PW
Philip Weinstein
Author with expertise in Diversity and Function of Gut Microbiome
Achievements
Open Access Advocate
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
9
(89% Open Access)
Cited by:
407
h-index:
64
/
i10-index:
318
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

The prevalence and practice management consequences of dental fear in a major US city

Peter Milgrom et al.May 1, 1988
Many practitioners do not realize how many current and potential patients have high dental fear. However, dentists do notice their characteristics—intervals between visits and chronic appointment cancellation. This article discusses the results of a major dental fear survey and the implications for practice. In 1986, 1,019 residents of Seattle were surveyed about their dental fears, dental experiences, and perceived oral health status. High dental fear in Seattle was found to affect 204 per 1,000 people. More than 66% acquired their fear in early childhood. Females were 1.8 times more likely than males to report high fear (P &spilt; .001). An individual was 1.6 times as likely to have high levels of dental fear if he or she had at least one oral problem such as bleeding gingiva (P = .004). Many practitioners do not realize how many current and potential patients have high dental fear. However, dentists do notice their characteristics—intervals between visits and chronic appointment cancellation. This article discusses the results of a major dental fear survey and the implications for practice. In 1986, 1,019 residents of Seattle were surveyed about their dental fears, dental experiences, and perceived oral health status. High dental fear in Seattle was found to affect 204 per 1,000 people. More than 66% acquired their fear in early childhood. Females were 1.8 times more likely than males to report high fear (P &spilt; .001). An individual was 1.6 times as likely to have high levels of dental fear if he or she had at least one oral problem such as bleeding gingiva (P = .004).
0
Paper
Citation399
0
Save
14

Vertical Stratification in Urban Green Space Aerobiomes

Jake Robinson et al.Jun 29, 2020
Abstract Exposure to a diverse environmental microbiome is thought to play an important role in ‘educating’ the immune system and facilitating competitive exclusion of pathogens to maintain human health. Vegetation and soil are known to be key sources of airborne microbiota––the aerobiome . Only a limited number of studies have attempted to characterise the dynamics of the aerobiome, and no studies to date have investigated these dynamics from a vertical perspective simulating human exposure. Studies of pollution and allergenic pollen show vertical stratification at various scales, and present an expectation that such vertical stratification may also be present in the aerobiome. Such stratification could have important implications for public health and for the design, engineering and management of urban green spaces. For example, do children receive the same exposure to airborne microbiota as taller adults, and what are the downstream implications for health? In this study, we combine an innovative columnar sampling method at soil level, 0.0, 0.5, 1.0, and 2.0 m together with high-throughput sequencing of the bacterial 16S rRNA gene to assess whether significant vertical stratification of the aerobiome occurred in a parkland habitat in Adelaide, South Australia. Our results provide evidence of vertical stratification in both alpha and beta (compositional) diversity of airborne bacterial communities, with diversity increasing roughly with height. We also found significant vertical stratification in known pathogenic and beneficial bacterial taxa, suggesting potentially different exposure attributes between adults and children. These results could have important implications for public health and urban planning, potentially informing ways to optimise the design and management of health-promoting urban green spaces.
14
Paper
Citation4
0
Save
1

Rare genera differentiate urban green space soil bacterial communities in three cities across the world

Jacob Mills et al.Feb 22, 2021
Abstract Vegetation complexity is potentially important for urban green space designs aimed at fostering microbial biodiversity to benefit human health. Exposure to urban microbial biodiversity may influence human health outcomes via immune training and regulation. In this context, improving human exposure to microbiota via biodiversity-centric urban green space designs is an underused opportunity. There is currently little knowledge on the association between vegetation complexity (i.e., diversity and structure) and soil microbiota of urban green spaces. Here, we investigated the association between vegetation complexity and soil bacteria in urban green spaces in Bournemouth, UK; Haikou, China; and the City of Playford, Australia by sequencing the 16S rRNA V4 gene region of soil samples and assessing bacterial diversity. We characterized these green spaces as having ‘low’ or ‘high’ vegetation complexity and explored whether these two broad categories contained similar bacterial community compositions and diversity around the world. Within cities, we observed significantly different alpha and beta diversities between vegetation complexities; however, these results varied between cities. Rare genera (< 1 % relative abundance individually, on average 35 % relative abundance when pooled) were most likely to be significantly different in sequence abundance between vegetation complexities and therefore explained much of the differences in microbial communities observed. Overall, general associations exist between soil bacterial communities and vegetation complexity, although these are not consistent between cities. Therefore, more in-depth work is required to be done locally to derive practical actions to assist the conservation and restoration of microbial communities in urban areas.
1
Paper
Citation1
0
Save
1

Expert-integrated automated machine learning uncovers hemodynamic predictors in spinal cord injury

Austin Chou et al.Sep 28, 2021
Abstract Automated machine learning (AutoML) is positioned to democratize artificial intelligence (AI) by reducing the amount of human input and ML expertise needed to create prediction models. However, successful translation of ML in biomedicine requires moving beyond optimizing only for prediction accuracy and towards discovering reproducible clinical and biological inferences. Here, we present a model-agnostic framework to reinforce AutoML using strategies and tools of explainable and reproducible AI, including novel metrics for performance precision and feature instability. The framework enables clinicians to interpret AutoML-generated models for clinical and biological verifiability and consequently integrate domain expertise during model development. We applied the framework towards spinal cord injury prognostication and identified a detrimental relationship between intraoperative hypertension and patient outcome. Furthermore, our analysis captured evolving clinical practices such as faster time-to-surgery and blood pressure management that affected clinical model validation. Altogether, we illustrate how augmenting AutoML for inferential reproducibility empowers biomedical discovery and builds trust in AI processes towards effective clinical integration.
7

Environmental DNA and wildlife camera traps uncover complimentary vertebrate visitation patterns at freshwater granite rock-holes

B. Hedges et al.Nov 3, 2024
Freshwater ecosystems are in decline globally. In Australia, threatening processes include invasive species, increasing drought frequency, climate change and changes to land use, all of which have been associated with declining vertebrate diversity, particularly in Australia's arid interior. Efficient monitoring tools are required to effectively monitor and conserve freshwater ecosystems and their associated vertebrate communities. Environmental DNA (eDNA) metabarcoding is one tool that shows promise for monitoring these systems, but knowledge of how eDNA data compares to more established ecological assessment techniques is limited. To address this knowledge gap, we sampled vertebrate eDNA from seven freshwater water bodies of proposed conservation importance in the Australian arid-lands, at three timepoints to measure visitation and compare our findings to camera trapping data at the same locations. Using eDNA we detected 19 species of vertebrates, including native species (such as macropods, wombats and emus) and invasive species (such as feral goats, cats and foxes). In contrast, camera traps detected 32 species, and was much more successful at detecting bird visitation than eDNA. These communities varied both spatially between rock-holes, and temporally, with summer collection periods being distinct from winter-spring. Our results demonstrate the success of eDNA metabarcoding as a tool for monitoring vertebrate visitation to arid-lands freshwater ecosystems that is complementary to more traditional survey methods such as wildlife camera trapping. Finally, we provide conservation recommendations for these vertebrate communities and discuss the efficacy of eDNA for monitoring freshwater resources in arid-lands environments.
7
3.5
5
Save
5

Environmental DNA reveals temporal and spatial variability of invertebrate communities in arid-lands ephemeral water bodies

B. Hedges et al.Nov 3, 2024
Context: Throughout semi-arid and arid Australia surface freshwater is rare, and where it does occur, it is often ephemeral. This is the case for freshwater granite rock-holes that occur throughout much of southern Australia. Rock-holes support freshwater invertebrate communities, however, the ongoing threat of climate change means that this ecosystem is likely to experience hydrological disruptions. Rock-holes are also likely to be heavily impacted by invasive vertebrates. However, the ecology of this ecosystem is poorly understood despite its relative ecological significance and the extent of its associated threats. Aims and methods: To provide a baseline ecological understanding of this ecosystem we documented species richness and variability at a series of rock-holes in the Gawler bioregion in South Australia using an environmental DNA approach. Key results: Metabarcoding recorded invertebrates from 22 orders and 45 families. Community composition varied among rock-holes and throughout the year, with a peak in species richness in winter. Conclusions and implications: These findings demonstrate the importance of these ecosystems to a range of endemic taxa. We propose establishment of monitoring programs, development of custom barcode reference libraries for the rock-hole ecosystem and future research into the likely impacts of climate change on the communities associated with them.
5
Paper
4.0
4
Save