Because biodiversity is increasingly threatened by habitat destruction and climate change, conservation agencies face challenges associated with an uncertain future. In addition to changes associated with climate and land use, parrots are threatened by hunting and capture for the pet trade, making them the most at-risk order of birds in the world. Parrots provide key ecosystem services, but remain understudied compared to other major bird orders despite their high extinction risk and ecological importance. Species richness is often used to identify high priority areas for conserving biodiversity. By definition, richness considers all species to be equally different. However, ongoing research emphasizes the importance of incorporating ecological functions (functional diversity) or evolutionary relationships (phylogenetic diversity) to more fully understand patterns of biodiversity, suggesting that using functional and phylogenetic information could improve conservation strategies. These distinctions among dimensions of biodiversity are important, because (1) areas of high species richness do not always represent areas of high functional or phylogenetic diversity, and (2) functional or phylogenetic diversity may better predict ecosystem function and evolutionary potential, which are essential for effective long-term conservation policy and management. Our objective was to create a framework for identifying areas of high species richness, functional diversity, and phylogenetic diversity within the global distribution of parrots We combined species richness, functional diversity, and phylogenetic diversity into an Integrated Biodiversity Index (IBI) to identify global biodiversity hotspots for parrots. We found important spatial mismatches among dimensions, which demonstrate that species richness is not always an effective proxy for other dimensions of parrot biodiversity. The IBI is an integrative and flexible index that can incorporate multiple dimensions of biodiversity, resulting in an intuitive and more direct way of assessing comprehensive goals in conservation planning (i.e., healthy ecosystem functioning and climate change resilience).

Aim: The incorporation of functional and phylogenetic information is necessary to comprehensively characterize spatial patterns of biodiversity and to evaluate the relative importance of ecological and evolutionary mechanisms in molding such patterns. We evaluated the relative importance of mechanisms that shape passerine biodiversity along an extensive elevational gradient. Location: Manu Biosphere Reserve in the Peruvian Andes. Taxon: Songbirds (order Passeriformes). Methods: We quantified elevational gradients of species richness, phylogenetic biodiversity, and functional biodiversity for all passerines as well as separately for suboscines and oscines; determined if phylogenetic or functional biodiversity was consistent with random selection or if there was evidence of particular mechanisms dominating community assembly; and compared patterns for each dimension of biodiversity for the two suborders. Results: For all passerines and for suboscines, species richness decreased in a saturating fashion, phylogenetic biodiversity declined linearly, and functional biodiversity was stochastic along the elevation gradient. For oscines, species richness and phylogenetic biodiversity decreased linearly, and functional biodiversity decreased in a saturating fashion. Main conclusions: Elevational gradients of biodiversity at Manu result from a combination of adaptations associated with radiations that occurred elsewhere (suboscines in Amazonian lowlands, oscines in colder climes of North America) and an in situ radiation in the Andes (tanagers). Our results suggest a combination of temperature-related physiological constraints and a reduction in functional redundancy associated with decreasing resource abundance at higher elevations molded the passerine assemblages along this elevational gradient. Explicit consideration of historical biogeography and conservatism of ancestral niches is necessary to comprehensively understand the mechanisms that mold gradients of biodiversity.

Microbiomes perform vital functions for their mammalian hosts, making them potential drivers of host evolution. Understanding effects of environmental factors and host characteristics on the composition and biodiversity of microbiomes may provide novel insights into the origin and maintenance of these symbiotic relationships. Our goals were to (1) characterize biodiversity of oral and rectal microbiomes of bats in Puerto Rico; and (2) determine the effects of geographic location and host characteristics on that biodiversity. We collected bats and their microbiomes from 3 sites, and used 4 metrics (species richness, Shannon diversity, Camargo evenness, Berger-Parker dominance) to characterize biodiversity. We evaluated the relative importance of site, host sex, host species identity, and host foraging guild on microbiome biodiversity. Microbiome biodiversity was highly variable among conspecifics. Geographical location exhibited consistent effects, whereas host sex did not do so. Within each host guild, host species exhibited consistent differences in oral and rectal microbiome biodiversity. Oral microbiome biodiversity was indistinguishable between guilds, whereas rectal microbiome biodiversity was significantly greater in carnivores than in herbivores. The high intraspecific and spatial variation in microbiome biodiversity necessitate a large number of samples to isolate the effects of environmental or host characteristics on microbiomes. Species-specific biodiversity of oral microbiomes suggests these communities are structured by direct interactions with the host immune system via epithelial receptors. In contrast, the number of microbial taxa that a host gut supports may be contingent on the number and kinds of functions a host requires of its microbiome.