BK
Baris Kanber
Author with expertise in Diagnosis and Pathogenesis of Multiple Sclerosis
Achievements
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
13
(15% Open Access)
Cited by:
340
h-index:
19
/
i10-index:
34
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Predicting Response of Colorectal Hepatic Metastasis: Value of Pretreatment Apparent Diffusion Coefficients

Dow‐Mu Koh et al.Mar 21, 2007
OBJECTIVE. The purposes of this study were to determine whether the pretreatment apparent diffusion coefficients (ADCs) of hepatic metastatic lesions from colorectal cancer are predictive of response to chemotherapy and to compare the ADCs of metastatic lesions before and after chemotherapy. SUBJECTS AND METHODS. Twenty patients with potentially operable hepatic lesions larger than 1 cm in diameter metastatic from colorectal carcinoma were prospectively evaluated with diffusion-weighted imaging at three b values before and after chemotherapy. Quantitative ADC maps were calculated with images with b values of 0, 150, and 500 s/mm2 (ADC0-500) and with images with b values of 150 and 500 s/mm2 (ADC150-500). Regions of interest were drawn around metastatic lesions and randomly over liver. The mean ADC0-500 and mean ADC150-500 of metastatic lesions before and after chemotherapy were compared according to response defined by Response Evaluation Criteria in Solid Tumors criteria. RESULTS. Twenty-five responding and 15 nonresponding metastatic lesions were evaluated. Nonresponding lesions had a significantly higher pretreatment mean ADC0-500 and mean ADC150-500 than did responding lesions (Mann-Whitney U test, p < 0.002). There was a linear regression relation (r2 = 0.34, p = 0.02) between percentage size reduction of metastatic lesions and pretreatment mean ADC150-500. After chemotherapy, responding lesions had a significant increase in mean ADC0-500 and ADC150-500 (Wilcoxon's signed rank, p = 0.025). No significant change was observed in nonresponding metastatic lesions (Wilcoxon's signed rank, p > 0.5) or in normal liver parenchyma (Wilcoxon's signed rank, p >0.4). CONCLUSION. High pretreatment mean ADC0-500 and mean ADC150-500 of colorectal hepatic metastatic lesions were predictive of poor response to chemotherapy. A significant increase in mean ADC0-500 and ADC150-500 was observed in metastatic lesions that responded to chemotherapy. These findings may have implications for development of individualized therapy.
0

Microscopic fractional anisotropy outperforms multiple sclerosis lesion assessment and clinical outcome associations over standard fractional anisotropy tensor

Francesc Vivó et al.Jun 1, 2024
We aimed to compare the ability of diffusion tensor imaging and multi-compartment spherical mean technique to detect focal tissue damage and in distinguishing between different connectivity patterns associated with varying clinical outcomes in multiple sclerosis (MS). Seventy-six people diagnosed with MS were scanned using a SIEMENS Prisma Fit 3T magnetic resonance imaging (MRI), employing both conventional (T1w and fluid-attenuated inversion recovery) and advanced diffusion MRI sequences from which fractional anisotropy (FA) and microscopic FA (μFA) maps were generated. Using automated fiber quantification (AFQ), we assessed diffusion profiles across multiple white matter (WM) pathways to measure the sensitivity of anisotropy diffusion metrics in detecting localized tissue damage. In parallel, we analyzed structural brain connectivity in a specific patient cohort to fully grasp its relationships with cognitive and physical clinical outcomes. This evaluation comprehensively considered different patient categories, including cognitively preserved (CP), mild cognitive deficits (MCD), and cognitively impaired (CI) for cognitive assessment, as well as groups distinguished by physical impact: those with mild disability (Expanded Disability Status Scale [EDSS] <=3) and those with moderate-severe disability (EDSS >3). In our initial objective, we employed Ridge regression to forecast the presence of focal MS lesions, comparing the performance of μFA and FA. μFA exhibited a stronger association with tissue damage and a higher predictive precision for focal MS lesions across the tracts, achieving an R-squared value of .57, significantly outperforming the R-squared value of .24 for FA (p-value <.001). In structural connectivity, μFA exhibited more pronounced differences than FA in response to alteration in both cognitive and physical clinical scores in terms of effect size and number of connections. Regarding cognitive groups, FA differences between CP and MCD groups were limited to 0.5% of connections, mainly around the thalamus, while μFA revealed changes in 2.5% of connections. In the CP and CI group comparison, which have noticeable cognitive differences, the disparity was 5.6% for FA values and 32.5% for μFA. Similarly, μFA outperformed FA in detecting WM changes between the MCD and CI groups, with 5% versus 0.3% of connections, respectively. When analyzing structural connectivity between physical disability groups, μFA still demonstrated superior performance over FA, disclosing a 2.1% difference in connectivity between regions closely associated with physical disability in MS. In contrast, FA spotted a few regions, comprising only 0.6% of total connections. In summary, μFA emerged as a more effective tool than FA in predicting MS lesions and identifying structural changes across patients with different degrees of cognitive and global disability, offering deeper insights into the complexities of MS-related impairments.
0

Evaluating multiple sclerosis severity loci 30 years after a clinically isolated syndrome

Nitin Sahi et al.Jan 1, 2024
The first genome-wide significant multiple sclerosis severity locus, rs10191329, has been pathologically linked to cortical lesion load and brain atrophy. However, observational cohorts such as MSBase have not replicated associations with disability outcomes, instead finding other loci. We evaluated rs10191329 and MSBase loci in a unique cohort of 53 people followed for 30 years after a clinically isolated syndrome, with deep clinical phenotyping and MRI measures of inflammation and neurodegeneration. After 30 years, 26 had developed relapsing-remitting multiple sclerosis, 15 secondary progressive multiple sclerosis and 12 remained diagnosed with a clinically isolated syndrome. Genetic associations with disease severity (age-related multiple sclerosis severity score and Expanded Disability Status Scale), disease course and brain MRI features (white matter lesions, cortical lesions and grey matter fraction) were investigated using regression models and survival analyses. rs10191329 was not associated with multiple sclerosis severity, secondary progressive multiple sclerosis diagnosis or brain MRI features at 30 years. Similarly, MSBase loci were not associated with 30-year disease severity, although rs73091975 was significantly associated with lower 14-year age-related multiple sclerosis severity score in those developing multiple sclerosis. Given that effect sizes for both rs10191329 and rs73091975 were greatest between 14 and 20 years, these findings suggest genetic effects on multiple sclerosis severity may interact non-linearly with disease duration.
0

Integration of myelin-sensitive biophysical features in virtual brain models: towards healthy and pathological Brain Digital Twins

Eleonora Lupi et al.Nov 26, 2024
Motivation: The Virtual Brain (TVB) is a neuroinformatic platform used to perform brain dynamic simulations integrating subject-specific imaging data. In standard TVB the input conduction velocity is fixed, making it insensitive to local effective measures of myelin content. Goal(s): Here we parameterized signal conduction velocity for TVB simulations. Approach: Considering myelin role in efficient neural conduction, myelin measures were integrated into TVB. Results: Making TVB sensitive to myelin content highlights variations in simulation outcomes with potential improvements in capturing spatiotemporal dynamics of brain activity. This advancement opens perspectives for realizing more accurate subject-specific simulations, representing a new step towards brain digital twinning. Impact: Brain Digital Twin technologies will transform personalized medicine, providing a better understanding of pathophysiological underpinnings of diseases. Our study demonstrates how simulating brain activity with The Virtual Brain model improves when integrating subject-specific neural conduction values, calculated from myelin measures.
Load More