MA
Md. Ashrafuzzaman
Author with expertise in Rice Water Management and Productivity Enhancement
Achievements
Cited Author
Key Stats
Upvotes received:
0
Publications:
7
(43% Open Access)
Cited by:
317
h-index:
13
/
i10-index:
19
Reputation
Biology
< 1%
Chemistry
< 1%
Economics
< 1%
Show more
How is this calculated?
Publications
0

Efficiency of plant growth-promoting rhizobacteria (PGPR) for the enhancement of rice growth

Md. Ashrafuzzaman et al.Apr 6, 2009
Plant growth-promoting rhizobacteria (PGPR) are beneficial bacteria that colonize plant roots and enhance plant growth by a wide variety of mechanisms. The use of PGPR is steadily increasing in agriculture and offers an attractive way to replace chemical fertilizers, pesticides, and supplements. Here, we have isolated and characterized the PGPR from the rhizosphere soil of rice field for the enhancement of growth of rice. Rhizosphere soils were collected from different areas of Mymensingh in Bangladesh. Ten isolates of bacteria, designated as PGB1, PGB2, PGB3, PGB4, PGB5, PGT1, PGT2, PGT3, PGG1 and PGG2, were successfully isolated and characterized. Subsequently, to investigate the effects of PGPR isolates on the growth of rice, a pot culture experiment was conducted. Prior to seeds grown in plastic pots, seeds were treated with PGPR isolates and seedlings were harvested after 21 days of inoculation. Isolates PGB4, PGT1, PGT2, PGT3, PGG1 and PGG2 induced the production of indole acetic acid (IAA), whereas only PGT3 isolate was able to solubilize phosphorus. Most of isolates resulted in a significant increase in plant height, root length, and dry matter production of shoot and root of rice seedlings. Furthermore, PGPR isolates remarkably increased seed germination of rice. Among the ten isolates, PGB4 and PGG2 were found almost equally better in all aspects such as dry matter production, plant height and root length of rice, and IAA production. Isolate PGT3 was also found to be promising in IAA production having an additional property of phosphate solubilization. The present study, therefore, suggests that the use of PGPR isolates PGB4, PGG2 and PGT3 as inoculant biofertilizers might be beneficial for rice cultivation as they enhanced growth of rice, and induced IAA production and phosphorus solubilization.
0
Citation312
0
Save
2

FUTURE-AI: International consensus guideline for trustworthy and deployable artificial intelligence in healthcare

Karim Lekadir et al.Jan 1, 2023
Despite major advances in artificial intelligence (AI) for medicine and healthcare, the deployment and adoption of AI technologies remain limited in real-world clinical practice. In recent years, concerns have been raised about the technical, clinical, ethical and legal risks associated with medical AI. To increase real world adoption, it is essential that medical AI tools are trusted and accepted by patients, clinicians, health organisations and authorities. This work describes the FUTURE-AI guideline as the first international consensus framework for guiding the development and deployment of trustworthy AI tools in healthcare. The FUTURE-AI consortium was founded in 2021 and currently comprises 118 inter-disciplinary experts from 51 countries representing all continents, including AI scientists, clinicians, ethicists, and social scientists. Over a two-year period, the consortium defined guiding principles and best practices for trustworthy AI through an iterative process comprising an in-depth literature review, a modified Delphi survey, and online consensus meetings. The FUTURE-AI framework was established based on 6 guiding principles for trustworthy AI in healthcare, i.e. Fairness, Universality, Traceability, Usability, Robustness and Explainability. Through consensus, a set of 28 best practices were defined, addressing technical, clinical, legal and socio-ethical dimensions. The recommendations cover the entire lifecycle of medical AI, from design, development and validation to regulation, deployment, and monitoring. FUTURE-AI is a risk-informed, assumption-free guideline which provides a structured approach for constructing medical AI tools that will be trusted, deployed and adopted in real-world practice. Researchers are encouraged to take the recommendations into account in proof-of-concept stages to facilitate future translation towards clinical practice of medical AI.
3

Identification, characterization of Apyrase (APY) gene family in rice (Oryza sativa) and analysis of the expression pattern under various stress conditions

Aniqua Chowdhury et al.Aug 15, 2022
Abstract Apyrase ( APY ) is a nucleoside triphosphate (NTP) diphosphohydrolase (NTPDase) which is a member of the superfamily of guanosine diphosphatase 1 (GDA1) - cluster of differentiation 39 (CD39) nucleoside phosphatase. Under various circumstances like stress, cell growth, the extracellular adenosine triphosphate (eATP) level increases, causing a detrimental influence on cells such as cell growth retardation, ROS production, NO burst, and apoptosis. Apyrase hydrolyses eATP accumulated in the extracellular membrane during stress, wounds, into adenosine diphosphate (ADP) and adenosine monophosphate (AMP) and regulates the stress- responsive pathway in plants. This study was designed for the identification, characterization, and for analysis of APY gene expression in Oryza sativa . This investigation discovered nine APY s in rice, including both endo- and ecto-apyrase. According to duplication event analysis, in the evolution of OsAPY s, a significant role is performed by segmental duplication. Their role in stress control, hormonal responsiveness, and the development of cells is supported by the corresponding cis-elements present in their promoter regions. According to expression profiling by RNA-seq data, the genes were expressed in various tissues. Upon exposure to a variety of biotic as well as abiotic stimuli, including anoxia, drought, submergence, alkali, heat, dehydration, salt, and cold, they showed a differential expression pattern. The expression analysis from the RT-qPCR data also showed expression under various abiotic stress conditions, comprising cold, salinity, cadmium, drought, submergence, and especially heat stress. This finding will pave the way for future in-vivo analysis, unveil the molecular mechanisms of APY genes in stress response, and contribute to the development of stress- tolerant rice varieties.
3
Citation1
0
Save
0

Evaluation of rice wild relatives as a source of traits for adaptation to iron toxicity and enhanced grain quality

Birgit Bierschenk et al.Sep 16, 2019
Rice wild relatives (RWR) constitute an extended gene pool that can be tapped for the breeding of novel rice varieties adapted to abiotic stresses such as iron (Fe) toxicity. Therefore, we screened 75 Oryza genotypes including 16 domesticated O. sativas , one O. glaberrima , and 58 RWR representing 21 species, for tolerance to Fe toxicity. Plants were grown in a semi-artificial greenhouse setup, in which they were exposed either to control conditions, an Fe shock during the vegetative growth stage (acute treatment), or to a continuous moderately high Fe level (chronic treatment). In both stress treatments, foliar Fe concentrations were characteristic of Fe toxicity, and plants developed foliar stress symptoms, which were more pronounced in the chronic Fe stress especially toward the end of the growing season. Among the genotypes that produced seeds, only the chronic stress treatment significantly reduced yields due to increases in spikelet sterility. Moreover, a moderate but non-significant increase in grain Fe concentrations, and a significant increase in grain Zn concentrations were seen in chronic stress. Both domesticated rice and RWR exhibited substantial genotypic variation in their responses to Fe toxicity. Although no RWR strikingly outperformed domesticated rice in Fe toxic conditions, some genotypes scored highly in individual traits. Two O. meridionalis accessions were best in avoiding foliar symptom formation in acute Fe stress, while an O. rufipogon accession produced the highest grain yields in both chronic and acute Fe stress. In conclusion, this study provides the basis for using interspecific crosses for adapting rice to Fe toxicity.
1

Morpho-physiobiochemical dissection reveals insight into salt-induced differential responses in genetically modified Solanum melongena L. (Bt Brinjal) varieties using an indigenous hydroponic system

Mahdi Hasan et al.May 24, 2023
Abstract Salinity is a major abiotic constraint of crop production in many countries, including Bangladesh, where a significant amount of cultivable areas are diversely affected by rising salt concentrations. Therefore, it is of paramount importance to figure out the possible solutions to cope with this abiotic stress. So, the development of tolerant genotypes of various crop species can be the best alternative to enhance crop production as well as to improve the livelihoods of poor marginal farmers. With this in mind, the impact of different NaCl levels (50 mM, 100 mM, and 150 mM) on four different Bt Brinjal (Bacillus thuringiensis) genotypes (BARI Bt Begun-1, BARI Bt Begun-2, BARI Bt Begun-3, and BARI Bt Begun-4) was evaluated using morpho-physicochemical analyses at growth, harvesting, and postharvest stages by establishing a new indigenous cost-effective hydroponic system. Our results show that excess salt (> 100 mM) has a detrimental effect on plant growth and development and most of the traits measured across different growth stages. Based on the different measured traits, BARI Bt Begun-1 and BARI Bt Begun-2 varieties outperformed in terms of better morpho-physiological, biochemical, photosynthetic, and antioxidant capacity under salt stress when compared to BARI Bt Begun-3 and BARI Bt Begun-4. Therefore, we conclude that BARI Bt Begun-1 and BARI Bt Begun-2 are moderately tolerant varieties, while BARI Bt Begun-3 and Begun-4 were susceptible varieties to salinity stress. The identified salt-responsive contrasting varieties can serve as valuable genetic materials in comparative genomics for breeding salt-tolerant Brinjal varieties and the newly established hydroponic system could be utilized in translational research programs.