A comparative analysis of the genomes of Drosophila melanogaster , Caenorhabditis elegans , and Saccharomyces cerevisiae —and the proteins they are predicted to encode—was undertaken in the context of cellular, developmental, and evolutionary processes. The nonredundant protein sets of flies and worms are similar in size and are only twice that of yeast, but different gene families are expanded in each genome, and the multidomain proteins and signaling pathways of the fly and worm are far more complex than those of yeast. The fly has orthologs to 177 of the 289 human disease genes examined and provides the foundation for rapid analysis of some of the basic processes involved in human disease.

We recently demonstrated that a variant allele of CYP3A5(CYP3A5*3) confers low CYP3A5 expression as a result of improper mRNA splicing. In this study, we further evaluated the regulation of CYP3A5 in liver and jejunal mucosa from white donors. For all tissues, high levels of CYP3A5 protein were strongly concordant with the presence of a wild-type allele of theCYP3A5 gene (CYP3A5*1).CYP3A5 represented greater than 50% of total CYP3A content in nearly all of the livers and jejuna that carried the CYP3A5*1wild-type allele. Overall, CYP3A5 protein content accounted for 31% of the variability in hepatic midazolam hydroxylation activity. Improperly spliced mRNA (SV1-CYP3A5) was found only in tissues containing a CYP3A5*3 allele. Properly splicedCYP3A5 mRNA (wt-CYP3A5) was detected in all tissues, but the median wt-CYP3A5 mRNA was 4-fold higher in CYP3A5*1/*3 livers compared withCYP3A5*3/*3 livers. Differences inwt-CYP3A5 and CYP3A4 mRNA content explained 53 and 51% of the interliver variability in CYP3A5 and CYP3A4 content, respectively. Hepatic CYP3A4 and CYP3A5 contents were not correlated when all livers were compared. However, forCYP3A5*1/*3 livers, levels of the two proteins were strongly correlated (r = 0.93) as werewt-CYP3A5 and CYP3A4 mRNA (r = 0.76). These findings suggest thatCYP3A4 and CYP3A5 genes share a common regulatory pathway for constitutive expression, possibly involving conserved elements in the 5′-flanking region.

Using machine learning techniques to predict brain age from multimodal data has become a crucial biomarker for assessing brain development. Among various types of brain imaging data, structural magnetic resonance imaging (sMRI) and diffusion magnetic resonance imaging (dMRI) are the most commonly used modalities. sMRI focuses on depicting macrostructural features of the brain, while dMRI reveals the orientation of major white matter fibers and changes in tissue microstructure. However, their differential capabilities in reflecting newborn age and clinical implications have not been systematically studied. This study aims to explore the impact of sMRI and dMRI on brain age prediction. Comparing predictions based on T2-weighted(T2w) and fractional anisotropy (FA) images, we found their mean absolute errors (MAE) in predicting infant age to be similar. Exploratory analysis revealed for T2w images, areas such as the cerebral cortex and ventricles contribute most significantly to age prediction, whereas FA images highlight the cerebral cortex and regions of the main white matter tracts. Despite both modalities focusing on the cerebral cortex, they exhibit significant region-wise differences, reflecting developmental disparities in macro- and microstructural aspects of the cortex. Additionally, we examined the effects of prematurity, gender, and hemispherical asymmetry of the brain on age prediction for both modalities. Results showed significant differences (p<0.05) in age prediction biases based on FA images across gender and hemispherical asymmetry, whereas no significant differences were observed with T2w images. This study underscores the differences between T2w and FA images in predicting infant brain age, offering new perspectives for studying infant brain development and aiding more effective assessment and tracking of infant development.

Summary Blockade or deletion of the pro-inflammatory P2X7 receptor channel has been shown to reduce tissue damage and symptoms in models of inflammatory bowel disease (IBD) and P2X7 receptors on enteric neurons were suggested to mediate neuronal death and associated motility changes. Here we used P2X7-specific antibodies and nanobodies as well as a BAC transgenic P2X7-EGFP reporter mouse model and P2rx7 −/− controls to perform a detailed analysis of cell type-specific P2X7 expression and possible overexpression effects in the enteric nervous system. In contrast to previous studies, we did not detect P2X7 in neurons but found dominant expression in glia and macrophages which closely interact with the neurons. P2X7 overexpression per se did not induce significant pathological effects. Our data indicate that macrophages and/or glia account for P2X7-mediated neuronal damage in IBD and provide a refined basis for the exploration of P2X7-based therapeutic strategies.

To learn more about gene editing and ALS, and to provide a comprehensive view of gene editing for further treatment of amyotrophic lateral sclerosis.