Objectives: The purpose of this study was to report on the menarcheal age in girls of Greek origin and assess its potential associations with their demographic and perinatal data, as well as their maternal menarcheal age. Methods: In this case–control study, adolescent girls were recruited between September 2021 and September 2022 from two Pediatric Endocrinology Units, Aristotle University of Thessaloniki, Greece. Eligible participants included Greek girls up to the age of 18 years, with menarche and the absence of chronic disease or chronic medication use. Participants were divided into two groups, the early menarche group and the control group (menarche before or after 11 years of age, respectively). Data included participants’ maternal menarcheal age, their chronological age, place of residence, anthropometric data (at recruitment) and perinatal data (birth order, gestational age, type of delivery, birth weight/length). Results: A total of 100 girls aged 7–17 years (mean age ± SD 12.51 ± 2.59 years) were included in this study. The mean ± SD menarcheal age of the total sample was 11.47 ± 1.55 years (median 11.20 years; range 7.50–16.25 years); 43% had early menarche (median menarcheal age 10.50 years; range 7.50–10.91 years), and 57% had menarche after age 11 (median menarcheal age 12.08 years; range 11.00–16.25 years). The caesarean section rate was significantly (p < 0.001) higher in girls with early menarche (83.7%) than controls, whereas other variables did not differ significantly between groups. Conclusions: This Greek sample demonstrated a relatively young age at menarche with a significant proportion of girls with early menarche; in the latter group, the rate of caesarian sections was significantly higher than controls.

Adiposity can be measured using BMI (which is based on weight and height) as well as indices of abdominal adiposity. We examined the association between BMI and waist-to-height ratio (WHtR) within and across populations of different world regions and quantified how well these two metrics discriminate between people with and without hypertension.

Abstract SARS-CoV-2 is a coronavirus responsible for one of the most serious, modern worldwide pandemics, with lasting and multi-faceted effects. By late 2021, SARS-CoV-2 has infected more than 180 million people and has killed more than 3 million. The virus gains entrance to human cells through binding to ACE2 via its surface spike protein and causes a complex disease of the respiratory system, termed COVID-19. Vaccination efforts are being made to hinder the viral spread and therapeutics are currently under development. Towards this goal, scientific attention is shifting towards variants and SNPs that affect factors of the disease such as susceptibility and severity. This genomic grammar, tightly related to the dark part of our genome, can be explored through the use of modern methods such as natural language processing. We present a semantic analysis of SARS-CoV-2 related publications, which yielded a repertoire of SNPs, genes and disease ontologies. Population data from the 100Genomes Project were subsequently integrated into the pipeline. Data mining approaches of this scale have the potential to elucidate the complex interaction between COVID-19 pathogenesis and host genetic variation; the resulting knowledge can facilitate the management of high-risk groups and aid the efforts towards precision medicine.

Abstract Mental disorders are strongly connected with several psychiatric conditions including depression, bipolar disorder, schizophrenia, eating disorder and suicides. There are many biological conditions and pathways that define these complicated illnesses. For example, eating disorders are complex mental health conditions that require the intervention of geneticists, psychiatrists and medical experts in order to alleviate their symptoms. A patient with suicidal ideation should first be identified and consequently monitored by a similar team of specialists. Both genetics and epigenetics can shed light on eating disorders and suicides as they are found in the main core of such investigations. In the present study, an analysis has been performed on two specific members of the GPCR family towards drawing conclusions regarding their functionality and implementation in mental disorders. Specifically, evolutionary and structural studies on the adrenoceptor alpha 2b (ADRA2B) and the 5-hydroxytryptamine receptor 1A (HTR1A) have been carried out. Both receptors are classified in the biogenic amine receptors sub-cluster of the GPCRs and have been connected in many studies with mental diseases and malnutrition conditions. The major goal of this study is the investigation of conserved motifs among biogenic amine receptors that play an important role in this family signaling pathway, through an updated evolutionary analysis and the correlation of this information with the structural features of the HTR1A and ADRA2B. Furthermore, structural comparison of ADRA2B, HTR1A, and other members of GPCRs related with mental disorders is performed.

Abstract All living organisms have been programmed to maintain a complex inner equilibrium called homeostasis, despite numerous adversities during their lifespan. Any threatening or perceived as such stimuli for homeostasis is termed a stressor, and a highly conserved response system called the stress response system has been developed to cope with these stimuli and maintain or reinstate homeostasis. The glucocorticoid receptor, a transcription factor belonging to the nuclear receptors protein superfamily, has a major role in the stress response system, and research on its’ interactome may provide novel information regarding the mechanisms underlying homeostasis maintenance. A list of 149 autosomal genes which have an essential role in GR function or are prime examples of GRE-containing genes was composed in order to gain a comprehensive view of the GR interactome. A search for SNPs on those particular genes was conducted on a dataset of 3.554 Japanese individuals, with mentioned polymorphisms being annotated with relevant information from the ClinVar, LitVar, and dbSNP databases. Forty-two SNPs of interest and their genomic locations were identified. These SNPs have been associated with drug metabolism and neuropsychiatric, metabolic, and immune system disorders, while most of them were located in intronic regions. The frequencies of those SNPs were later compared with a dataset consisting of 1465 Korean individuals in order to find population-specific characteristics based on some of the identified SNPs of interest. The results highlighted that rs1043618 frequencies were different in the two populations, with mentioned polymorphism having a potential role in chronic obstructive pulmonary disease in response to environmental stressors. This SNP is located in the HSPA1A gene which codes for an essential GR co-chaperone, and such information showcases that similar gene may be novel genomic targets for managing or combatting stress-related pathologies.

Abstract Cognitive and behavioral disorders are subgroups of mental health disorders. Both cognitive and behavioral disorders can occur in people of different ages, genders, and social backgrounds and they can cause serious physical, mental or social problems. The risk factors for these diseases are numerous, with a range from genetic and epigenetic factors to physical factors. In most cases, the appearance of such a disorder in an individual is a combination of his genetic profile and environmental stimuli. To date, researchers have not been able to identify the specific causes of these disorders and as such, there is urgent need for innovative study approaches. The aim of the present study was to identify the genetic factors which seem to be more directly responsible for the occurrence of a cognitive and/or behavioral disorder. More specifically, through bioinformatics tools and software as well as analytical methods such as systemic data and text mining, semantic analysis, and scoring functions, we extracted the most relevant single nucleotide polymorphisms (SNPs) and genes connected to these disorders. All the extracted SNPs were filtered, annotated, classified, and evaluated in order to create the “genomic grammar” of these diseases. The identified SNPs guided the search for top suspected genetic factors, dopamine receptors D and Neurotrophic Factor BDNF, for which regulatory networks were built. The identification of the “genomic grammar” and underlying factors connected to cognitive and behavioral disorders can aid the successful disease profiling, the establishment of novel pharmacological targets and provide the basis for personalized medicine, which takes into account the patient’s genetic background as well as epigenetic factors.

Obesity in adolescence is emerging as a serious health problem since the rates of obese adolescents are rapidly increasing. In this important issue, the factors primarily responsible for obesity relate to the diet and physical fitness of young people, in addition to biochemical/genetic factors that contribute to the development of obesity. Incorrect dietary choices and, in general, the adoption of an unhealthy lifestyle start very early, with the family playing a pivotal role. The already high number of obese adolescents has a negative impact on their lives and society in general. One category of measures/interventions that could be taken to prevent childhood obesity is related to the family environment. Therefore, this thesis will study the existing literature in order to understand what obesity is, the factors that contribute to its occurrence and the ways in which the family can influence the behavior of adolescents and be a means of treating obesity (behavior, diet, physical activity, sleep, etc.). A review of the literature was conducted, using authoritative health databases (PubMed and Scopus), to identify published articles on family interventions that contribute to the treatment of adolescent obesity. The systematic review showed that the family holds considerable influence over its members, which, when dysfunctional, can lead to the acquisition of excess weight in its members. Intervention programs within the family environment showed a positive effect on weight loss in adolescents. The involvement of all the family members in these programs (parents and teenagers), not just teenagers, had even more positive results. Intervention programs targeting the family are able to change the daily habits of family members, resulting in adolescents acquiring healthy eating habits and increasing their physical activity, leading to the loss and/or maintenance of normal weight.

Abstract TANK binding kinase 1 protein (TBK1) is a kinase that belongs to the IκB (IKK) family. TBK1, also known as T2K, FTDALS4, NAK, IIAE8 and NF-κB, is responsible for the phosphorylation of the amino acid residues Serine and Threonine. This enzyme is involved in various key biological processes, including interferon activation and production, homeostasis, cell growth, autophagy, insulin production and the regulation of TNF-α, IFN-β and IL-6. Mutations in the TBK1 gene alter the protein’s normal function and may lead to an array of pathological conditions, including disorders of the Central Nervous System. The present study sought to elucidate the role of the TBK1 protein in Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS), a human neurodegenerative disorder. A broad evolutionary and phylogenetic analysis of TBK1 was performed across numerous organisms to distinguish conserved regions important for the protein’s function. Subsequently, mutations and SNPs were explored and their potential effect on the enzyme’s function was investigated. These analytical steps, in combination with the study of the secondary, tertiary, and quaternary structure of TBK1, enabled the identification of conserved motifs, which can function as novel pharmacological targets and inform therapeutic strategies for Amyotrophic Lateral Sclerosis.