Abstract Microorganisms are essential in the decomposition of corpses and play a significant role in forensic science. However, previous studies have primarily focused on animal remains, specifically the gut, skin, and burial environment. Insufficient research has been conducted on the microbiota of human cadavers, especially in cases of advanced decomposition and additional tissues, resulting in a lack of relevant reference data. In this study, the microbiota of eight cadavers at different stages of decomposition were detected using 16S rRNA, metagenomic sequencing and 2bRAD-M sequencing. Nine different sites, including oral and nasal cavities, heart, liver, spleen, lung, kidney, muscle and gut, were analysed and the efficacy of these methods was evaluated. The results showed that 16S rRNA sequencing was the most cost-effective method for the study of cadavers in the early stages of decomposition, whereas for cadaveric tissues in the late stages of decomposition, 2bRAD-M could overcome host contamination more effectively than metagenomic sequencing. This paves the way for new opportunities in data retrieval and promotes in-depth investigations into the microbiota.

DNA mixture analysis poses a significant challenge in forensic genetics, particularly when dealing with degraded and trace amount DNA samples. Multi-SNPs (MNPs) are genetic markers similar to microhaplotypes but with smaller molecular sizes (< 75 bp), making them theoretically more suitable for analyzing degraded and trace amount samples. In this case report, we investigated a cold case involving a campstool stored for over a decade, aiming to detect and locate the suspect's DNA. We employed both conventional capillary electrophoresis-based short tandem repeat (CE-STR) analysis and next-generation sequencing-based multi-SNP (NGS-MNP) analysis. The typing results and deconvolution of the mixed CE-STR profiles were inconclusive regarding the presence of the suspect's DNA in the mixed samples. However, through NGS-MNP analysis and presence probability calculations, we determined that the suspect's DNA was present in the samples from Sect. 4−1 with a probability of 1-8.41 × 10− 6 (99.999159%). This evidence contradicted the suspect's statement and aided in resolving the case. Our findings demonstrate the significant potential of MNP analysis for examining degraded and trace amount DNA mixtures in forensic investigations.

To establish the identification method of tumor tissue origin based on commonly used STR typing kits.

Background/Objectives: Short tandem repeat (STR) loci are widely used in forensic genetics for identification and kinship analysis. Traditionally, these loci were selected to avoid medical associations, but recent studies suggest that loci such as TH01 and D16S539 may be linked to psychiatric conditions like schizophrenia. This study explores these potential associations and considers the privacy implications related to disease susceptibility. Methods: We analyzed 19 STR loci, including CODIS core loci and additional loci like Penta D and Penta E. Statistical analyses were conducted on a dataset of schizophrenia patients and matched control individuals to assess the relationship between STR polymorphisms and schizophrenia risk. Results: No significant associations were found between the 19 analyzed loci and schizophrenia in this dataset. While initial analyses revealed minor allele frequency differences at the D3S1358, D13S317, and TPOX loci between the schizophrenia and control groups, these differences did not retain statistical significance following Bonferroni correction (corrected p < 0.0026 for all loci). Conclusions: Although no significant associations were found between STR loci and schizophrenia, this study highlights the importance of considering the potential for forensic DNA data to reveal health-related information. As forensic DNA databases continue to expand, there is a growing need to reassess ethical and legal guidelines to ensure the protection of individual privacy. Future research should continue exploring these genetic associations with larger, more diverse samples to further understand their implications.

Abstract Physical performance in hemodialysis patients declines and serves as a cardiovascular disease (CVD) incidence and mortality predictor. However, lower extremity function's role remains unclear. This study aimed to quantify the association between lower extremity function and CVD risk in hemodialysis patients. This was a multicenter cross‐sectional study enrolling 868 participants (532 males, 336 females) from seven hemodialysis centers in Shanghai, China. Patients were divided into three groups per lower extremity function, evaluated by short physical performance battery (SPPB) scores: 0–6, 7–9, and 10–12. Upper extremity function was quantified through grip strength assessment. CVD risk was assessed using the Framingham Risk Score. Approximately 35% of hemodialysis patients had impaired lower extremity function (SPPB score < 10). Participants with high SPPB scores had stronger handgrip and lower Framingham CVD risk scores than those with low and moderate SPPB scores ( p < 0.05). After adjusting clinical confounders, SPPB was independently associated with CVD risk, as a categorized variable (odds ratio: 0.577, 95% confidence interval [CI]: 0.388–0.857, p = 0.006) and as a continuous variable (odds ratio: 0.858, 95% CI: 0.772–0.953, p = 0.004). An SPPB score < 10 predicted an increased CVD risk (area under curve: 0.649, 95% CI: 0.599–0.699, p < 0.001). Causality between physical performance and CVD risk was not considered. Some upper limb results may not be generalizable to peritoneal dialysis and kidney transplant patients. Lower extremity function was significantly associated with CVD risk in hemodialysis patients. Further studies are needed to explore the long‐term relationship between lower extremity function and CVD risk.

ABSTRACT The human skin and oral cavity harbor complex microbial communities, which exist in dynamic equilibrium with the host's physiological state and the external environment. This study investigates the microbial atlas of human skin and oral cavities using samples collected over a 10‐month period, aiming to assess how both internal and external factors influence the human microbiome. We examined bacterial community diversity and stability across various body sites, including palm and nasal skin, saliva, and oral epithelial cells, during environmental changes and a COVID‐19 pandemic. The skin microbiome was confirmed to display spatial and temporal stability compared to the oral microbiome, particularly the oral epithelium, which was susceptible to changes in the host's physiological state and immune response. Moreover, significant differences in the microbial community structure among the 4 sample types were observed, and 87 distinct bacteria biomarkers were identified. The random forest prediction model achieved an overall prediction accuracy of 95.24% across the four types of samples studied. Additionally, nasal skin samples showed significant promise for individual identification through profiling the skin microbiota. These findings highlight the potential of skin and oral microbiota as forensic markers for inferring body sites and identifying individuals. In summary, despite facing limitations such as a small cohort size and the need for broader validation, this research provides an overall perspective and initial insights for refining experimental designs and conducting in‐depth research in various microbial research fields.

Chronic kidney disease (CKD) has emerged as a significant public health concern. In this article, we investigated the mechanism of oat dietary fiber in regulating CKD. Our findings indicated that the gut microbiota of CKD patients promoted gut microbiota dysbiosis and kidney injury in CKD mice. Intervention with oat-resistant starch prepared by ultrasonic combined enzymatic hydrolysis (ORSU) and oat β-glucan with a molecular weight of 5 × 104 Da (OBGM) elevated the levels of short-chain fatty acids (SCFAs) and regulated gut dysbiosis in the gut-humanized CKD mice. ORSU and OBGM also reduced CKD-related uremic toxins such as creatinine, indoxyl sulfate (IS), and p-cresol sulfate (PCS) levels; reinforced the intestinal barrier function of the gut-humanized CKD mice; and mitigated renal inflammation and fibrosis via the NF-κB/TGF-β pathway. Therefore, ORSU and OBGM might delay the progression of CKD by modulating the gut microbiota to reduce uremic toxins levels. Our results explain the mechanism of oat dietary fiber aimed at mitigating CKD.

Mitochondrial DNA (mtDNA) has been extensively utilized in archeology, human evolutionary genetics, and forensic genetic for over three decades, primarily due to its maternal inheritance and relatively high mutation rate. The Chinese Han, the largest and most widely distributed ethnic group in China, have been the focus of numerous genetic studies. However, the forensic parameters and genetic structure of the Shandong Han, specifically in relation to the whole mitochondrial genome, remain undocumented.