 30 days after the last dose of treatment (90 for serious AEs) and graded per National Cancer Institute Common Terminology Criteria for Adverse Events, version 5.0. Efficacy will be assessed in all randomly assigned patients, and safety will be assessed in all patients who received ≥1 dose of study intervention. Recruitment is ongoing.